尿毒症患者外周血单个核细胞三维基因组学的初步研究
发布时间：2022-01-04 01:02
研究背景:慢性肾小球肾炎（chronic glomerulonephritis,CGN）的病人发病时间不固定,早期症状不明显。患者肾脏中肾小球持续缓慢累积损伤最终发展为尿毒症（Uremic）。三维基因组学（Three-Dimensional Genomics,3D Genomics）是在三维空间结构上对生物过程进行研究,如不同三维结构的基因组序列在基因转录,复制,修复和调控中发挥作用。外周血单个核细胞（Peripheral blood mononuclear cell,PBMC）含有非常多的免疫细胞,常用于人体免疫系统研究。肾小球肾炎患者免疫细胞和正常人免疫细胞存在基因表达差异,但是我们并不了解免疫细胞基因调控变化导致肾小球损伤的过程。为了探讨三维基因组学的变化差异和疾病的关联,我们对肾小球肾炎尿毒症期患者免疫细胞和正常人免疫细胞进行了Hi-C（High-throughput chromosome conformation capture,Hi-C）分析。目的:本研究利用高通量测序方法,以病人的外周血单核细胞作为研究对象,观察三维基因组学的变化。同时探讨外周血单个核细胞在尿毒症中的发病...
【文章来源】：广西师范大学广西壮族自治区
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
染色质的结构
技术路线图
U20:64.2ng/μL×10-3×50μL×20=64.2μg≥15μgNor20:65.4ng/μL×10-3×50μL×20=65.4μg≥15μg标准 Hi-C 要求 DNA 总量≥15μg 才可进行后续的 Hi-C 片段制备流程。结果显示样品如表 3-1，DNA 总量合格，两个样本都满足标准 Hi-C 建库要求。3.1.2 交联酶切产物检测用琼脂糖凝胶电泳（胶浓度 1%、电压 100V、时间 60min）交联酶切产物完整性检测，其结果如下图：1 U20 64.2 ±1 50 3.21 64.22 Nor20 65.4 ±1 50 3.4 65.4
【参考文献】：
期刊论文
[1]对尿毒症并发高磷血症患者进行血液透析联合血液灌流治疗的效果探析[J]. 胡敏,唐铭君. 当代医药论丛. 2019(14)
[2]细胞命运转化中的染色质重塑及其表观遗传调控机制[J]. 江赐忠,高绍荣. 生命科学. 2017(10)
[3]SWI/SNF染色质重塑复合物依赖的心脏发育及心脏病理性重构的表观遗传调控机制[J]. 李一飞,周开宇,华益民. 临床儿科杂志. 2016(04)
[4]核苷酸结合寡聚化结构域样受体热蛋白结构域亚家族成员3炎症小体的活化调节与牙周疾病的关系[J]. 吴冷,王骏,赵蕾,吴亚菲. 国际口腔医学杂志. 2015(06)
[5]尿毒症不同原发病合并顽固性高血压的疗效[J]. 张继波,熊有明,龚丽萍,林初媛,陈燕华,覃娜莎. 实用临床医学. 2015(04)
[6]尿毒症患者如何进行有效护理[J]. 周丽梅. 中国社区医师(医学专业). 2010(29)
[7]我国面临快速增长的终末期肾病治疗负担[J]. Li Zuo M.D.1 and Mei Wang M.D.2 for Chinese Society of Blood Purification Institute of Nephrology,Peking University First 1 Hospital Institute of Nephrology,Peking University People’s Hospital 2. 中国血液净化. 2010(01)
[8]国际与我国血液透析发展概况[J]. 陈再彬. 健康向导. 2009(03)
[9]BAR结构域蛋白质的功能[J]. 张伟,王建光. 生命的化学. 2004(05)
[10]拟南芥CBF4基因位点的单核苷酸多态性（SNP）变化与抗旱表型的相应性[J]. 郝岗平,吴忠义,陈茂盛,曹鸣庆,Dominique Brunnel,Georges Pelletier,黄丛林,杨清. 农业生物技术学报. 2004(02)
博士论文
[1]二代测序在胚胎植入前染色体疾病诊断中的临床应用[D]. 范俊梅.中国人民解放军医学院 2015
