APE1/REF-1和P2RY2基因多态性与中国汉族人群缺血性脑卒中的相关性研究

发布时间：2021-01-06 20:58

　　目的:缺血性卒中（ischemic stroke,IS）是一种急性神经疾病事件,可导致神经组织的死亡。由于高血压的更好控制和吸烟水平下降使近年来在发达国家中IS的发生率有所下降。随着人口老龄化,很多国家IS患者的绝对数量仍在继续增加。我们对于IS的传统风险因素已经了解了很多。但是IS的遗传病学体系,仍然很大程度上是未确定的。近年来,专家们使用基因多态性关联分析方法,已经证实了一些新的与IS有关的易感性基因,但这些试验结果尚未在不同地区、不同种族中得到重复以及肯定。作为IS的高发地区的主要人群,在中国北方汉族人群中进行IS易感基因的病例对照研究有十分重要的意义。在IS的病理生理基础中,动脉粥样硬化的形成以及发展是至关重要的。而在动脉粥样硬化的形成及发展过程中最重要的就是炎症反应。因此本研究选取了两个与炎症相关的基因,P2RY2基因和APE1/REF-1基因,采用回顾性分析及病例对照研究方法,分析了P2RY2基因（rs4944831,rs1783596,rs4944832）和APE1/REF-1基因（rs1760944,rs3136817,rs1130409）的基因型、等位基因和单倍型在I... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：105 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语
第一部分 P2RY2基因多态性与缺血性卒中的相关性研究
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 主要试剂和仪器
            2.1.1 主要试剂
            2.1.2 主要实验仪器
        2.2 研究对象和分组
            2.2.1 病例组的入选标准
            2.2.2 正常对照组的入选标准
            2.2.3 一般临床资料的采集
        2.3 实验方法
            2.3.1 血样采集
            2.3.2 全血基因组DNA提取步骤
            2.3.3 检测DNA含量及纯度
            2.3.4 遗传标记的选择
        2.4 Multiplex SNaPshot（多重单碱基延伸SNP分型）技术检测P2RY2基因rs4944831,rs1783596,rs4944832多态性
            2.4.1 SNP的确定及Multiplex SNaPshot方法的选择
            2.4.2 Multiplex SNaPshot的检测原理
            2.4.3 具体操作步骤
        2.5 统计学分析
            2.5.1 数据库建立
            2.5.2 Hardy-Weinberg平衡（HWE）
            2.5.3 等位基因及基因型频率
            2.5.4 连锁不平衡分析（Linkage disequilibrium,LD）
            2.5.5 单倍型分析
    3 结果
        3.1 临床及生化资料
        3.2 P2RY2基因各位点基因型判定结果
            3.2.1 PCR产物电泳图
            3.2.2 Multiplex SNaPshot技术判定三个SNP位点基因型检测结果（附：单位点分型图）
        3.3 P2RY2基因各SNP位点基因型HWE检验结果
        3.4 P2RY2基因各候选位点基因型及等位基因的频率比较
            3.4.1 IS组与对照组P2RY2基因各候选位点基因型及等位基因的频率
            3.4.2 LAA组与对照组P2RY2基因各候选位点基因型及等位基因频率
            3.4.3 SAO组与对照组P2RY2基因各候选位点基因型及等位基因频率
            3.4.4 男性IS组与男性对照组P2RY2基因各候选位点基因型及等位基因频率
            3.4.5 女性IS组与女性对照组P2RY2基因各候选位点基因型及等位基因频率
        3.5 P2RY2基因连锁不平衡分析
        3.6 P2RY2基因单倍型分析
    4 讨论
    5 结论
第二部分 APE1/REF-1基因多态性与缺血性卒中的相关性
    6 前言
    7 材料和方法
        7.1 主要试剂和仪器
            7.1.1 主要试剂及生产厂家
            7.1.2 主要实验仪器
        7.2 研究对象和分组
            7.2.1 病例组的入选标准
            7.2.2 正常对照组的入选标准
            7.2.3 一般临床资料的采集
        7.3 实验方法
            7.3.1 血样采集
            7.3.2 全血基因组DNA提取步骤
            7.3.3 检测DNA含量及纯度
            7.3.4 遗传标记的选择
        7.4 Multiplex SNaPshot检测APE1/REF-1基因位点多态性
            7.4.1 SNP的确定及Multiplex SNaPshot方法的选择
            7.4.2 Multiplex SNaPshot的检测原理
            7.4.3 具体实验操作步骤
            7.4.4 基因型的判定
            7.4.5 基因分型质量控制
        7.5 统计学分析
            7.5.1 数据库建立
            7.5.2 Hardy-Weinberg平衡（HWE）
            7.5.3 等位基因及基因型频率
            7.5.4 连锁不平衡（Linkage disequilibrium,LD）分析
            7.5.5 单倍型分析
    8 结果
        8.1 临床及生化资料
        8.2 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409位点基因型判定
            8.2.1 PCR产物电泳图
            8.2.2 MultiplexSNaPshot技术判定基因型检测结果（附：单位点分型图）
        8.3 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409各位点HWE检验结果
        8.4 IS组及各亚组与对照组SNPs等位基因及基因型频率的比较
            8.4.1 IS组与对照组APE1/REF-1基因型比较结果
            8.4.2 LAA组与对照组APE1/REF-1基因型和等位基因频率比较
            8.4.3 SAO组与对照组APE1/REF-1基因型和等位基因频率比较
            8.4.4 IS组及对照组男性APE1/REF-1基因各位点基因型和等位基因频率
            8.4.5 女性APE1/REF-1基因各位点基因型和等位基因频率
        8.5 APE1/REF-1基因连锁不平衡分析
        8.6 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409位点单倍型分析
            8.6.1 IS组与对照组APE1/REF-1基因rs1760944-rs3136817-rs1130409单倍型频率比较
            8.6.2 不同IS亚组与对照组APE1/REF-1基因单倍型频率比较
            8.6.3 不同性别IS组与对照组APE1/REF-1基因单倍型频率比较
    9 讨论
    10 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]局部晚期非小细胞肺癌患者血清中Ape1/Ref-1、ICAM-1及IL-17A水平与放射性肺炎发生的相关性研究[J]. 郭雷鸣,丁高峰,徐文才,葛红,蒋月,陆寓非.  中国肺癌杂志. 2018(05)
[2]Associations between thromboxane A synthase 1 gene polymorphisms and the risk of ischemic stroke in a Chinese Han population[J]. Lei Li,Zhi-yi He,Yan-zhe Wang,Xu Liu,Li-ying Yuan.  Neural Regeneration Research. 2018(03)



本文编号：2961248