Graves病患者肠道菌群多样性分析

发布时间：2023-11-10 19:45

　　目的初步探究Graves病(Graves disease,GD)患者肠道菌群的多样性变化。方法选择遵义医科大学附属医院就诊的初诊Graves病患者(n=18例),同期于体检中心体检的健康人群(n=11例),受试者均排除近1个月内合并感染性疾病、其他自身免疫疾病、应用益生菌及抗生素等。并收集其粪便样本,提取肠道菌群DNA,16S rRNA基因扩增,Illumina平台测序,对测序结果进行物种注释、多样性及物种差异分析。结果测序共测得1 200 665条高质量序列,每个样本平均含有(41 402±6 733)条有效序列。2组间Chao1指数、ACE指数、Shannon指数及Simpson指数没有统计学差异(P> 0.05),但GD组均小于NC组,表明Graves病患者肠道菌群多样性降低。2组间肠道菌群组成和结构存在显著差异,门水平上GD组厚壁菌门相对丰度低于NC组,而放线菌门高于NC组(P <0.05)。属水平上GD组双歧杆菌属、柯林斯氏菌属、Pediococcus、N09、02d06等相对于NC组优势丰度分布,而罗斯氏菌属、小杆菌属、Thermus、Slackia、[Prev...

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【文章目录】：
1 对象与方法
    1.1 研究对象
    1.2 标本采集
    1.3 粪便菌群DNA的提取
    1.4 Illumina MiSeq测序
    1.5 数据分析
        1.5.1 OTU划分和分类地位鉴定
        1.5.2 肠道群落的多样性分析
    1.6 统计学方法
2 结果
    2.1 2组一般临床资料的比较
    2.2 2组OTUs的Venn图
    2.3 2组肠道菌群Alpha多样性分析
    2.4 2组肠道菌群Beta多样性分析
    2.5 2组肠道菌群在门及属水平分类学组成分析
3 讨论



本文编号：3862194