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上海市男男性行为者中感染HIV-1的CRF01_AE毒株传播簇分析

发布时间:2017-08-15 19:05

  本文关键词:上海市男男性行为者中感染HIV-1的CRF01_AE毒株传播簇分析


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【摘要】:目的了解上海地区男男性行为者(MSM)中,感染艾滋病病毒1型(HIV-1)的CRF01_AE重组型的流行情况、成簇特性,为HIV防控工作提供科学数据。方法从2009-2013年每年新诊断的MSM HIV-1感染者血浆样本中提取RNA,并对HIV-1 pol基因片段进行反转录和巢式PCR扩增、DNA测序和亚型分析。对CRF01_AE重组型序列进行系统进化学和社会人口学信息分析。结果 1262名MSM感染者中,CRF01_AE重组型感染782人(62.0%),其序列在系统进化树上形成6个流行簇。使用不同参数界定传播簇并进行比较,选择以Bootstrap≥90%及基因距离≤0.03作为传播簇的界定标准,形成112个传播簇,其中由10条及以上序列形成的传播簇有5个;年龄、文化程度、婚姻状况、性病史和CD4+T淋巴细胞计数与样本的成簇性有统计学关联。结论 CRF01_AE重组型毒株是上海市MSM HIV-1感染者中的优势传播株,具有较强的成簇性,并且与相关的社会人口学和流行病学背景相关。
【作者单位】: 上海市疾病预防控制中心;
【关键词】艾滋病病毒型 男男性行为者 CRF_AE 传播簇
【基金】:国家“十二五”传染病科技重大专项(2012ZX10001-002) 病毒学国家重点实验室开放研究基金项目(2015IOV004)~~
【分类号】:R512.91
【正文快照】: 男男性行为者(Men who have sex with men,MSM)是上海市艾滋病病毒(Human immune defi-ciency virus,HIV)感染者中比例最高的人群,且感染率持续缓慢上升[1],在上海市HIV传播网络的发展和扩大中起重要作用。HIV-1CRF01_AE是上海市优势毒株,在MSM感染者中感染率最高[2]。为了解

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本文编号:679785

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