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LncRNA及RNA m6A甲基化在肢端型黑色素瘤中发病机制的初步研究

发布时间:2021-02-23 00:32
  CMM是高度恶性的皮肤肿瘤,其发生和发展归因于独立或联合的遗传和表观遗传事件。在遗传改变方面,对了解CMM发病机制取得了显著进展。最近的研究揭示了 RNA相关表观遗传机制在基因表达调控中的重要参与,包括非编码RNA的多种活性以及RNA甲基化。基于课题组前期研究结果,本课题对THOC2 RNAi的A375细胞进行IncRNA表达谱分析,发现了包括Lnc-PKNOX1-1在内的一系列相关lncRNA存在表达差异,并在亚洲人好发的CMM亚型ALM的肿瘤组织中得到了验证。此外,RNA甲基化修饰相关研究在肿瘤领域取得了突破性进展,其参与了多种肿瘤的发生发展过程,与免疫治疗耐受的发生密切相关,基于此,本课题分析了RNA甲基化修饰与ALM的相关性,并测定了甲基化修饰相关酶在ALM组织中的表达情况。为接下来的Lnc-PKNOX 1-1及RNA甲基化修饰参与ALM发病机制的深入研究指明了方向。第一部分:LncRNA表达谱芯片筛选ALM相关LncRNA目的:探讨lncRNA在ALM中的作用和相关机制。方法:构建THOC2 RNAi的A375细胞系,以未处理的A375细胞系作为对照组进行lncRNA表达谱分... 

【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】:49 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

LncRNA及RNA m6A甲基化在肢端型黑色素瘤中发病机制的初步研究


图1.转染后各组细胞中THOC2表达水平??3.2?IncRNA表达谱分析??

聚类分析,信号通路,芯片分析,相对差异


3.2?IncRNA表达谱分析??选取?THOC2-2147siRNA?的?A375?细胞进行?IncRNA?芯片分析,THOC2-2147??siRNA及对照组A375细胞表达谱之间相对差异的聚类分析见图2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在内的IncRNA表达显著下调。此外,KEGG信号通路富集图显??示THOC2沉默后A375细胞PTEN/PI3K/AKT信号通路显著衰减。(图3)??15??

信号通路,富集,相对差异


siRNA及对照组A375细胞表达谱之间相对差异的聚类分析见图2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在内的IncRNA表达显著下调。此外,KEGG信号通路富集图显??示THOC2沉默后A375细胞PTEN/PI3K/AKT信号通路显著衰减。(图3)??15??


本文编号:3046766

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