系统性红斑狼疮患者功能基因组的分析与验证

发布时间：2023-09-14 01:58

　　目的:利用已发表的基因表达综合数据库查找系统性红斑狼疮(Systemic Lupus Erythematosus,SLE)相关的基因表达标记,下载基因芯片表达数据并进行meta分析,寻找SLE基因表达标记特征的交集,分析并总结出SLE关键基因表达标记组群,并进行验证。从而为确定SLE的关键基因以及疾病预防、早期诊断和药物靶点治疗等提供参考与理论依据。方法:从NCBI(National Center for Biotechnology Information)GEO(Gene Expression Omnibus)数据库和PubMed数据库下载DNA微阵列基因表达标记数据,找出15个与SLE表型相关的的DNA微阵列数据集,然后将它们分成训练数据集(13个数据集)和验证数据集(2个数据集),分别包括1,869和1,171个样本(见S1表)。使用EXALT(Expression Analysis Tool)软件行meta分析,我们从训练数据组的13个数据集中提取关键基因表达标记组群,然后用验证数据组中2个数据集的样本对所分析出来的关键基因表达标记组群进行回顾性和前瞻性验证。将验证数据集中的S...

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 前言
第2章 对象与方法
    2.1 公开可用的数据集
    2.2 定义Meta分析数据集
    2.3 SLE特征基因集合的前瞻性预测
    2.4 统计学处理
第3章 结果
    3.1 鉴定人类 SLE metaSig100
    3.2 SLE特征基因的信号通路分析
    3.3 通过SLEmetaSig100对SLE患者进行分层
    3.4 使用SLEmetaSig100 对患者进行个体化SLE预测
第4章 讨论
第5章 结论
参考文献
综述
    参考文献
中英文对照缩略词表
作者攻读学位期间的科研成果
致谢



本文编号：3846330