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杏仁核点燃大鼠癫痫持续状态后海马miRNA表达谱与神经元凋亡的相关性研究

发布时间:2018-03-29 01:36

  本文选题:癫痫持续状态 切入点:miRNA 出处:《泰山医学院》2014年硕士论文


【摘要】:目的 癫痫是中枢神经系统常见病,目前影响着全球0.5%~1%的人群。选择性神经元死亡和苔藓纤维芽生等病理生理过程与癫痫的发生及发展有关。microRNA(miRNA)是一类内源性的具有调控功能的非编码小RNA,它通过诱导沉默复合体形成来降解靶mRNA,或者阻遏靶mRNA的翻译。最近越来越多的文献报道,miRNA在中枢神经系统疾病的发生发展中发挥着极为重要的作用。本实验通过建立杏仁核点燃癫痫持续状态模型的动物实验来探讨海马miRNA表达谱的变化,并且对癫痫持续状态后差异表达的miRNA与海马神经元凋亡的关系进行了评估。 研究方法 1、首先选用6~8周龄健康雄性SD大鼠,建立杏仁核点燃大鼠癫痫持续状态模型,于造模成功后24小时提取大鼠脑组织海马区miRNA,采用高通量测序技术研究癫痫持续状态后大鼠海马区脑组织与正常大鼠海马区脑组织中miRNA表达谱的差异。 2、随后将筛选出的差异表达明显的6个miRNA用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, qRT-PCR)进行验证。 3、应用靶基因预测软件(RNAhybrid和miRand)对以上6个miRNA的目的候选靶mRNA进行了预测,并使用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)进行通路分析。 4、最后检测此6个miRNA在癫痫持续状态后不同时间点(4小时,24小时,1周和3周)的动态变化,与此同时应用Nissel染色和TUNEL(Terminal deoxynucleotidyltransferase-mediated dUTP end-labeling assay)染色检测癫痫持续状态后不同时间点海马神经元生存和凋亡情况,进一步评估筛选出的miRNA是否与癫痫持续状态后神经元凋亡有关。 结果 1、杏仁核点燃癫痫持续状态大鼠和对照组正常大鼠海马组织差异表达的miRNA:在癫痫持续状态后24小时检测出差异表达的miRNA共37个,其中上调的miRNA有34个,,下调的有3个。进一步筛选出在癫痫持续状态后变化大于2倍的(P<0.01且P≠0)6个miRNA (miR-874-3p, miR-20a-5p, miR-345-3p, miR-365-5p, miR-764-3p andmiR-99b-3p),在以上6个筛选出的miRNA中,上调的miRNA表达差异最大的是miR-879-5p (4.177倍),差异最小的是miR-764-3p (2.078倍),下调大于2倍的是miR-99b-3p。 2、采用qRT-PCR对结果进行验证:将筛选出的变化明显的6个miRNA进行qRT-PCR验证,miR-874-3p, miR-20a-5p, miR-345-3p, miR-365-5p, miR-764-3p的表达量与正常对照组相比明显增高,而miR-99b-3p的表达量明显下降,此与高通量测序结果一致。 3、靶基因预测:利用RNAhybrid和miRand两个靶基因预测软件对筛选出的6个miRNA的靶mRNA进行预测,KEGG通路分析进一步显示此6个miRNA的靶基因在癫痫持续状态后凋亡通路中发挥十分重要的作用。 4、miRNA的动态变化和Nissel染色及TUNEL染色的病理结果:以上miRNA在癫痫持续状态后1周表达量的变化最明显,Nissel染色及TUNEL染色结果显示在癫痫持续状态后海马区脑组织生存神经元减少,凋亡神经元增多,且在癫痫持续状态后1周时最明显,这与筛选出的miRNA的动态变化相一致。进一步分析miRNA和癫痫持续状态后凋亡的关系显示miR-365-5p和miR-99b-3p的差异表达水平与癫痫持续状态后神经元凋亡具有明显相关性。 结论 大鼠癫痫持续状态后,海马区脑组织中miRNA的表达量发生明显变化,并且差异表达的miRNA是癫痫持续状态后神经元凋亡重要的调节因子。
[Abstract]:objective
Epilepsy is a common disease of the central nervous system, currently affecting the global 0.5%~1% population. Selective neuronal death and mossy fiber sprouting in the pathophysiological processes of epilepsy and the occurrence and development of.MicroRNA (miRNA) is a kind of endogenous with regulationfunction encoding non small RNA, it can induce silencing complex formation to degradation of target mRNA. Or repression of target mRNA translation. More recent reports in the literature, miRNA in the central nervous system disease development plays an extremely important role. By establishing the animal experiment of amygdala kindling epileptic state model to explore the expression of hippocampal miRNA, and assess the relationship of miRNA expression of epilepsy after status epilepticus and apoptosis of hippocampus neurons.
research method
1, the first 6~8 weeks old healthy male SD rats to establish rat amygdala kindling model of status epilepticus, 24 hours after the success in modeling the extraction of brain tissue in rats hippocampus miRNA, using high-throughput sequencing technology to study epilepsy expression profiling of miRNA in hippocampus of rats with brain tissue and brain tissue in the hippocampus of normal rats.
