WNT/Ca 2+ 通路在皮肤鳞状细胞癌的作用及UVB调控ID4基因DNA甲基化的机制研究
发布时间:2021-03-10 20:33
皮肤鳞状细胞癌是起源于表皮角质所形成的皮肤附属结构的一种恶性肿瘤,皮肤鳞状细胞癌发病率在皮肤恶性肿瘤中仅次于基底细胞癌占居第二位,且近年来发病率呈增高趋势。尽管早期CSCC手术切除预后较好,但转移性CSCC病例因病灶位置及转移程度不同而难以治疗,部分病例死亡率超过70%。另外,对于好发于头面部的鳞癌患者,面临着创面缺损修补、美容要求及器官功能障碍等多方面挑战。因此,仍然急需研究其发病机理寻找新的生物学标记及治疗方法来诊断、缩小瘤体大小、抑制肿瘤侵袭和复发CSCC。WNT5a主要通过WNT/Ca2+和WNT/PCP途径参与非经典WNT通路。然而,WNT5a及其同源受体在癌症中的作用一直备受争议。依据不同的癌症类型,WNT5a具有促进或抑制肿瘤的作用。已有报道运用微阵列技术发现,与日光角化和正常皮肤相比,WNT5a在CSCC中表达升高。但是其具体作用及机制仍然不清。本研究利用全基因组RNA测序(RNA-seq)得出非经典WNT通路上的FZD4、PLCβ4、NFATc4基因在癌症中表达降低,而WNT5amRNA表达水平未见显著差异。本研究首先通过扩大组织样本对测序结果进...
【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:148 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1差异基因的聚类分析
2.3?GO功能性分析??Go富集性分析包括生物学过程、细胞组分和分子功能三个层面。从生物过??程方面(图3),差异表达基因主要富集在细胞粘附,生物粘附和细胞-细胞信??号传导;从细胞组分(图3)方面,差异基因主要富集在通过质膜固有成分,蛋??白质细胞外基质和质膜固有;从分子功能方面(图3),差异表达基因主要富集??在与钙离子结合,离子结合,阳离子结合相关功能。??Biological?Process?Cellular?Component??.?intrinsic?to?membrane?二m:?丁.?nn-TT??organic?add?metabolic?process?plasma?membrane??systemOevelopmen.?_?cell?penphery? ̄?????mumcellularorganismal?development?L',一..—?一??single-multicelluiar?organism?process?ion?channel?complex??multicellular?organismal?process?plasma?membrane?part??nervcxjs?system?development?extracellular?region?part??developmental?process?extracellular?matrix??cell-cell?signaling?intrinsic?to?plasma?membrane??biologica
中发生?18460?个低甲基化(Hypo-DMC)和?31724个高甲基化(Hyper-DMC)位??点(表2)。基于DMC甲基化聚类分析发现,所有的癌旁组织与癌症组织可以??显著地分成两簇(图5)。不同基因组元件类型的DMC对基因转录表达影响不??同,CpG岛(CGI)甲基化与基因表达负相关,而重复序列(repeat)甲基化与??基因表达正相关(图6)。挑选DMC-CGI甲基化与差异基因表达呈负相关的基??因,DMC-repeat甲基化与差异基因表达呈正相关的基因,进一步对这些基因的??20??
本文编号:3075243
【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:148 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1差异基因的聚类分析
2.3?GO功能性分析??Go富集性分析包括生物学过程、细胞组分和分子功能三个层面。从生物过??程方面(图3),差异表达基因主要富集在细胞粘附,生物粘附和细胞-细胞信??号传导;从细胞组分(图3)方面,差异基因主要富集在通过质膜固有成分,蛋??白质细胞外基质和质膜固有;从分子功能方面(图3),差异表达基因主要富集??在与钙离子结合,离子结合,阳离子结合相关功能。??Biological?Process?Cellular?Component??.?intrinsic?to?membrane?二m:?丁.?nn-TT??organic?add?metabolic?process?plasma?membrane??systemOevelopmen.?_?cell?penphery? ̄?????mumcellularorganismal?development?L',一..—?一??single-multicelluiar?organism?process?ion?channel?complex??multicellular?organismal?process?plasma?membrane?part??nervcxjs?system?development?extracellular?region?part??developmental?process?extracellular?matrix??cell-cell?signaling?intrinsic?to?plasma?membrane??biologica
中发生?18460?个低甲基化(Hypo-DMC)和?31724个高甲基化(Hyper-DMC)位??点(表2)。基于DMC甲基化聚类分析发现,所有的癌旁组织与癌症组织可以??显著地分成两簇(图5)。不同基因组元件类型的DMC对基因转录表达影响不??同,CpG岛(CGI)甲基化与基因表达负相关,而重复序列(repeat)甲基化与??基因表达正相关(图6)。挑选DMC-CGI甲基化与差异基因表达呈负相关的基??因,DMC-repeat甲基化与差异基因表达呈正相关的基因,进一步对这些基因的??20??
本文编号:3075243
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