实时荧光环介导等温扩增检测毛癣菌属方法的建立

发布时间：2021-03-13 03:06

　　目的建立实时荧光环介导等温扩增（Real-time Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP）技术检测皮肤癣的方法,实现皮肤癣菌病的快速实验室诊断。方法通过在NCBI官网查找下载皮肤癣菌中毛癣菌属、小孢子菌属和表皮癣菌属临床分离率较高的菌种rRNA序列（18S rRNA,ITS1,5.8S rRNA,ITS2和28S rRNA）,运用DNASTAR Lasergene软件进行分析比对,寻找出毛癣菌属内高度保守的靶序列,且该段靶序列要与其他属存在差异,运用Primer Explorer V5设计LAMP引物。提取须癣毛癣菌NBRC6202基因组DNA作为模板筛选引物以及建立LAMP检测毛癣菌属的反应体系,以红色毛癣菌ATCC28188基因组DNA作为模板测试其敏感性和稳定性,以毛癣菌属以外的其他真菌、细菌基因组DNA验证LAMP反应体系的特异性。结果筛选的4套引物里,primer2的扩增效果较好,可在22 min检测出须癣毛癣菌,且可以特异地检测出红色毛癣菌、指间毛癣菌、疣状毛癣菌、许兰毛癣菌、紫色毛癣菌。本研究建立的毛癣菌属RT-LAMP检... 

【文章来源】：中华临床实验室管理电子杂志. 2020,8(04)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

毛癣菌属4套引物扩增曲线图

Primer2毛癣菌扩增曲线图

Primer2非毛癣菌扩增曲线图


本文编号：3079466