银屑病蛋白质翻译后修饰赖氨酸2-羟基异丁酰化研究

发布时间：2024-03-21 21:59

　　研究目的:赖氨酸2-羟基异丁酰化是一种新发现的蛋白质翻译后修饰。这种修饰是蛋白质酰化作用的一种重要类型,已在多种生物中被发现,并参与了一些重要的代谢过程。但其在疾病尤其是银屑病中的变化及其作用尚未被认知。本研究通过首次定量来自45对银屑病患者的皮损和非皮损皮肤组织样本的赖氨酸2-羟基异丁酰化,并进行比较和生物信息学分析,以探索赖氨酸2-羟基异丁酰化修饰在银屑病中的变化及意义。研究方法:采集45对寻常型银屑病患者的皮损和非皮损皮肤组织样本,共分为三个样本池以进行重复试验。处理皮肤组织提取蛋白质,进行串联质谱标签标记,高效液相色谱法分级分离,使用赖氨酸2-羟基异丁酰化抗体进行目标的亲和富集,随后进行LC-MS/MS定量分析。比较皮损组织和非皮损组织的赖氨酸2-羟基异丁酰化修饰水平的差异;将差异修饰位点同已发表的银屑病基因组、转录组、蛋白组数据进行串联分析;将差异修饰位点通过基因本体论注释、motif分析、结构域分析及基因和基因组百科全书库检索,以进行生物信息学层面的分析和比较。研究结果:在银屑病患者皮损和非皮损皮肤组织中均发现了大量赖氨酸2-羟基异丁酰化修饰。同时,皮损和非皮损皮肤组织之间...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.（A）Pearson相关系数分析3个重复试验进行的可重复性，sl/Nsl表示PP/PN

安徽医科大学硕士学位论文12我们共进行了3次重复试验，并通过Pearson相关分析对结果进行了分析，再现性分析结果表明数据是可靠的（图1A）。我们将得到的数据通过基因本体论分析（GeneOntology，GO分析）进行蛋白质组注释，并将蛋白质分为三类：生物学过程、细胞成分和分子功....

图2.质谱数据的质量检验

安徽医科大学硕士学位论文16在PP和PN样本之间的比较中，我们发现蛋白质S100A9（比率=0.14，p=0.000371）、S100A2（比率=0.372，p=0.0239）、SERPINB4（比率=0.392，p=0.046）、HSP90B1（比率=2.233，p=0.021....

图3.（A）被修饰氨基酸的热图分析

安徽医科大学硕士学位论文20图3.（A）被修饰氨基酸的热图分析。（B）所有鉴定位点的motif分析。（C）每个motif的肽百分比。Fig3.(A)Theheatmapanalysisofenrichedanddepletedaminoacids.(B)Motifanalysis....

图4.（A）Khib修饰上调的蛋白质的GO功能分析

安徽医科大学硕士学位论文21饰上调的白质与细胞和细胞外环境之间的沟通有关，如细胞外水泡囊泡、细胞外细胞器、细胞外膜细胞器、细胞质核周区域；在分子功能类别中，大多数被Khib修饰上调的蛋白质主要涉及的功能有整联蛋白结合、肌动蛋白丝结合、低密度脂蛋白颗粒受体结合、脂蛋白颗粒受体结合、....

本文编号：3934191