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11例肾移植术后合并隐球菌病患者的新生隐球菌菌株遗传多样性研究

发布时间:2022-01-26 23:14
  目的分析11例肾移植术后并发隐球菌病患者的新生隐球菌株的基因型分布等遗传多样性特征,为提高肾移植术后患者并发隐球菌病的诊治水平提供科学基础。方法采用国际人与动物真菌病学会(International Society for Human and Animal Mycology, ISHAM)推荐的多位点序列分型(multi locus sequence typing, MLST)方法对分离自我院9例及外院2例肾移植术后患者的11株新生隐球菌进行分子分型及系统发育分析,并与22株分离自免疫功能正常的隐球菌病患者的菌株进行群体多样性特征比较。结果本研究纳入的11株新生隐球菌均为VNⅠ基因型菌株(交配型均为MATα型),其中包含5种ST分子型,且以ST5型菌株为主(46%, 5/11)。系统发育分析结果与主成分分析(principal component analysis, PCA)结果均显示来自肾移植患者的ST5型菌株与来自免疫功能正常患者的ST5型菌株汇聚在一个类群。分离自肾移植术后隐球菌病患者的菌株群体(π=0.00150)的核酸多样性(π)高于分离自免疫功能正常患者的菌株群体(π=0.... 

【文章来源】:中国真菌学杂志. 2020,15(06)CSCD

【文章页数】:6 页

【部分图文】:

11例肾移植术后合并隐球菌病患者的新生隐球菌菌株遗传多样性研究


基于多位点序列构建的分离自肾移植术后患者致病新生隐球菌株的系统发育树(邻接法)

分布情况,患者,菌株,分布情况


国外研究提示隐球菌脑膜炎是肾移植患者术后并发侵袭性真菌感染之一[24],病死率可达49%[13-15]。肾移植手术是我国开展最广泛的实体器官移植手术,目前存活的术后患者人群数量巨大(>10万人)[12],是一个不容忽视的隐球菌病易感染人群[22]。2003年,Prasad等[23]在基于一项326例印度患者的单中心研究中报道肾移植术后发病隐球菌病的患者约占隐球菌病总患者数量的20%。值得注意的是,既往流行病学研究提示我国隐球菌病患者中大部分免疫功能正常(约70%)[9,25],国内相关临床诊治经验也主要来源于此。然而,不同宿主人群并发隐球菌病的致病菌种群的遗传多样性可能不同,且不同基因型的新生隐球菌株具有不同的毒力及药敏特征。因此,研究分离自肾移植术后隐球菌病患者致病菌的基因型分布等遗传多样性对于提高该人群隐球菌病的诊治水平具有重要意义。表2 本研究纳入菌株多态性位点、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数Tab.2 Number of polymorphic sites, nucleotide diversity and average number of nucleotide differences per sequence in this study 位点 肾移植患者 免疫功能正常患者 S π k S π k CAP59 0 0 0 0 0 0 GPD1 3 0.00174 0.945 6 0.00131 0.710 IGS1 10 0.00605 4.364 2 0.00026 0.182 LAC1 1 0.00108 0.509 6 0.00116 0.545 PLB1 1 0.00034 0.182 3 0.00067 0.355 SOD1 0 0 0 11 0.00187 1.000 URA5 0 0 0 8 0.00114 0.727 总和 15 0.00150 6.000 36 0.00088 3.519 S: 多态性位点;π: 核苷酸多样性;k: 平均核苷酸差异数.

【参考文献】:
期刊论文
[1]隐球菌性脑膜炎诊治专家共识[J]. 刘正印,王贵强,朱利平,吕晓菊,章强强,俞云松,周志慧,刘焱斌,蔡卫平,李若瑜,张文宏,张福杰,吴昊,徐英春,卢洪洲,李太生.  中华内科杂志. 2018 (05)
[2]免疫正常人群隐球菌性脑膜炎临床分析[J]. 刘加,方文捷,洪南,李娟,陈敏,潘炜华,廖万清.  中国真菌学杂志. 2016(02)
[3]北京昌平区鸽粪中新生隐球菌的分离鉴定及其血清型、配型分析[J]. 吴媛,赵桂英,李文革,卢金星.  中国人兽共患病学报. 2011(04)
[4]肾移植与隐球菌感染[J]. 范娟,朱元杰,温海.  中国真菌学杂志. 2007(01)



本文编号:3611299

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