METTL21C基因SNP和单倍型与男性峰值骨密度及体成分变异的核心家系关联分析

发布时间：2017-10-28 06:32

  本文关键词：METTL21C基因SNP和单倍型与男性峰值骨密度及体成分变异的核心家系关联分析

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【摘要】：目的:骨密度和体成分是复杂性状,内在互为联系。近期研究发现甲基转移酶-21C(methyltransferase-like 21C,METTL21C),又名C13orf39,位于13q33.1,有264个氨基酸,是7β链甲基转移酶超家族成员之一,能够催化甲基(CH3)从供体转移到热休克蛋白70(Hsp70)受体上。METTL21C主要表达于肌肉中,可以通过调节NF-κB信号通路来促进成肌细胞向肌管分化并调节肌肉内肌浆网钙离子的释放。它还可以减少糖皮质激素诱导的骨细胞的凋亡。因此,本研究主要探讨METTL21C基因单核苷酸多态性(SNP)和单倍型与上海地区男性峰值骨密度(peak BMD)和体成分的关系。方法:我们招募了400家上海市男性核心家系,其中包括400对父母和415个年龄在20-40岁的健康儿子,共1215人。根据国际人类基因组单倍型图计划(Hap Map)数据库,利用Haploview软件,设定连锁不平衡系数r20.8,最小等位基因频率MAF0.05,挑选METTL21C基因全部15个标签SNPs(rs641652、rs660207、rs9585961、rs7988265、rs896000、rs595825、rs9518810、rs7984675、rs654454、rs3858792、rs9514044、rs7981120、rs2390760、rs966724和rs599976),并应用im LDRTM多重SNP分型试剂盒对核心家系所有成员鉴定上述15个位点的基因型。应用双能X线吸收仪(DAX)检测腰椎、股骨颈和全髋部的p BMD,并检测全身脂肪含量(total fat mass,TFM)和瘦组织含量(total lean mass,TLM)等体成分。再运用SPSS和数量性状传递不平衡(QTDT)等方法进行数据分析。结果:应用ANCOVA分析发现rs9518810和rs7984675分别与股骨颈和全髋部BMD变异相关(p分别为0.005、0.032、0.035和0.035);rs7988265、rs2390760和rs599976与BMI变异相关(p分别为0.023、0.005和0.023);rs595825和rs654454与TLM变异相关(p=0.043,p=0.045)。QTDT家系内相关分析发现rs9585961与腰椎和股骨颈BMD变异相关(p=0.035,p=0.015);rs9518810与股骨颈BMD变异相关(p=0.028);rs660207与TFM变异相关(p=0.024);rs7981120与BMI变异相关(p=0.042);rs599976与BMI和TFM变异相关(p=0.012,p=0.022)。最后用1000 permutation结果显示仅有rs9585961与腰椎和股骨颈BMD变异相关(p=0.024,p=0.043);rs9518810与股骨颈BMD变异相关(p=0.029);rs599976与BMI、TFM和PFM变异相关(p分别为0.025、0.043和0.044)。利用Haploview和PHASE软件得出3个单倍型区域,ANCOVA分析结果为block2中单倍型CAA与全髋部BMD变异相关(p=0.039);CGG与股骨颈和全髋部BMD变异相关(p=0.008,p=0.031);block3中单倍型GCTG与BMI变异相关(p=0.029);而QTDT 1000 permutation结果为block1中单倍型AG和GA与TFM变异相关(p=0.009,0.047),block2中单倍型CAG与腰椎BMD变异相关(p=0.031)。结论:本研究首次分析了METTL21C基因SNP和单倍型与男性峰值骨密度和体成分的相关性。研究发现该基因SNP:rs660207、rs7981120和rs599976与BMI和TFM呈显著相关性,而rs9585961和rs9518810与BMD呈显著相关性,提示METTL21C基因常见位点的多态性对骨密度和体成分变异都具有调节作用。
【关键词】：the methyltransferase-like 21C(METTL21C)基因 单核苷酸多态性(SNP) 峰值骨密度 体成分 数量性状传递不平衡(QTDT)
【学位授予单位】：山西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R580
【目录】：

• 中文摘要5-7
• 英文摘要7-10
• 常用缩写词中英文对照表10-11
• 前言11-16
• 1 材料和方法16-29
• 1.1 技术路线16-17
• 1.2 男性核心家系的收集17
• 1.3 DNA的提取17-20
• 1.4 基因型检测（im LDRTM法）20-27
• 1.5 骨密度和体成分的测定27
• 1.6 统计学处理27-29
• 2 结果29-46
• 2.1 核心家系的一般情况29-31
• 2.2 男性核心家系中儿子METTL21C基因15个位点基因型和单倍型与峰值骨密度的关系31-38
• 2.3 男性核心家系中儿子METTL21C基因15个位点基因型和单倍型与体成分的相关性38-44
• 2.4 体成分与骨密度的关系44-46
• 3 讨论46-50
• 4 结论50-51
• 参考文献51-55
• 综述55-60
• 参考文献58-60
• 致谢60-61
• 在学期间研究成果61-62
• 个人简历62

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本文编号：1107068