PRKAG2基因rs17173197多态性与中国汉族人群特应性皮炎临床表型相关性分析
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《安徽医科大学》 2015年
PRKAG2基因rs17173197多态性与中国汉族人群特应性皮炎临床表型相关性分析
房灵
【摘要】:研究背景特应性皮炎(Atopic Dermatitis,AD)是一种遗传占主导作用的慢性、瘙痒性、炎症性皮肤疾病,同时坏境因素也起着不可忽视的作用。目前主要认为是由于角质细胞分化异常引起皮肤屏障功能障碍和免疫缺陷共同作用导致发病。AD临床上可分为婴儿期、儿童期和青年成人期三个时期。AD患者可伴发多种疾病,Hanifin和Rajka诊断标准中指出AD除4项主要特征外,还可以伴发23种次要症状。遗传流行病学AD属于多基因遗传模式,以AD家系为基础的全基因组连锁分析确定了AD的多个易感区域,随后候选基因关联研究等成功确定了多个AD的易感基因,2009年来,从AD的第一项全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS)研究出现以来,目前共有德国、日本、两项欧洲研究和中国研究共发现了19个AD易感基因。虽然AD GWAS研究发现很多AD易感基因,但这些易感基因和AD临床表型间的关系研究甚少。本研究团队先前GWAS中提示PRKAG2基因rs17173197可能和AD有关。本次研究将进一步探讨分析PRKAG2基因rs17173197的遗传模型、基因型、等位基因与中国汉族人群AD临床表型的关系。研究目的探讨分析中国汉族人AD患者PRKAG2基因rs17173197的遗传模式;分析PRKAG2基因rs17173197的基因型与AD临床表型之间的关系。实验材料与方法本研究共纳入4480例AD病例和12319例正常对照,所有研究对象均来自本研究团队先前AD GWAS研究中样本,2001年11月-2010年5月上海、广州、杭州、合肥、山东、北京等省市与本单位有合作的医院皮肤科门诊抽取的患者血样。诊断标准均依照国际上通用的Hanifin-Rajak诊断标准,所有患者均为汉族人口,所有研究对象的统计学信息均通过结构化的问卷调查收集。病例组和对照组在年龄和地域上匹配,然后采用Illumina Human610芯片和Sequenom Mass Array基因平台PRKAG2基因多rs17173197位点基因分型成功的4480例AD病例和12319例正常对照,使用SPSS 20.0软件进行统计分析病例和对照间伴发疾病和不伴发疾病不同临床表型基因型-临床表型之间的差异。结果遗传模型分析显示PRKAG2基因rs17173197基因型频率在病例组与对照组间有统计学意义(PGG基因型=1.76×10-9;PGA基因型=3.84×10-4),在累加模型下对AD发病作用最强(P=3.09×10-22)。分层分析结果表明rs17173197等位基因G与南方地区人群(P=1.23×10-3,OR=1.18,95%CI=1.07-1.30)、AD家族史(P=4.58×10-4,OR=0.82,95%CI=0.73-0.92)、AD伴干燥症(P=8×10-3,OR=1.14,95%CI=1.04-1.26)相关。未发现rs17173197与AD的其他表型发病年龄、疾病严重程度、伴发哮喘、伴发过敏性鼻炎(Allergic Rhinitis,AR)、伴发鱼鳞病、总Ig E水平升高相关。结论本研究首次发现了rs17173197(PRKAG2)最小等位基因G与中国汉族人群AD南方区域,AD伴干燥症、家族AD有关,暂未发现rs17173197与AD其他伴发疾病有关。
【关键词】:
【学位授予单位】:安徽医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R758.2
【目录】:
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