2, then the 6 differentially expressed miRNA were identified by real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction (Real-time Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, qRT-PCR).
3, we applied the target gene prediction software (RNAhybrid and miRand) to predict the above 6 miRNA target candidate mRNA, and used KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) to conduct path analysis.
4, finally detect the 6 miRNA at different time points after status epilepticus (4 hours, 24 hours, 1 weeks and 3 weeks) the dynamic changes at the same time, using Nissel staining and TUNEL (Terminal deoxynucleotidyltransferase-mediated dUTP end-labeling assay) were detected at different time points after status epilepticus in hippocampal neuron survival and apoptosis, further evaluation whether the selected miRNA and status epilepticus induced neuronal apoptosis.
Result
1, status epilepticus rats and expression of hippocampus of rats in the control group of normal miRNA in amygdala kindled epileptic state after 24 hours to detect the expression of miRNA in a total of 37, which increased 34 in miRNA, down 3. Further screened in status epilepticus after changes greater than 2 times (P < 0.01 and P = 0) and 6 miRNA (miR-874-3p, miR-20a-5p, miR-345-3p, miR-365-5p, miR-764-3p, andmiR-99b-3p) in more than 6 screened miRNA, upregulation of miRNA expression of miR-879-5p was the highest (4.177 times), the difference is the smallest miR-764-3p (2.078 times), down more than 2 times is miR-99b-3p.
2, using qRT-PCR to verify the results: 6 the change of miRNA screened obvious qRT-PCR validation, miR-874-3p, miR-20a-5p, miR-345-3p, miR-365-5p, miR-764-3p expression was significantly increased compared with normal control group, while the expression of miR-99b-3p was obviously decreased, the sequencing results were consistent with the high throughput.
3, target gene prediction: we use RNAhybrid and miRand two target gene prediction software to predict the target miRNA of 6 miRNA targets. KEGG pathway analysis further shows that these 6 miRNA target genes play a very important role in the apoptotic pathway after status epilepticus.
4, the pathological results of the dynamic changes of miRNA and Nissel staining and TUNEL staining: more than miRNA in status epilepticus after 1 weeks, the expression of the most obvious, Nissel staining and TUNEL staining showed reduced survival of neurons in hippocampus in epileptic state, the apoptosis of neurons increased, and in 1 weeks after epilepsy continue to state the most obvious, consistent with the dynamic changes of the screened miRNA. Further analysis of miRNA and apoptosis after status epilepticus relationship differences between miR-365-5p and miR-99b-3p expression and neuronal apoptosis after status epilepticus has obvious relevance.
conclusion
After the status epilepticus in rats, the expression level of miRNA in hippocampal area changed significantly, and the differential expression of miRNA was an important regulator of neuronal apoptosis after status epilepticus.

【学位授予单位】:泰山医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R742.1

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本文编号:1679006

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