小鼠肾脏缺血再灌注损伤中5hmC的动态变化及其与基因转录的关系

发布时间：2022-02-18 22:04

　　目的：DNA甲基化（5mC）和羟甲基化（5hmC）是表观遗传修饰的重要组成部分。已有研究报道了不同组织或器官内基因组5mC和5hmC含量存在差异,但对于不同组织内5mC或5hmC在全基因组的分布规律我们却知之甚少。因此,我们对小鼠不同器官基因组DNA中5mC和5hmC含量进行了验证,并对不同器官DNA甲基组和羟甲基组进行初步分析,观察并总结5mC和5hmC的全基因组分布规律。方法：摘取正常雄性C57小鼠不同器官,抽提基因组DNA。采用DNA点杂交方法检测5mC和5hmC在小鼠不同器官基因组中的含量变化,并利用DNA-特异性抗体免疫沉淀方法富集小鼠心脏,肝脏,肾脏,肺,脑皮质和小脑基因组中含5mC或5hmC的DNA片段,通过全基因组测序技术和生物信息学分析比较不同器官DNA甲基组和羟甲基组信息。结果：点杂交检测发现小鼠不同器官5hmC含量存在显著差异,与5mC含量无明显相关性。对六种小鼠器官基因组DNA5mC和5hmC的测序结果进一步印证了上述结论。分析5mC/5hmC在不同基因区域比例发现,5hmC多见于基因本体,5mC则大量分布于基因间区域。观察小鼠不同器官5mC或5hmC在基因本体... 

【文章来源】：复旦大学上海市211工程院校985工程院校教育部直属院校

【文章页数】：107 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
缩略语与符号
中文摘要
    第一部分
    第二部分
    第三部分
Abstract
    Part 1
    Part 2
    Part 3
前言
第一部分 5mC和5hmC在小鼠不同器官基因组DNA中的含量与分布规律
    引言
    材料和方法
    结果
    讨论
    结论
    参考文献
第二部分 缺血再灌注损伤引起小鼠肾脏基因组DNA中5hmC含量减少
    引言
    材料和方法
    结果
    讨论
    结论
    参考文献
第三部分 小鼠肾脏缺血再灌注中5mC,5hmC的全基因组范围分析
    引言
    材料和方法
    结果
    讨论
    结论
    参考文献
综述
    参考文献
后记
致谢



本文编号：3631632