ARMC5基因突变参与原发性双侧肾上腺大结节增生的发病机制

发布时间：2024-03-25 03:33

　　目的:通过生物信息学的数据挖掘及文献挖掘,筛选ARMC5基因突变参与原发性双侧肾上腺大结节增生(PBMAH)发病的下游关键分子,并在细胞学水平对其机制进行初步验证。方法:(1)选取GEO数据库芯片数据系列GSE4060和GSE25031为研究对象,将筛选的差异表达基因(DEGs)取交集获得共同DEGs构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,得到PBMAH关键模块基因。(2)通过cytoscape的agilent literature search插件,在pubmed中对PBMAH中ARMC5基因进行文献挖掘,得到ARMC5相关基因网络,并与PBMAH的关键模块基因关联,构建新的PPI网络,寻找ARMC5基因突变参与PBMAH发病的重要调控节点。(3)构建野生型ARMC5基因质粒(野生型组)、突变型ARMC5基因质粒(突变型组)及空质粒(空质粒组),转染肾上腺皮质癌H295R细胞系后,Annexin V-FITC/PI染色后流式细胞术检测各组细胞凋亡情况,分别采用RT-PCR和western blot检测ARMC5、p53、bax和bcl-2 mRNA及蛋白表达情况。结果:(1)成功筛...

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【部分图文】：

图2.1GEO数据库首页GEO2R为GEO数据库自带的分析工具，为基于R语言的交互式在线分析

材料和方法通过GEO数据库获取PBMAH患者芯片数据.1GEO数据库简介因表达综合数据库（GeneExpressionOmnibus，GEO），GEO数据库网tps://www.ncbi.nlm.gov/geo（图2.1）。GEO数据类型包括平台（Pla....

图2.2GSE4060（左）和GSE25031（右）样本表达量分布情况

1.2芯片数据来源进入GEO数据库主页，分别以“（PBMAH）ORprimarybilateralmacronodunalhyperplasia”、“(AIMAH)ORACTHindependentmacronodularadreerplasia”和“ad....

图2.3DAVID数据库主界面

论（GeneOntology，GO）注释，现已扩展至超过40种注释种类，如基因组百科全书（KytoEncyclopediaofGenesandGenomes，KEGG）注释、蛋白相互作用（protein-proteininteraction,PPI）、生物代谢....

图2.4GSE4060和GSE25031检索信息表2.1.GSE4060和GSE25031基本信息

图2.4GSE4060和GSE25031检索信息表2.1.GSE4060和GSE25031基本信息GSEID样本情况平台GSE40605例AIMAH（PBMAH）肾上腺组织样本、5例ACTH依赖性肾上腺增生组织样本、2例边缘性AIMAH（P....

本文编号：3938471