吉林省扶余地区35例儿童孢子丝菌病的分离菌株的基因鉴定

发布时间：2018-04-26 11:18

  本文选题：申克孢子丝菌 + 基因测定　； 参考：《吉林大学》2012年硕士论文

【摘要】：目的： 对吉林省扶余地区儿童孢子丝菌病进行流行病学分析并对其部分分离菌株进行基因鉴定，并与同时期吉林省非扶余地区孢子丝菌病的分离菌株基因对比，了解该地区孢子丝菌基因是否发生变异，导致该地区菌株致病力增强致使发病率增高；同时对临床上引起1例皮肤播散型孢子丝菌病的分离菌株进行基因鉴定，并与临床表现为淋巴管型及固定型孢子丝菌病的分离菌株进行比较，了解其基因水平上的异同。 方法： 通过收集2011年1月1日至2011年4月30日来自吉林省扶余地区就诊于我科门诊并确诊为孢子丝菌病的患儿35例，进行流行病学分析，并从35例儿童孢子丝菌病的分离菌株中选取7株菌株，其中包括固定型孢子丝菌4株和淋巴管型的孢子丝菌3株，用常规真菌学方法进行鉴定，并对其核糖体保守区及ITS、NTS区进行基因鉴定；收集吉林省非扶余地区1例临床表现为皮肤播散型孢子丝菌病的菌株，用常规真菌学方法进行鉴定，并对其核糖体保守区及ITS、NTS区进行基因鉴定。上述所有菌株的基因鉴定结果均与吉林省非扶余地区的固定型及淋巴管型孢子丝菌进行比较，了解基因水平上的异同。 结果： 1、吉林省扶余地区儿童孢子丝菌病的流行病学分析：本次发病主要累及地区为扶余县弓棚子镇及三家子镇，余散发病例为扶余县的其他地区；患儿病史1个月至6个月不等，平均3.00±1.29月；年龄80天至13岁不等，平均5.96±3.80岁；男性患儿23例，占65.71%，女性患儿12例，占34.29%，男女比例为1.92:1；固定型26例，占74.29%，淋巴管型9例，占35.71%。 2、核糖体保守区及ITS基因测定：吉林省扶余地区儿童孢子丝菌中1株淋巴管型孢子丝菌菌株基因长度为376bp，与基因库中的3株申克孢子丝菌菌株（KMU3509，KMU3993，Duke3751）相似性达100%；该地区其余6株菌株及非扶余地区的固定型、淋巴管型及播散型孢子丝菌共3株菌株均与基因库中3株申克孢子丝菌菌株（KMU3509，KMU3993，，Duke3751）相似性达99%以上。 3、不同菌株NTS区的差异主要由碱基缺失引起。 4、吉林省非扶余地区的固定型及淋巴管型孢子丝菌NTS区测定：固定型孢子丝菌NTS序列，与基因库中Dum12相似性达百分之百；淋巴管型孢子丝菌与固定型孢子丝菌NTS序列相似性高达98%。为使本实验菌株NTS区测序结果有统一的对照标准，将固定型孢子丝菌作为标准对照菌株。 5、吉林省扶余地区菌株NTS基因测定：7株分离菌株中1株固定型孢子丝菌与标准对照株NTS序列完全一致；1株固定型及1株淋巴管型菌株与标准对照株相比可见个别碱基缺失，未发现有特异性；2株固定型及1株淋巴管型孢子丝菌与标准对照株相比除个别碱基缺失位点不一致外，在208 232bp区间可见不连续10个碱基的缺失，且缺失位点完全一致；1株淋巴管型孢子丝菌与标准对照株相比在208-249bp区间可见21个碱基的不连续缺失。7株菌中4株菌NTS区可见明显的碱基缺失，占所有菌株的57.14%。 6、播散型孢子丝菌NTS基因测定：固定型和淋巴管型孢子丝菌NTS区相似性达98%，序列差异不大；播散型孢子丝菌与淋巴管型及固定型孢子丝菌相比在208 232bp区间可见相同位点的10个不连续碱基的缺失。 7、扶余地区2株固定型、1株淋巴管型孢子丝菌及非扶余地区1株播散型孢子丝菌与标准对照株相比除个别碱基缺失位点不一致外，在208 232bp区间均可见不连续10个碱基的缺失，且缺失位点完全一致。 结论： 1、核糖体基因保守区及ITS区保守性高，在申克孢子丝菌菌种鉴定上有极高的特异性。 2、吉林省扶余地区7株孢子丝菌菌株，其中4株（占57.14%）可见较多的碱基缺失，推测该地区菌株可能由于NTS碱基缺失而导致其致病力增强，从而使该地区短时间内发病率增高。 3、与固定型及淋巴管型孢子丝菌NTS区相比，播散型孢子丝菌NTS区可见10个相同位点的不连续碱基的缺失，推测播散型菌株可能因为NTS区的碱基较大范围缺失而导致其致病力增强。 4、本实验10株孢子丝菌菌株中两株菌株NTS区完全相同，并与基因库中Dum12菌株相似性达100%；3株菌株与标准对照株相比仅可见个别位点的碱基缺失；4株菌株与标准对照株NTS相比，除个别碱基差异外，可见相同位点的较大范围的碱基缺失。实验菌株之间的NTS区差异主要是由于碱基缺失引起。我们推测NTS区也许可以作为孢子丝菌种内分型的研究，而不同型别之间的差异可能主要是由于碱基缺失引起。
[Abstract]:Purpose :

Epidemiological analysis of sporotrichosis of children in Fuyu area of Jilin Province was carried out and some isolates were genotyped and compared with the isolates from non - Fuyu area of Jilin Province in the same period .
In the same time , the isolates were identified and compared with the isolates from the clinical manifestation of lymphatic vessel type and fixed - type sporotrichosis , and the differences of their gene level were understood .

Method :

A total of 35 cases of children from Jilin Province were collected from January 1 , 2011 to April 30 , 2011 , and 7 strains were selected from 35 children with sporotrichosis disease .
1 case of non - Fuyu area in Jilin province was collected and identified by routine mycology method . The results of gene identification were compared with those in non - Fuyu region of Jilin Province . The results of gene identification were compared with those of non - Fuyu region in Jilin Province .

Results :

1 . Epidemiological analysis of sporotrichosis of children in Fuyu area of Jilin Province : The main part of this disease is the arch shed town of Fuyu County and Sanjia Town , and the remaining cases are other parts of Fuyu County ;
The patient ' s medical history ranged from 1 month to 6 months , with an average of 3.00 卤 1 . 29 months .
Age ranged from 80 days to 13 years , with an average of 5.96 卤 3.80 years .
23 cases ( 65.71 % ) were male , 12 cases were female , 34.29 % , and the male and female ratio was 1 . 92 鈭

本文编号：1805797