[2]染色体芯片分析技术应用于先天性心脏病分子诊断及发病机制研究[D]. 耿娟.上海交通大学 2014
[3]拟南芥组蛋白甲基转移酶SDG25和组蛋白分子伴侣NAP1的功能研究[D]. 高娟.复旦大学 2012
[4]染色质重塑与TonEBP依赖的基因转录调控[D]. 郭进军.重庆医科大学 2006
硕士论文
[1]CTCF结合与DNA甲基化对组蛋白修饰分布的影响[D]. 闫甜甜.内蒙古大学 2017
[2]基于细胞核分析的癌细胞图像特征提取与识别[D]. 赵国超.武汉理工大学 2013
本文编号：3567330
【文章来源】：广西师范大学广西壮族自治区
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
染色质的结构
技术路线图
U20:64.2ng/μL×10-3×50μL×20=64.2μg≥15μgNor20:65.4ng/μL×10-3×50μL×20=65.4μg≥15μg标准 Hi-C 要求 DNA 总量≥15μg 才可进行后续的 Hi-C 片段制备流程。结果显示样品如表 3-1，DNA 总量合格，两个样本都满足标准 Hi-C 建库要求。3.1.2 交联酶切产物检测用琼脂糖凝胶电泳（胶浓度 1%、电压 100V、时间 60min）交联酶切产物完整性检测，其结果如下图：1 U20 64.2 ±1 50 3.21 64.22 Nor20 65.4 ±1 50 3.4 65.4
【参考文献】：
期刊论文
[1]对尿毒症并发高磷血症患者进行血液透析联合血液灌流治疗的效果探析[J]. 胡敏,唐铭君. 当代医药论丛. 2019(14)
[2]细胞命运转化中的染色质重塑及其表观遗传调控机制[J]. 江赐忠,高绍荣. 生命科学. 2017(10)
[3]SWI/SNF染色质重塑复合物依赖的心脏发育及心脏病理性重构的表观遗传调控机制[J]. 李一飞,周开宇,华益民. 临床儿科杂志. 2016(04)
[4]核苷酸结合寡聚化结构域样受体热蛋白结构域亚家族成员3炎症小体的活化调节与牙周疾病的关系[J]. 吴冷,王骏,赵蕾,吴亚菲. 国际口腔医学杂志. 2015(06)
[5]尿毒症不同原发病合并顽固性高血压的疗效[J]. 张继波,熊有明,龚丽萍,林初媛,陈燕华,覃娜莎. 实用临床医学. 2015(04)
[6]尿毒症患者如何进行有效护理[J]. 周丽梅. 中国社区医师(医学专业). 2010(29)
[7]我国面临快速增长的终末期肾病治疗负担[J]. Li Zuo M.D.1 and Mei Wang M.D.2 for Chinese Society of Blood Purification Institute of Nephrology,Peking University First 1 Hospital Institute of Nephrology,Peking University People’s Hospital 2. 中国血液净化. 2010(01)
[8]国际与我国血液透析发展概况[J]. 陈再彬. 健康向导. 2009(03)
[9]BAR结构域蛋白质的功能[J]. 张伟,王建光. 生命的化学. 2004(05)
[10]拟南芥CBF4基因位点的单核苷酸多态性（SNP）变化与抗旱表型的相应性[J]. 郝岗平,吴忠义,陈茂盛,曹鸣庆,Dominique Brunnel,Georges Pelletier,黄丛林,杨清. 农业生物技术学报. 2004(02)
博士论文
[1]二代测序在胚胎植入前染色体疾病诊断中的临床应用[D]. 范俊梅.中国人民解放军医学院 2015
[2]染色体芯片分析技术应用于先天性心脏病分子诊断及发病机制研究[D]. 耿娟.上海交通大学 2014
[3]拟南芥组蛋白甲基转移酶SDG25和组蛋白分子伴侣NAP1的功能研究[D]. 高娟.复旦大学 2012
[4]染色质重塑与TonEBP依赖的基因转录调控[D]. 郭进军.重庆医科大学 2006
硕士论文
[1]CTCF结合与DNA甲基化对组蛋白修饰分布的影响[D]. 闫甜甜.内蒙古大学 2017
[2]基于细胞核分析的癌细胞图像特征提取与识别[D]. 赵国超.武汉理工大学 2013
本文编号：3567330
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