难治性癫痫脑组织miRNA表达差异
发布时间:2021-06-13 17:44
目的:采用miRNA芯片技术检测难治性癫痫患者脑组织中miRNA表达变化,筛选出表达差异有意义的miRNA,探讨其在难治性癫痫发病中的作用及意义,为难治性癫痫治疗提供实验依据。方法:1.标本获得实验组:从已建立的重庆医科大学附属第一医院难治性癫痫患者术后脑组织库中随机抽取6例样本。对照组:重庆医科大学附属第一医院非癫痫患者术后脑组织库中随机抽取4例样本。2.应用Trizol试剂提取总RNA,甲醛琼脂糖凝胶电泳测定RNA完整性及分光光度计分别于240nm、260nm和280nm测定吸光度值以判定总RNA纯度及浓度。3.miRNA微阵列芯片研究难治性癫痫患者脑组织与非癫痫患者脑组织中miRNA表达差异,筛选出倍数变化(F/C)≥1.5且P<0.05的miRNA并对表达差异的miRNA进行聚类分析。结果:通过miRNA芯片筛选出表达差异显著miRNA基因13个,其中上调基因11个,分别是miR-10a、miR-374c、miR-376a、miR-425、miR-9、miR-224、hsa-miR-26a、let-7c、let-7a、miR-23c及miR-378c,下调基因2个,分别是miR...
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
RNA凝胶电泳图
图 4.1 表达差异 miRNA 火山图Figure 4.1 volcano plot of differential miRNA注:横 标为 log2(F/C), 标为-log (P value),红色圆点即为变化超过 1.5 倍且 PiRNA。类分析由于各样本间 miRNA 表达差异不同,将所得芯片数据进行聚类分析促使越相似的 miRNA 聚在一起,得到树状图并以热图方式显示使结果更加直,以此分辨不同样本间不同 miRNA 表达差异,见图 8.1。
18图 5.1 表达差异 miRNAs 聚类分析图igure 5.1 Hierarchical clustering images of differential miRNAs 个 miRNA, 每 代表 个样本。左侧为 miRNA 聚 树,顶端为样本聚 树。红色示色示相对较低表达。顶端为颜色标尺,从左至右依次标书差异表达由低到高。
【参考文献】:
期刊论文
[1]肝细胞癌组织中microRNA表达谱研究[J]. 王传玺,宋伟,李增军,宋宝,吴德华,孙爱民,陈龙华. 南方医科大学学报. 2010(05)
[2]MicroRNA在人结肠癌干细胞中的表达谱[J]. 邹健,于晓峰,虞阳,张颖,史冬梅,董洁,李天奇,刘雪静. 世界华人消化杂志. 2010(02)
[3]与心脏相关的miRNAs研究[J]. 刘博,秦永文. 国际心血管病杂志. 2009(01)
[4]32例原发性中枢神经系统恶性淋巴瘤临床分析及文献复习[J]. 易基群,林桐榆,何友兼,黄慧强,夏忠军,夏云飞,徐瑞华,郭颖,管忠震. 癌症. 2006(04)
本文编号:3228009
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
RNA凝胶电泳图
图 4.1 表达差异 miRNA 火山图Figure 4.1 volcano plot of differential miRNA注:横 标为 log2(F/C), 标为-log (P value),红色圆点即为变化超过 1.5 倍且 PiRNA。类分析由于各样本间 miRNA 表达差异不同,将所得芯片数据进行聚类分析促使越相似的 miRNA 聚在一起,得到树状图并以热图方式显示使结果更加直,以此分辨不同样本间不同 miRNA 表达差异,见图 8.1。
18图 5.1 表达差异 miRNAs 聚类分析图igure 5.1 Hierarchical clustering images of differential miRNAs 个 miRNA, 每 代表 个样本。左侧为 miRNA 聚 树,顶端为样本聚 树。红色示色示相对较低表达。顶端为颜色标尺,从左至右依次标书差异表达由低到高。
【参考文献】:
期刊论文
[1]肝细胞癌组织中microRNA表达谱研究[J]. 王传玺,宋伟,李增军,宋宝,吴德华,孙爱民,陈龙华. 南方医科大学学报. 2010(05)
[2]MicroRNA在人结肠癌干细胞中的表达谱[J]. 邹健,于晓峰,虞阳,张颖,史冬梅,董洁,李天奇,刘雪静. 世界华人消化杂志. 2010(02)
[3]与心脏相关的miRNAs研究[J]. 刘博,秦永文. 国际心血管病杂志. 2009(01)
[4]32例原发性中枢神经系统恶性淋巴瘤临床分析及文献复习[J]. 易基群,林桐榆,何友兼,黄慧强,夏忠军,夏云飞,徐瑞华,郭颖,管忠震. 癌症. 2006(04)
本文编号:3228009
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