泛发性雀斑样痣三例SASH1基因突变研究
发布时间:2021-06-21 04:48
目的研究3例临床诊断为泛发性雀斑样痣患者的基因突变情况,以进一步明确诊断和为家系提供遗传咨询。方法收集3例先证者及父母的临床资料,提取外周血基因组DNA,对先证者行全外显子组测序,Sanger测序验证全外显子测序结果及父母相应位点变异情况。结果 3例先证者检出SASH1基因3种杂合变异,分别为c.15261527insAAGT(p.Leu511Lysfs*21),c.1520C>T(p.Ser507Phe)和c.1761C>G(p.Ser587Arg),致病性分级分别为致病变异和可能致病变异。其中,c.1520C>T(p.Ser507Phe)为文献未见报道的新变异。结论结合临床表型和基因检测结果,3例先证者均确诊为泛发性雀斑样痣。新变异的鉴定,丰富了人类基因突变数据库,为泛发性雀斑样痣的基因诊断和遗传咨询提供了有益信息。
【文章来源】:实用皮肤病学杂志. 2020,13(06)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
3例先证者家系图及家系SASH1基因Sanger测序验证结果
对测序数据进行生物信息学分析,以GRCh37/UCSC hg19作为参考基因组进行比对,依据严格的筛选标准对变异进行过滤,并添加人类基因组突变频率数据库(Genome Aggregation Database,gnom AD)东亚人群、千人基因组数据库(1000 Genomes Project)、Ref Seq参考序列数据库、人类基因突变数据库(the Human Gene Database,HGMD)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)以及蛋白功能预测软件等相关注释信息。对于未见文献报道及数据库收录的新变异,根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)发布的《序列变异解读的标准和指南》,对变异进行致病性分级。2 结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]泛发性雀斑样痣的临床特征及遗传机制[J]. 魏露露,崔红宙,郭书萍. 中华临床医师杂志(电子版). 2017(20)
[2]SASH1基因新杂合错义突变与遗传性泛发性色素异常症一家系相关[J]. 姚磊,曾磊,付旭辉,汤华阳,李蔚然,陈刚,孙良丹,高敏,王培光,杨森,张学军. 中华皮肤科杂志. 2016 (02)
本文编号:3240009
【文章来源】:实用皮肤病学杂志. 2020,13(06)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
3例先证者家系图及家系SASH1基因Sanger测序验证结果
对测序数据进行生物信息学分析,以GRCh37/UCSC hg19作为参考基因组进行比对,依据严格的筛选标准对变异进行过滤,并添加人类基因组突变频率数据库(Genome Aggregation Database,gnom AD)东亚人群、千人基因组数据库(1000 Genomes Project)、Ref Seq参考序列数据库、人类基因突变数据库(the Human Gene Database,HGMD)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)以及蛋白功能预测软件等相关注释信息。对于未见文献报道及数据库收录的新变异,根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)发布的《序列变异解读的标准和指南》,对变异进行致病性分级。2 结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]泛发性雀斑样痣的临床特征及遗传机制[J]. 魏露露,崔红宙,郭书萍. 中华临床医师杂志(电子版). 2017(20)
[2]SASH1基因新杂合错义突变与遗传性泛发性色素异常症一家系相关[J]. 姚磊,曾磊,付旭辉,汤华阳,李蔚然,陈刚,孙良丹,高敏,王培光,杨森,张学军. 中华皮肤科杂志. 2016 (02)
本文编号:3240009
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