先天性甲状腺功能减低症患者SLC5A5基因突变筛查和体外功能研究
发布时间:2021-08-09 05:44
先天性甲状腺功能减低症(Congenital hypothyroidism,CH),简称甲低或甲减,是婴儿时期的一种较为常见的内分泌疾病,严重者出现身体发育迟缓以及不可逆的精神发育障碍。SLC5A5(Solute carrier family 5 member 5)基因编码的钠碘同向转运体(Sodium Iodide Symporter,NIS)是与甲状腺激素合成密切相关的质膜糖蛋白,其中NIS介导I-主动转运到甲状腺滤泡细胞中是甲状腺激素生物合成的第一步。SLC5A5基因突变可能会引起碘转运缺陷(Iodine transport deficiency,ITD),进而导致甲低。本研究通过对227例甲状腺功能减低症患者的SLC5A5基因的所有外显子和相邻区域进行高通量测序,筛选出突变病例,并对这几例突变病例的突变位点进行生物信息学分析。然后对发现的新发突变进行功能验证,进而分析其突变是否对蛋白表达及功能有影响。结果在四例患者中检出突变,占患者总人数的1.7%;其中一例患者携带了复合杂合突变(c.173_174del CC,p.P58fs和c.1532G>A,p...
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
NIS二级结构模型
第二章先天性甲状腺功能低下症SLC5A5基因突变筛查9第二章先天性甲状腺功能低下症SLC5A5基因突变筛查2.1实验材料2.1.1研究对象此次研究纳入227例来自西安和新疆地区的CH患者(西安135例,新疆92例;汉族177例,少数民族50例;男性115例,女性112例)。新生儿先天性甲低筛查方法是对出生后大于72h但小于7d的足月新生儿充分哺乳,足跟采血,专用滤纸片测TSH值。但由于此方法仅能检测到原发性甲低和高TSH症,不能检出中枢性甲低等。介于技术及个体水平的差异,约5%的先天性甲低患者无法通过新生儿筛查检出。因此若TSH≥20uIU/mL则初步确诊为阳性患者并召回复查如图3所示[53];若TSH水平正常但出现临床疑似甲低者也应立即召回并复查。复查时,若TSH水平高而FT4水平低,被诊断为先天性甲低;若TSH水平高而FT4水平正常,被诊断为高TSH症;若TSH水平正常或低,FT4水平低,被诊断为中枢性或继发性甲低。此外,也可通过图3所示的其它诊断手段进行辅助检测。图3甲低诊断流程Figure3Diagnosisprocessofhypothyroidism
第二章先天性甲状腺功能低下症SLC5A5基因突变筛查19疑似致病位点进行验证(图4),其中c.1313C>A和c.1915C>T是反向测序结果。图4SLC5A5新发突变sanger测序图Figure4SangersequenceofSLC5A5newmutation2.6.3计算机软件预测突变对蛋白功能的影响SLC5A5基因编码的NIS蛋白有643个氨基酸,包含13个跨膜域、胞外域和胞内域。五个突变的具体分布示意图如1.2.1中图1所示;CLCSequenceViewer6.5.2软件对五个突变的序列保守性分析如图5所示,其中conservation表示的是序列保守性;四个软件对5个突变的功能进行预测,四个软件预测结果均为有害(Damaged,D)或良性(Tolerated,T)则将该位点定性为有害(D)或良性(T),如表6所示。具体结果如下:p.P58fs位于第二个跨膜域,碱基变化发生在1号外显子;高度保守;四个软件预测蛋白功能时,尽管只有MutationTaster预测结果为有害,其余三个预测软件都无法对此类突变做出预测,但该突变造成了移码突变,导致第190位氨基酸是终止密码子,而该蛋白长度为643个氨基酸,因此极大损伤该蛋白的完整性,更无法定位到质膜,判定为有害。p.G75A位于拓扑域,碱基变异发生在1号外显子;高度保守;四个软件蛋白功能预测结果均显示有害,因此判定为有害。p.P438Q位于拓扑域,碱基变异发生于11
【参考文献】:
期刊论文
[1]先天性甲状腺功能减低症的遗传学研究进展[J]. 宫丽霏,孔元原. 北京医学. 2018(09)
[2]新生儿遗传代谢病筛查发展及诊治规范[J]. 叶军. 中国计划生育和妇产科. 2016(01)
[3]中国山东地区先天性甲状腺功能减低症患者PAX8基因突变筛查研究[J]. 王学芹,刘相东,卢德国,李文杰,王梅,刘世国,阎胜利,葛银林. 中国优生与遗传杂志. 2012(12)
[4]早期治疗对先天性甲状腺功能减低症患儿智力及体格发育的影响[J]. 陆艳红,刘晓瑛,宋媛. 中国当代儿科杂志. 2012(06)
