通过生物信息学方法鉴定PTPRR和JAG1为去势抵抗性前列腺癌（CRPC）的关键基因（英文）

发布时间：2021-09-02 21:15

　　目的:鉴定去势抵抗性前列腺癌（CRPC）的关键基因。创新点:（1）结合多个数据库数据,运用生物信息学方法鉴定CRPC的关键基因;（2）首次报道PTPRR可能在CRPC里起关键作用。方法:通过下载三个GEO数据库的m RNA微阵列数据,分析CRPC和激素敏感前列腺癌之间的基因差异,对筛选出的差异基因进行功能富集分析和蛋白质间相互作用分析,最终筛选出两个有重要功能的差异基因（PTPRR和JAG1）。通过在多个其他数据库中进行表达量验证和生存分析,进一步证明这些基因的重要作用。结论:PTPRR和JAG1在CRPC中显著增高,并与预后差相关。因此,这两个基因有可能作为CRPC的诊断和预后的生物标志物。 

【文章来源】：Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2020,21(03)SCICSCD

【文章页数】：12 页

【文章目录】：
1 Introduction
2 Materials and methods
    2.1 Microarray data
    2.2 Identification of DEGs
    2.3 Functional enrichment analysis of the DEGs
    2.4 PPI network construction and analysis
    2.5 Expression validation and survival analysis of the key genes
3 Results
    3.1 DEG identification
    3.2 GO and KEGG pathway enrichment
    3.3 Construction of PPI network
    3.4 Identification of key gene signatures in CRPC and survival analysis
4 Discussion
5 Conclusions
Data availability
Contributors
Compliance with ethics guidelines
List of electronic supplementary materials
Identification of PTPRR and JAG1 as key genes in castration-resistant prostate cancer by integrated bioinformatics methods


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于TNFα处理的小鼠原代血管内皮细胞鉴定心血管疾病相关的NF-κB调控的基因和microRNA（英文）[J]. Hui ZHU,Yun LI,Mao-xian WANG,Ju-hong WANG,Wen-xin DU,Fei ZHOU.  Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2019(10)
[2]比较转录组学分析揭示阿霉素经p53信号通路诱导视网膜色素上皮细胞凋亡（英文）[J]. Yu-chen LIN,Ze-ren SHEN,Xiao-hui SONG,Xin LIU,Ke YAO.  Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2018(12)
[3]头颈部肿瘤转录组分析揭示与核糖体生物合成和表皮分化相关的关键长链非编码RNA（英文）[J]. Yu-zhu GUO,Hui-hui SUN,Xiang-ting WANG,Mei-ting WANG.  Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2018(09)
[4]神经轴突再生过程中微小RNA（miRNA）、转录因子和靶基因的网络功能分析（英文）[J]. Li-ning SU,Xiao-qing SONG,Zhan-xia XUE,Chen-qing ZHENG,Hai-feng YIN,Hui-ping WEI.  Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2018(04)



本文编号：3379747