ERAP1基因多态性与汉族人寻常型银屑病表型的相关性研究

发布时间：2019-10-12 05:15

【摘要】：研究背景银屑病(Psoriasis,OMIM*177900)是一种以红斑、鳞屑为典型表现的慢性复发性炎症性皮肤病,其发病有复杂的免疫学基础,包括角质形成细胞增生,表皮分化异常等。汉族人群中的发病率约为0.123%。遗传因素和复杂的环境因素在疾病的进展中起重要作用。寻常型银屑病(Psoriasis Vulgaris,PV)是最常见的临床类型,占90%以上。本课题组通过全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)研究在国际上首次报道了汉族人寻常型银屑病易感性与ERAP1(rs151823)基因多态性显著相关,位于5号染色体长臂5q15上的ERAP1是汉族人银屑病的易感基因。目的对寻常型银屑病发病年龄、家族史及临床类型进行分层分析,在汉族人群中研究ERAP1基因单核苷酸多态性(rs151823)位点与寻常型银屑病患者临床表型的相关性,为进一步探讨银屑病的发病机制提供重要的遗传学依据。方法7,717例PV患者和11,831例正常对照的ERAP1基因多态位点rs151823的基因分型(AA,CA,CC)资料均来源于本课题组银屑病全基因组关联分析的分型数据,数据资料经适当转化后应用社会科学统计软件包SPSS 15.0对资料进行统计学分析。χ~2检验用于比较各组间ERAP1基因多态位点rs151823基因型和等位基因的频率分布。P值小于0.05则认为有统计学意义。结果1.病例组与对照组的基因型频率分布总体差异具有统计学意义(χ~2=34.25,df=2,P=3.65×10~(-8)),病例组与对照组的等位基因频率分布差异亦具有统计学意义(χ~2=31.60,df=1, P=1.89×10~(-8),OR 1.12,95%CI 1.08-1.17)。2.早发患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=40.52,df=2,P=1.59×10~(-9);等位基因:χ~2=37.69,df=1,P=8.28×10~(-10),OR 1.14,95%CI 1.09-1.19)。而晚发患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义(基因型:χ~2=0.17,df=2,P=0.92;等位基因:χ~2=0.01,df=1,P=0.91,OR 1.01,95%CI 0.92-1.10)。早发患者与晚发患者间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=7.37,df=2,P=0.025,P_(AA)=0.04,P_(CA)=0.86,P_(CC)=0.018;等位基因:χ~2=6.96,df=1,P=0.008,OR 1.14,95%CI 1.03-1.25)。3.少儿发病患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=21.81,df=2,P=1.84×10~(-5);等位基因:χ~2=18.86,df=1,P=1.41×10~(-5),OR 1.16,95%CI 1.09-1.25)。成人发病患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=22.43,df=2,P=1.35×10~(-5);等位基因:χ~2=21.38,df=1,P=3.76×10~(-6),OR 1.11,95%CI 1.06-1.16)。少儿发病患者与成人发病患者间的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义(基因型:χ~2=2.93,df=2,P=0.23,P_(AA)=0.68,P_(CA)=0.30,P_(CC)=0.09;等位基因:χ~2=1.58,df=1,P=0.21,OR 1.05,95%CI 0.97-1.13)。4.家族史阳性患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=22.30,df=2,P=1.43×10~(-5);等位基因:χ~2=21.53,df=1,P=3.48×10~(-6),OR 1.18,95%CI 1.10-1.26)。家族史阴性患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=22.14,df=2,P=1.56×10~(-5);等位基因:χ~2=20.06,df=1,P=7.50×10~(-6),OR 1.11,95%CI 1.06-1.16)。家族史阳性患者与家族史阴性患者间的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义(基因型:χ~2=2.81,df=2,P=0.25,P_(AA)=0.16,P_(CA)=0.86,P_(CC)=0.19;等位基因:χ~2=2.70,df=1,P=0.10,OR 1.06,95%CI 0.99-1.15)。5.急性点滴型患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=10.22,df=2,P=0.006;等位基因:χ~2=7.09,df=1,P=0.008,OR 1.10,95%CI 1.02-1.17)。慢性斑块型患者与对照间的基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(基因型:χ~2=31.40,df=2,P=1.52×10~(-7);等位基因:χ~2=30.28,df=1,P=3.74×10~(-8),OR 1.13,95%CI 1.08-1.19)。慢性斑块型患者与急性点滴型患者间的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义 (基因型:χ~2=2.30,df=2,P=0.32,PAA=0.14,PCA=0.22,PCC=0.93;等位基因:χ~2=0.93,df=1,P=0.34,OR 1.04,95%CI 0.96-1.11)。结论1. ERAP1基因(rs151823)遗传多态性与中国汉族人群PV的易感性相关,尤其与早发型银屑病相关性更明显;2.早发型银屑病患者和晚发型银屑病患者间ERAP1基因遗传多态位点rs151823的作用有显著差异。ERAP1基因(rs151823)遗传多态性与汉族人PV的发病年龄有明显相关性;3. ERAP1基因(rs151823)遗传多态性与汉族人PV的有无家族史无相关性;4. ERAP1基因(rs151823)遗传多态性与汉族人PV的临床类型无相关性;5. ERAP1基因(rs151823)遗传多态性对汉族人PV的有无家族史及临床类型影响较弱,可能源自银屑病复杂的遗传背景和不同的发病机制。
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2011
【分类号】：R758.63

【参考文献】