PRDM16基因多态性及启动子甲基化与超重肥胖的关系
发布时间：2017-04-20 14:04
本文关键词：PRDM16基因多态性及启动子甲基化与超重肥胖的关系，由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】：2010年我国慢性病调查报告显示成年人超重率达30.6%,肥胖率达12.0%,肥胖已成为最常见的慢性代谢性疾病之一。肥胖是高血压、糖尿病、冠心病及某些恶性肿瘤的主要危险因素,是重大公共卫生问题之一。近年来研究发现PRDM16(positive regulatory domain containing 16,PRDM16)基因可通过调节棕色脂肪组织的分化来影响机体能量代谢,具有潜在对抗肥胖发生的作用。表观遗传学变化同样可导致遗传表型的改变,PRDM16基因启动子序列甲基化水平与肥胖发生密切相关。目的通过分析PRDM16基因多态性及启动子甲基化水平与超重肥胖之间的关系,从经典遗传学和表观遗传学两方面探讨超重肥胖发生的可能机制。方法⑴基因多态性研究:于2011年开展现场调查,采用整群抽样在河南省洛阳市某县随机抽取5个村组,共调查583人,排除三代以内亲缘关系后获得528人。根据BMI将研究对象分为超重肥胖者(BMI≥24kg/m2)和体重正常者(18.5kg/m2≤BMI24kg/m2)。PRDM16基因rs2651899、rs2282198、rs870171基因分型采用LDR法;rs2236518基因分型采用snapshot法。⑵启动子甲基化研究:以医院为基础采集病例组与对照组样本116人。病例组为BMI≥24kg/m2超重肥胖者,对照组为18.5kg/m2≤BMI㩳24kg/m2的正常体重者。采用质谱法甲基化检测方法检测PRDM16基因启动子区域甲基化水平。本次研究数据的录入分析采用IBM SPSS 21.0统计软件。PRDM16基因各位点的哈温平衡采用χ2检验,基因型和等位基因频率在不同体重组别中的分布差异采用列联表χ2检验,单倍体型分析通过SHEsis在线软件进行。两组各Cp G位点甲基化水平比较采用t检验。各Cp G位点甲基化水平与BMI做多重线性回归分析。统计分析过程均为双侧检验,检验水准α为0.05。结果⑴PRDM16基因rs2651899位点等位基因G在超重肥胖组和正常体重组的分布差异具有统计学意义(OR(95%CI)=0.765(0.599~0.979),P=0.033)。⑵单倍体型ACAA、ACCA、ATCA、GTAA、GCCA、GCCC在超重肥胖组和正常体重组的分布差异具有统计学意义(ACAA:OR(95%CI)=2.004(1.006~3.992),P=0.044;ACCA:OR(95%CI)=0.581(0.345~0.979),P=0.039;ATCA:OR(95%CI)=1.867(1.252~2.784),P=0.002;GTAA:OR(95%CI)=0.327(0.132~0.807),P=0.011;GCCA:OR(95%CI)=0.428(0.223~0.824),P=0.009;GCCC:OR(95%CI)=2.505(1.135~5.528),P=0.019)。⑶PRDM16基因启动子序列12个CpG位点甲基化水平在两组间差异无统计学意义。PRDM16基因启动子序列12个Cp G位点与BMI相关系数无统计学意义(各Cp G位点P0.05)。结论PRDM16基因rs2651899位点的等位基因G以及单倍体型ACCA、GTAA、GCCA可能是超重肥胖发生的保护因素;单倍体型ACAA、ATCA、GCCC可能是超重肥胖发生的危险因素。PRDM16基因启动子甲基化状态对超重肥胖发生未发现影响。
【关键词】：PRDM16基因 基因多态性 单倍体型 启动子 甲基化 超重肥胖
【学位授予单位】：郑州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R589.2
【目录】：
- 摘要5-7
- Abstract7-13
- 英文缩略词表13-14
- 第一部分14-32
- 1 前言14-18
- 2 研究对象与方法18-23
- 2.1 研究对象18
- 2.2 研究方法18-23
- 2.2.1 主要的试剂18-19
- 2.2.2 主要的仪器19
- 2.2.3 主要试剂的配置19
- 2.2.4 外周血DNA的提取19-20
- 2.2.5 多态性位点的选择20
- 2.2.6 基因分型20-22
- 2.2.7 质量控制22
- 2.2.8 统计学分析22-23
- 3 研究结果23-28
- 3.1 研究人群的一般特征23
- 3.2 PRDM16 基因多态性分析23-28
- 3.2.1 多态性位点基因型的哈温平衡检测23-24
- 3.2.2 多态性位点基因型及等位基因频率统计分析24-26
- 3.2.3 PRDM16 多态性位点单倍体型频率统计分析26-28
- 4 讨论28-32
- 4.1 PRDM16 基因影响超重肥胖机制28
- 4.2 PRDM16 基因单核苷酸多态性与超重肥胖关联28-29
- 4.3 PRDM16 基因单倍体型与超重肥胖关联29-30
- 4.4 肥胖遗传因素研究方法讨论30
- 4.5 本研究优缺点30-32
- 第二部分32-43
- 1 前言32-34
- 2 研究对象与方法34-39
- 2.1 研究对象34
- 2.2 研究方法34-39
- 2.2.1 主要试剂34
- 2.2.2 主要仪器34
- 2.2.3 全血基因组DNA提取34-35
- 2.2.4 DNA甲基化处理35-36
- 2.2.5 基因组启动子区域甲基化检测36-38
- 2.2.6 质量控制38
- 2.2.7 统计分析38-39
- 3 研究结果39-41
- 3.1 研究人群一般特征39
- 3.2 PRDM16 基因启动子甲基化比较39-41
- 3.2.1 质谱法检测DNA甲基化图谱结果39-40
- 3.2.2 启动子序列甲基化情况比较40
- 3.2.3 CpG位点甲基化与BMI关系40-41
- 4 讨论41-43
- 4.1 基因启动子与基因表达的关系41
- 4.2 启动子甲基化与肥胖发生的关系41-42
- 4.3 质谱检测方法优缺点42-43
- 结论43-44
- 参考文献44-49
- 综述49-61
- 参考文献58-61
- 个人简历、研究生期间发表学术论文及获奖情况61-62
- 致谢62
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 李立明,饶克勤,孔灵芝,姚崇华,向红丁,翟凤英,马冠生,杨晓光,中国居民营养与健康状况调查技术执行组;中国居民2002年营养与健康状况调查[J];中华流行病学杂志;2005年07期
2 陆明;钱麟;潘彬;陈建刚;王朔;;实时荧光定量PCR检测膀胱癌TWIST1基因启动子的甲基化状态[J];临床医学工程;2011年05期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 严治涛;PRDM16、BMP7变异与新疆维族代谢综合征关联研究[D];新疆医科大学;2011年
2 王先良;基于甲基化特异性引物和SAGE的高通量DNA甲基化定量检测方法研究[D];华中科技大学;2006年
本文关键词：PRDM16基因多态性及启动子甲基化与超重肥胖的关系，由笔耕文化传播整理发布。
，本文编号：318811
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/nfm/318811.html
最近更新
教材专著
