基于生物信息学miR-221调控前列腺癌分子机制的研究

发布时间：2024-10-05 06:01

　　 目的:基于GEO数据库对miR-221调控前列腺癌差异基因进行分析,以期找到miR-221调控前列腺癌的重要靶点基因。方法:在GEO数据库里,获得miR-221调控前列腺癌差异基因表达的芯片GSE45627,用在线分析工具GEO2R进行数据分析,按照P <0. 01和差异倍数≥2进行筛选,将筛选得到的基因输入DAVID数据库进行基因和通路的富集分析,然后进行蛋白质互做分析。结果:共鉴定108个DEG。基因本体富集结果表明,DEG编码的功能分子主要位于细胞质、细胞核,分子功能主要涉及"双链RNA结合""螺旋酶活性""双链DNA结合""蛋白结合""单链RNA结合",与生物学过程有关,包括"调节Ⅰ型干扰素信号通路""病毒的防御反应""调控病毒遗传物质的复制""先天免疫反应"。KEGG信号通路分析主要涉及甲型H1N1流感信号通路、麻疹信号通路、丙型肝炎信号通路、RIG-I样受体信号通路、Toll样受体信号通路等。结论:生物信息分析的结果可以发现miR-221调控前列腺癌中有用的靶点和信号通路,但这些需要进一步的实验验证。

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 基因芯片数据
    1.2 识别DEG
    1.3 差异基因功能和通路富集分析
    1.4 PPI网络的建立和模块的分析
2 结果
    2.1 筛选基因结果
    2.2基因功能富集分析
    2.3 KEGG信号通路分析
    2.4 PPI网络和模块分析
3 讨论



本文编号：4007620