类风湿关节炎患者舌苔菌群微生态研究
发布时间：2022-01-03 00:12
背景:类风湿关节炎（Rheumatoid Arthritis,RA）是一种以慢性滑膜炎性增生、多关节功能活动受损并伴有关节骨质破坏为主要临床特征,并最终导致关节功能毁损的高致畸性的自身免疫性疾病。越来越多的研究表明,腔道菌群与RA的发病存在密切关系。越来越多的研究表明,人体口腔菌群紊乱可能与RA发病存在关系,而舌苔作为口腔菌群在外最直接的表现形式,RA患者舌苔微生物菌群必然区别于正常人群。然而目前对于RA患者舌苔微生态的研究十分欠缺,本研究即为RA患者舌苔微生态的研究,以期为腔道菌群与RA发病的研究提供理论基础。目的:从舌苔菌群微生态上研究类风湿关节炎患者疾病进展与菌群的关系;方法:使用口腔咽拭子刮取活动期（OP组,Oral Prograssive）、缓解期（OR组,Oral Remission）及健康对照组（OHC,Oral Health Control）各10人的舌苔,使用口腔拭子基因组DNA快速提取试剂盒提取总DNA,进行16s rRNA扩增并进行Illumina MiSeq高通量测序,对测序结果进行微生态分析;结果:三组样本在菌群的Alpha多样性上无统计学差异（P>0....
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：44 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
受试患者与健康人群PCR扩增结结果
四三组样本403个O的相互覆Venn图（Chlor在属水平拉菌属(放线菌属，(Geobac酸杆菌属脱硫微(Allosca、菌群组成本共检测出TU。Venn覆盖区域了图分析可见roflexi），平上，OHC(Moraxellac菌属(Actinob副杆菌cillus),Cand属（Lactob菌属(Deardovia）（成分析分别出18个门、n图可用于了解物种的见：门水平上OR组独有独有的菌ceae)，纤毛bacteria)，微属(Parapedidatus_Broacillus），Psulfomicrob（图3B）陆军军医图2三组样别对三组样21个纲、于两组或者多共有情况以上，OHC组有异常球菌-菌群有Aster毛菌属(Lepto微杆菌属(Medobacter)ocadia属,栖elospora属bium),出牙医大学硕士学16样本序列长度样本与细菌55个目、9多组样本之以及各自独组独有棒状嗜热菌门roleplasmaotrichiaceaeMicrobacte；OR独栖热菌属(Th,斯卡多维菌属(Ge学位论文分布情况16SrRNA93个科、1之间物种相互有的物种情状杆菌门（（Deinococ属，棒状杆e)，α-变形rium)，Git有的菌hermus),Tep维亚氏菌属(Semmataceae数据库对比69个属、3互包含关系情况。对三Rokubactercus-Thermu杆菌属(Rok形菌属(Alphtt-GS-136，群有芽pidimonas属Scardovia),e),拟斯卡比分析菌群306个种的系，通过图形三组样本进行ria）及绿弯us）（图3kubacterialehaproteobacActinomar孢杆属，OP独有泛菌属(Pan多维亚氏群组成，的细菌、形之间行物种弯菌门A）；s)，莫teria)，rinales菌属有的乳ntoea),菌属
