多囊卵巢综合征患者血清特异性LncRNA表达谱研究
发布时间:2021-02-23 08:22
目的探讨多囊卵巢综合征(PCOS)患者血清特异性长链非编码核糖核酸(LncRNA)表达谱及下游mRNA通路。方法建立PCOS患者(PCOS组,50例)和健康人群(对照组,50例)队列,随机选取各3例,采用单色微阵列基因表达分析流程进行表达谱检测,并辅以热图分析、实时定量逆转录-聚合酶链反应(qRT-PCR)验证和下游mRNA的基因本体注释(GO)富集分析。结果PCOS患者血清中分别有351、217种显著上调和下调的LncRNA(符合变化系数≥2.0,P<0.05);进一步聚类分析发现,包含显著上调的11种LncRNA和显著下调的8种LncRNA的数据集可以成功区分PCOS患者和健康人群。qRT-PCR成功验证其中16种LncRNA具有相同显著变化。GO富集分析发现,这些LncRNA调控的mRNA功能范围包括细胞活化/生长/周期、基因及表观遗传学负调控等方面。结论 PCOS患者血清特异性LncRNA表达谱可为疾病的非侵入性诊断提供分子生物学标志物。
【文章来源】:浙江医学. 2020,42(08)
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
差异表达Lnc RNA所预测靶基因的GO富集分析(a:显著上调Lnc RNA所预测的下游m RNA;b:显著下调的Lnc RNA所预测的下游m RNA)
综上所述,本研究系统阐述了PCOS患者血清特异性LncRNA表达谱,并对热图分析产生的差异LncRNA进行q RT-PCR验证,进一步对预测的下游m RNA进行生物信息学分析,通过GO富集分析找到若干关键基因功能,为PCOS非侵入性诊断提供分子生物学标志物。但本研究也存在一些不足:(1)PCOS患者血清LncRNA表达谱测定的样本数偏少,虽经qRT-PCR验证,但仍可能会发生较大偏倚,无法充分反映目标人群情况;(2)笔者预测了差异表达程度最高的20个LncRNA的下游mRNA,但仍需要进一步q RT-PCR验证,同时扩大验证进行预测下游m RNA的LncRNA范围;(3)仅采用GO富集分析LncRNA下游mRNA的生物信息学功能,后续可针对其KEGG通路作进一步分析。
【参考文献】:
期刊论文
[1]胆固醇侧链裂解酶CYP11A1基因多态性与多囊卵巢综合征发病的相关性[J]. 高贵花,曹云霞,易龙,魏兆莲,徐玉萍,杨驰. 中华妇产科杂志. 2010 (03)
[2]环境因素与多囊卵巢综合征发病的相关性分析[J]. 黄卫娟,刘嘉茵,李丽娜. 中华妇产科杂志. 2007(05)
本文编号:3047293
【文章来源】:浙江医学. 2020,42(08)
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
差异表达Lnc RNA所预测靶基因的GO富集分析(a:显著上调Lnc RNA所预测的下游m RNA;b:显著下调的Lnc RNA所预测的下游m RNA)
综上所述,本研究系统阐述了PCOS患者血清特异性LncRNA表达谱,并对热图分析产生的差异LncRNA进行q RT-PCR验证,进一步对预测的下游m RNA进行生物信息学分析,通过GO富集分析找到若干关键基因功能,为PCOS非侵入性诊断提供分子生物学标志物。但本研究也存在一些不足:(1)PCOS患者血清LncRNA表达谱测定的样本数偏少,虽经qRT-PCR验证,但仍可能会发生较大偏倚,无法充分反映目标人群情况;(2)笔者预测了差异表达程度最高的20个LncRNA的下游mRNA,但仍需要进一步q RT-PCR验证,同时扩大验证进行预测下游m RNA的LncRNA范围;(3)仅采用GO富集分析LncRNA下游mRNA的生物信息学功能,后续可针对其KEGG通路作进一步分析。
【参考文献】:
期刊论文
[1]胆固醇侧链裂解酶CYP11A1基因多态性与多囊卵巢综合征发病的相关性[J]. 高贵花,曹云霞,易龙,魏兆莲,徐玉萍,杨驰. 中华妇产科杂志. 2010 (03)
[2]环境因素与多囊卵巢综合征发病的相关性分析[J]. 黄卫娟,刘嘉茵,李丽娜. 中华妇产科杂志. 2007(05)
本文编号:3047293
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/nfm/3047293.html
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