迟发性卟啉病2家系UROD基因突变分析
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【摘要】:迟发性皮肤卟啉病(porphyria cutanea tarda,PCT)是一种少见的卟啉代谢异常的常染色体显性遗传病,临床特征为日光暴露部位皮肤的光毒性反应及脆性增加。UROD基因为该病的致病基因,位于染色体1p34。目前已报道的UROD基因突变有109个,各外显子均有突变报道。 目的对两个迟发性皮肤卟啉病家系进行基因筛查,选取尿卟啉原脱羧酶(UROD)基因进行研究,探讨以上两个家系的分子病因。 方法收集2个迟发性皮肤卟啉病家系的外周血标本,制备基因组DNA,,采用聚合酶链反应(PCR)扩增UROD基因的10个外显子及邻近内含子区域,对PCR产物进行直接测序,将测序结果与Genebank中UROD基因的标准序列(Gene ID:7389)进行比对,分析该基因的突变。 结果在UROD基因10个外显子及邻近内含子区域内检测到7个变异位点。发现UROD基因的2480位碱基T>A(rs2236576),该碱基位于第1号外显子上游区域;第3238位碱基C>T(rs12749939),该碱基位于第1、2号外显子之间的内含子区域;第4577位碱基G>T(rs11211066),第4679位碱基G>T(rs6698485),上述两个碱基位于第6、7号外显子之间的内含子区域;第5538位碱基C>(Trs6429553),第5634位碱基T>C(rs13948),上述两个碱基位于第9、10号外显子之间的内含子区域;以上6个位点均不编码氨基酸。第5913位碱基G>A,使第384位氨基酸密码子GAA→AAA,由谷氨酸(Glu)转变为赖氨酸(Lys),该碱基位于第10号外显子上。以上7个变异在2个PCT家系患者及正常人中均有出现,为单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),不是引起上述两个迟发性卟啉病家系的致病突变。 结论我们在UROD基因编码区域及附近内含子发现7个变异位点,而这些变异不是上述两个迟发性卟啉病家系的致病性基因突变,具体病因还需要我们在UROD基因外显子以外的区域中进一步筛查。
【关键词】:迟发性皮肤卟啉病 尿卟啉原脱羧酶 突变 单核苷酸多态性
【学位授予单位】:宁夏医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:R758.1
【目录】:
- 摘要4-6
- Abstract6-10
- 前言10-14
- 实验材料和方法14-25
- 结果25-34
- 讨论34-41
- 结论41-42
- 参考文献42-47
- 课题综述47-57
- 参考文献52-57
- 致谢57-59
- 攻读学位期间发表的学术论文59
【参考文献】
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本文编号:298695
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