A五多样性群落的三组样本组OO整体比六这些序指数值为本次测量4）。：门水平，、物种Alp。其中cha多样性情况本在物种多组别OPRHC比较(F,P)、样本测序列对应样本为纵坐标绘量每个样本三组样本菌pha多样性ao、ace指况。对样本进多样性指数表例数sha103.34103.37103.102.22序深度检测本的Alpha绘制曲线，本读取序列陆军军医门相互包含关图3物性分析Alp数反映了群进行Alpha上无统计学5多样性annon±0.340±0.330±0.2702,0.13稀释曲多样性指数根据曲线是约30987条医大学硕士学17关系；B：属物种组成Venpha多样性群落丰富度a多样性分析学差异(P均性指数表（n=simpson0.0721±0.030.0671±0.030.0997±0.032.57，0.10曲线是从样本数，以抽取是否达到平条，从图中可学位论文属水平，三组nn图性分析可以反情况，shan析得到多样>0.05)。10，x±s）74227.00221.62207.00.本中随机抽的数据量为缓来判断本可以看到，本组样本菌属相反映微生物nnon、simp样性指数统计ace37±42.1075±27.4274±31.2088,0.43抽取一定数为横坐标，本次测序数本次测序深相互包含关系物群落的丰富pson指数反计表（见表chao230.17±4214.33±2220.33±40.33,0.数量的序列，以Alpha多数据量是否足深度符合要富度和反映了表5），o7.563.992.8772统计样性足够。求（图
【参考文献】：
期刊论文
[1]CD4+T细胞亚群在类风湿关节炎发病机制中的研究进展[J]. 李凡,张升校,李媛,王彩虹. 中国药物与临床. 2018(10)
[2]黄腻苔舌面菌群门与属水平上的差异性研究[J]. 齐城成,李伟,丁成华,孙悦,王河宝. 中华中医药杂志. 2018(08)
[3]早期类风湿关节炎女性患者阴道微生态菌群基因组分析[J]. 惠彩霞,张娟,曾本华,钟兵,万萍,杨莉,吴力克,魏泓,方勇飞. 第三军医大学学报. 2018(11)
[4]类风湿关节炎血瘀证大鼠模型的制备及评价[J]. 李茜,梁晓东,曹永仓,唐迎雪. 山东中医药大学学报. 2017(05)
[5]基于主成分分析和聚类分析的秦艽不同配伍药对对风湿热痹类风湿关节炎大鼠的作用研究[J]. 马腾茂,刘飞,王蓉,高慧琴. 中草药. 2017(11)
[6]肠道微生态与疾病[J]. 刘志鹏,冯强. 营养学报. 2017(02)
[7]脊痛宁胶囊对风寒湿痹型类风湿关节炎大鼠的治疗作用[J]. 熊丽,杜肖,陈宝忠,王炎焱,贺晓丽. 中国实验方剂学杂志. 2017(01)
[8]口腔病灶与某些系统性疾病发生发展的相关关系研究[J]. 孙海燕,李欢,葛成. 临床口腔医学杂志. 2015(01)
[9]类风湿关节炎湿热痹阻证的舌象与活动性指标关系的研究[J]. 陈延强,谢丽萍. 辽宁中医杂志. 2013(06)
[10]新一代高通量技术在龋病相关的口腔菌群宏基因组学研究中的应用[J]. 凌均棨,杨芳,滕飞. 中华口腔医学研究杂志(电子版). 2011(04)
本文编号：3565165
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：44 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
受试患者与健康人群PCR扩增结结果
四三组样本403个O的相互覆Venn图（Chlor在属水平拉菌属(放线菌属，(Geobac酸杆菌属脱硫微(Allosca、菌群组成本共检测出TU。Venn覆盖区域了图分析可见roflexi），平上，OHC(Moraxellac菌属(Actinob副杆菌cillus),Cand属（Lactob菌属(Deardovia）（成分析分别出18个门、n图可用于了解物种的见：门水平上OR组独有独有的菌ceae)，纤毛bacteria)，微属(Parapedidatus_Broacillus），Psulfomicrob（图3B）陆军军医图2三组样别对三组样21个纲、于两组或者多共有情况以上，OHC组有异常球菌-菌群有Aster毛菌属(Lepto微杆菌属(Medobacter)ocadia属,栖elospora属bium),出牙医大学硕士学16样本序列长度样本与细菌55个目、9多组样本之以及各自独组独有棒状嗜热菌门roleplasmaotrichiaceaeMicrobacte；OR独栖热菌属(Th,斯卡多维菌属(Ge学位论文分布情况16SrRNA93个科、1之间物种相互有的物种情状杆菌门（（Deinococ属，棒状杆e)，α-变形rium)，Git有的菌hermus),Tep维亚氏菌属(Semmataceae数据库对比69个属、3互包含关系情况。