探索姜黄二酮和月桂酸共同靶基因BDKRB2在前列腺癌中的治疗意义

发布时间：2021-09-03 15:34

　　目的基于月桂酸和姜黄二酮的抗肿瘤特性,发掘前列腺癌中新的靶向治疗基因。方法 BATMAN-TCM数据库预测2种化合物共同靶蛋白基因,metascape数据库对共同靶点进行功能富集分析确定关键基因,GEPIA数据库筛选研究靶点。对研究靶点进行生存分析、tdROC曲线分析以及GSEA分析。结果月桂酸和姜黄二酮两者共有24个靶蛋白基因,功能富集分析确定8个关键基因和前列腺癌相关,其中BDKRB2基因在肿瘤组织和正常组织之间差异表达。生存分析显示,BDKRB2低表达与患者不良预后相关。单基因GSEA提示,BDKRB2基因通过多种信号通路与前列腺癌发生发展相关。结论月桂酸和姜黄二酮可共同作用于BDKRB2基因,从而在前列腺癌中发挥治疗作用。 

【文章来源】：实用药物与临床. 2020,23(05)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

流程图

应用BATMAN-TCM数据库[6]预测月桂酸和姜黄二酮的靶蛋白基因。在预测靶蛋白基因的过程中,该数据库利用化合物的结构,确定各个官能团,再通过对靶蛋白结构中的各个官能团进行比对,确定化合物以及其对应靶蛋白之间的作用关系。图2中展示了月桂酸和姜黄二酮的2D和3D结构。在BATMAN-TCM的化合物分析模块中,依次输入月桂酸和姜黄二酮的英文名称,分别获取各自的靶向蛋白基因。然后对月桂酸和姜黄二酮的靶蛋白基因取交集,得到共同靶蛋白基因。1.2 在metascape中对共同靶蛋白基因进行功能富集分析

按照BATMAN-TCM网站的说明文件,将月桂酸和姜黄二酮的英文名依次输入到数据库中,发现月桂酸具有238个靶蛋白基因,姜黄二酮具有264个靶蛋白基因。在这两种化合物的靶蛋白基因中,有24个基因为两者的共同靶蛋白基因。见图3A。2.2 功能富集分析结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义[J]. 王庆哲,张恩崇,宋永胜.  实用药物与临床. 2020(01)
[2]前列腺癌发生发展的流行病学研究进展[J]. 杨进益,杨明州,魏伟,岳文昌.  临床泌尿外科杂志. 2017(09)



本文编号：3381378