REL、TNIP1基因多态性及负性情绪与银屑病相关性研究
【学位授予单位】:南方医科大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:R758.63
【图文】:
逦第二部分REL、TNIP1基因多态性及负性情绪与银屑病相关性研究逦逡逑片段的PCR(Long-Range邋Polymerase邋Chain邋Reaction,LR-PCR)扩增出整个基因片逡逑段,然后把LR_PCR产物稀释100倍后再作为DNA的模板,进行外显子的扩增。逡逑1.2.7.2.2连接酶检测反应(ligase邋detection丨'eaction,LDR)原理和测序分型原理逡逑LDR的原理是使用高温连接酶来识别基因多态性的位点。如果高温连接酶逡逑检测到DNA和互补的两条寡聚核苷酸接头对应处存在着基因点突变类型的碱基逡逑错配,那么连接反应就不能进行^321.逡逑如图1-2:右边的探针和模板有一个碱基不能配对,因此,连接反应不能进逡逑行,所以没有连接产物;左边的探针和模板DNA完全的互补,所以能进行连逡逑接反应。通过温度控制循环,该特异性连接反应可以反复的进行,一直达到线逡逑性扩增的效果。逡逑
逡逑如图1-3:检测结果说明,左边位点即突变位点一,是A/C杂合子;右边逡逑位点即突变位点二,是T纯合子。逡逑a-逦<】!物邋2逡逑逦邋—*邋邋逦P櫹楸荆模湾义稀昵柏危危矗冲义希慑澹妫椋欤酰欤欤椋穑欤澹澹颍铮翦义襄危垮文康捏遥绕渝五五五五义襄危咤魏恢坏阋诲五澹浚蒎义希停酰欤簦椋穑欤澹澹蹋模隋义希臀坏阋诲澹迷雍献樱粒缅澹╁蝁>变位:点二(托合子T邋)逡逑?邋逦逦逦邋3f逦逦逦逦邋3r逡逑逦1邋逦禽邋-^5?光探计逦逦£逦1逡逑G逦A逡逑UES?逦LDPkSJm逡逑7逦!,逡逑T邋|逡逑 ̄!逦"1连接产物逦j4逦k逡逑丨丨■丨丨■丨—一—*逦」长度不间逦太逦^—★逡逑t邋?n,序仪检测逡逑ir逡逑.^逦逦逡逑图1-3:测序分型原理逡逑Fig.邋1-3邋The邋principle邋of邋genotyping邋by邋sequencing逡逑1.2.7.2.3多重PCR扩增逡逑A在PCR的薄壁管中,配制20W的多重PCR体系:10mMTris-HCl(pH7.4),逡逑2.OmM邋MgC12,50mM邋KC1,0.5|iM邋Primers邋,200mM邋dNTPs,1U邋polymerase。再力口逡逑入2以基因组DNA。PCR反应体系见表1-7逡逑43逡逑
图5:电泳与Genemapper分析逡逑Fig.邋1-5邋The邋electrophoresis邋and邋Genemapper邋analysis逡逑1.3统计学方法逡逑1.3.1整理数据:将Genemapper软件数掘分析结果得出的REL猫因多态位点逡逑rs702873和TNIPI基因多态位点rsl7728338的基因分型数据,导入Microsoft邋Excel逡逑表中,让研宄对象的临床资料和基因型相对应,筛选出每个基因型及等位基因逡逑47逡逑
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