膀胱癌预后的mRNA分子标记和预测模型开发

发布时间：2021-09-24 04:12

　　目的:通过TCGA数据库挖掘膀胱癌预后相关的mRNA分子标记,和构建膀胱癌患者预后的预测模型。方法:从TCGA数据库中下载膀胱癌患者的mRNA表达谱数据,进行预处理和分组后,先在训练数据中通过单因素Cox回归分析和基于似然的生存分析等方法鉴定与膀胱癌预后生存率显著相关的mRNA分子,然后通过多变量Cox回归分析建立基于mRNA分子表达谱的膀胱癌预后风险评分模型,最后通过ROC分析确定患者分类风险水平的最佳分界点,并通过Kaplan-Meier估计法和log-rank检验在验证数据集和全部数据集中分别验证预后风险评分模型。结果:开发了首个基于mRNA分子标记的膀胱癌预后风险评分模型,发现将基于7个mRNA分子标记的膀胱癌风险评分模型应用于训练集或验证数据时,高风险评分患者与低风险评分患者的生存曲线均存在显著差异,进一步的功能研究这发现这7个mRNA分子在肿瘤发生、进展和预后中可能发挥着重要作用。结论:7个mRNA分子标记包括ZNF432、TNFRSF14、POLR3G、ZNF574、LIPT1、AGER和ZRSR2,基于这7个mRNA表达谱构建的风险评分模型可作为新型生物标记用于膀胱癌患... 

【文章来源】：临床泌尿外科杂志. 2020,35(05)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

在训练集中的风险评分分析

在训练集中确定风险评分的最佳分界点

为了证实基于7个mRNA分子标记的风险评分模型,使用相同的公式,使用选定的最佳分界点,分别验证了全部数据集和测试集。首先将全部数据集的患者分为高风险(n=132)和低风险(n=209)两组。两组患者Kaplan-Meier曲线进一步说明低风险患者的生存时间比高风险患者明显延长(P<0.001),见图3A。基于最佳的分界点将测试集划分为高风险组63例,低风险组107例。尽管各组的样本量不平衡,但生存分析结果很相似,低风险患者的生存时间明显延长(P<0.003),见图3B。3 讨论

【参考文献】：
期刊论文
[1]分子标记物预测肌层浸润性膀胱癌疗效的研究进展[J]. 郭园园,刘贝贝,汪盛,刘建民,李庆文.  临床泌尿外科杂志. 2019(05)
[2]长链非编码RNA HNF1A-AS1在膀胱癌中的表达水平及其临床意义[J]. 龙武林,程帆.  临床泌尿外科杂志. 2019(03)
[3]上尿路尿路上皮癌预后多因素分析及术后再发膀胱癌危险因素分析[J]. 王庆伟,张涛,文建国,陶德赏,万听想,朱文.  临床泌尿外科杂志. 2018(05)
[4]膀胱癌新型基因和生物标记物研究进展[J]. 刘正升,陈磊,邢金春.  临床泌尿外科杂志. 2017(02)
[5]斑点型锌指结构蛋白在膀胱癌中的表达[J]. 马俊红,宋志强,李胜文.  中国医药. 2015 (07)
[6]膀胱癌中锌指结构转录因子1和E钙黏蛋白的表达及其相关性研究[J]. 王一,刘晓强,郭战军,梁博,李常颖,吴长利,刘雨,孙光.  中华泌尿外科杂志. 2015 (05)



本文编号：3407072