[5]暂时性甲状腺功能减低伴甲状腺肿大患儿DUOX2基因突变的研究[J]. 吕志萍,李桂花,李文杰,刘世国. 中华儿科杂志. 2011 (12)
[6]先天性甲状腺功能减低症诊疗共识[J]. 中华儿科杂志. 2011 (06)
[7]新生儿甲状腺功能低下与人群碘缺乏的关系[J]. 沈健,马锦裕,杜松如. 中华预防医学杂志. 1997(01)
[8]中国新生儿先天性甲状腺功能低下症与苯丙酮尿症筛查22年回顾[J]. 徐艳华,秦玉峰,赵正言. 中华儿科杂志. 2009 (01)
本文编号:3331489
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
NIS二级结构模型
第二章先天性甲状腺功能低下症SLC5A5基因突变筛查9第二章先天性甲状腺功能低下症SLC5A5基因突变筛查2.1实验材料2.1.1研究对象此次研究纳入227例来自西安和新疆地区的CH患者(西安135例,新疆92例;汉族177例,少数民族50例;男性115例,女性112例)。新生儿先天性甲低筛查方法是对出生后大于72h但小于7d的足月新生儿充分哺乳,足跟采血,专用滤纸片测TSH值。但由于此方法仅能检测到原发性甲低和高TSH症,不能检出中枢性甲低等。介于技术及个体水平的差异,约5%的先天性甲低患者无法通过新生儿筛查检出。因此若TSH≥20uIU/mL则初步确诊为阳性患者并召回复查如图3所示[53];若TSH水平正常但出现临床疑似甲低者也应立即召回并复查。复查时,若TSH水平高而FT4水平低,被诊断为先天性甲低;若TSH水平高而FT4水平正常,被诊断为高TSH症;若TSH水平正常或低,FT4水平低,被诊断为中枢性或继发性甲低。此外,也可通过图3所示的其它诊断手段进行辅助检测。图3甲低诊断流程Figure3Diagnosisprocessofhypothyroidism
第二章先天性甲状腺功能低下症SLC5A5基因突变筛查19疑似致病位点进行验证(图4),其中c.1313C>A和c.1915C>T是反向测序结果。图4SLC5A5新发突变sanger测序图Figure4SangersequenceofSLC5A5newmutation2.6.3计算机软件预测突变对蛋白功能的影响SLC5A5基因编码的NIS蛋白有643个氨基酸,包含13个跨膜域、胞外域和胞内域。五个突变的具体分布示意图如1.2.1中图1所示;CLCSequenceViewer6.5.2软件对五个突变的序列保守性分析如图5所示,其中conservation表示的是序列保守性;四个软件对5个突变的功能进行预测,四个软件预测结果均为有害(Damaged,D)或良性(Tolerated,T)则将该位点定性为有害(D)或良性(T),如表6所示。具体结果如下:p.P58fs位于第二个跨膜域,碱基变化发生在1号外显子;高度保守;四个软件预测蛋白功能时,尽管只有MutationTaster预测结果为有害,其余三个预测软件都无法对此类突变做出预测,但该突变造成了移码突变,导致第190位氨基酸是终止密码子,而该蛋白长度为643个氨基酸,因此极大损伤该蛋白的完整性,更无法定位到质膜,判定为有害。p.G75A位于拓扑域,碱基变异发生在1号外显子;高度保守;四个软件蛋白功能预测结果均显示有害,因此判定为有害。p.P438Q位于拓扑域,碱基变异发生于11
【参考文献】:
期刊论文
[1]先天性甲状腺功能减低症的遗传学研究进展[J]. 宫丽霏,孔元原. 北京医学. 2018(09)
[2]新生儿遗传代谢病筛查发展及诊治规范[J]. 叶军. 中国计划生育和妇产科. 2016(01)
[3]中国山东地区先天性甲状腺功能减低症患者PAX8基因突变筛查研究[J]. 王学芹,刘相东,卢德国,李文杰,王梅,刘世国,阎胜利,葛银林. 中国优生与遗传杂志. 2012(12)
[4]早期治疗对先天性甲状腺功能减低症患儿智力及体格发育的影响[J]. 陆艳红,刘晓瑛,宋媛. 中国当代儿科杂志. 2012(06)
[5]暂时性甲状腺功能减低伴甲状腺肿大患儿DUOX2基因突变的研究[J]. 吕志萍,李桂花,李文杰,刘世国. 中华儿科杂志. 2011 (12)
[6]先天性甲状腺功能减低症诊疗共识[J]. 中华儿科杂志. 2011 (06)
[7]新生儿甲状腺功能低下与人群碘缺乏的关系[J]. 沈健,马锦裕,杜松如. 中华预防医学杂志. 1997(01)
[8]中国新生儿先天性甲状腺功能低下症与苯丙酮尿症筛查22年回顾[J]. 徐艳华,秦玉峰,赵正言. 中华儿科杂志. 2009 (01)
本文编号:3331489
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