以LPAR3为中心的2型糖尿病相关基因功能富集及蛋白互作分析

发布时间：2017-10-17 07:27

  本文关键词：以LPAR3为中心的2型糖尿病相关基因功能富集及蛋白互作分析

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【摘要】：本研究目的是查找与2型糖尿病相关的潜在基因及其参与的生物过程、信号通路和蛋白互作网络。利用GEO数据库中GSE20966数据集,采用GENE-E平台,筛选出与LPAR3共表达的基因,结合生物信息学工具GOC、DAVID、COREMINE、Gene Mania对共表达基因进行基因功能富集分析、文本挖掘及蛋白互作分析。我们筛选出LPAR3在2型糖尿病患者胰腺β细胞中表达值显著低于正常对照组,其共表达基因603个,主要涉及代谢过程、信号调控等生物过程和Hippo信号通路。共表达相关系数高的8个基因与2型糖尿病相关,且均与肿瘤相关,涉及代谢过程、信号转导、发病机理、细胞增殖、细胞粘附等生物过程。LPAR3与20个已报道的2型糖尿病基因存在互作关系。本研究发现LPAR3及其共表达基因可能与2型糖尿病相关,并可能增加患者罹患各系统肿瘤的风险。
【作者单位】： 桂林医学院生物化学与分子生物学教研室;
【关键词】： LPAR 型糖尿病 生物信息学 数据库
【基金】：广西壮族自治区教育厅科学技术研究项目(YB2014269)资助
【分类号】：R587.1
【正文快照】： Gene Function Enrichment and Protein Interaction Analysis of LPAR3 andIts Related Genes in Type 2 DiabetesMo Zhijing Ma Yili Li Kangzhi Liu Yongming*Department of Biochemistry and Molecular Biology,Guilin Medical University,Guilin,541100*Corresponding au，

本文编号：1047551