对三Rokubactercus-Thermu杆菌属(Rok形菌属(Alphtt-GS-136，群有芽pidimonas属Scardovia),e),拟斯卡比分析菌群306个种的系，通过图形三组样本进行ria）及绿弯us）（图3kubacterialehaproteobacActinomar孢杆属，OP独有泛菌属(Pan多维亚氏群组成，的细菌、形之间行物种弯菌门A）；s)，莫teria)，rinales菌属有的乳ntoea),菌属
A五多样性群落的三组样本组OO整体比六这些序指数值为本次测量4）。：门水平，、物种Alp。其中cha多样性情况本在物种多组别OPRHC比较(F,P)、样本测序列对应样本为纵坐标绘量每个样本三组样本菌pha多样性ao、ace指况。对样本进多样性指数表例数sha103.34103.37103.102.22序深度检测本的Alpha绘制曲线，本读取序列陆军军医门相互包含关图3物性分析Alp数反映了群进行Alpha上无统计学5多样性annon±0.340±0.330±0.2702,0.13稀释曲多样性指数根据曲线是约30987条医大学硕士学17关系；B：属物种组成Venpha多样性群落丰富度a多样性分析学差异(P均性指数表（n=simpson0.0721±0.030.0671±0.030.0997±0.032.57，0.10曲线是从样本数，以抽取是否达到平条，从图中可学位论文属水平，三组nn图性分析可以反情况，shan析得到多样>0.05)。10，x±s）74227.00221.62207.00.本中随机抽的数据量为缓来判断本可以看到，本组样本菌属相反映微生物nnon、simp样性指数统计ace37±42.1075±27.4274±31.2088,0.43抽取一定数为横坐标，本次测序数本次测序深相互包含关系物群落的丰富pson指数反计表（见表chao230.17±4214.33±2220.33±40.33,0.数量的序列，以Alpha多数据量是否足深度符合要富度和反映了表5），o7.563.992.8772统计样性足够。求（图
【参考文献】：
期刊论文
[1]CD4+T细胞亚群在类风湿关节炎发病机制中的研究进展[J]. 李凡,张升校,李媛,王彩虹. 中国药物与临床. 2018(10)
[2]黄腻苔舌面菌群门与属水平上的差异性研究[J]. 齐城成,李伟,丁成华,孙悦,王河宝. 中华中医药杂志. 2018(08)
[3]早期类风湿关节炎女性患者阴道微生态菌群基因组分析[J]. 惠彩霞,张娟,曾本华,钟兵,万萍,杨莉,吴力克,魏泓,方勇飞. 第三军医大学学报. 2018(11)
[4]类风湿关节炎血瘀证大鼠模型的制备及评价[J]. 李茜,梁晓东,曹永仓,唐迎雪. 山东中医药大学学报. 2017(05)
[5]基于主成分分析和聚类分析的秦艽不同配伍药对对风湿热痹类风湿关节炎大鼠的作用研究[J]. 马腾茂,刘飞,王蓉,高慧琴. 中草药. 2017(11)
[6]肠道微生态与疾病[J]. 刘志鹏,冯强. 营养学报. 2017(02)
[7]脊痛宁胶囊对风寒湿痹型类风湿关节炎大鼠的治疗作用[J]. 熊丽,杜肖,陈宝忠,王炎焱,贺晓丽. 中国实验方剂学杂志. 2017(01)
[8]口腔病灶与某些系统性疾病发生发展的相关关系研究[J]. 孙海燕,李欢,葛成. 临床口腔医学杂志. 2015(01)
[9]类风湿关节炎湿热痹阻证的舌象与活动性指标关系的研究[J]. 陈延强,谢丽萍. 辽宁中医杂志. 2013(06)
[10]新一代高通量技术在龋病相关的口腔菌群宏基因组学研究中的应用[J]. 凌均棨,杨芳,滕飞. 中华口腔医学研究杂志(电子版). 2011(04)
本文编号：3565165
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