基于生物信息学分析癫痫脑内星形胶质细胞炎性激活机制

发布时间：2021-08-20 17:35

　　目的挖掘癫痫脑内星形胶质细胞异常炎性激活的关键信号分子,为进一步阐明神经免疫促痫机理提供生物信息学基础。方法 NCBI GEO数据库获取癫痫动物模型（GSE73878）和星形胶质细胞炎性激活细胞模型（GSE73022）基因芯片结果,GEO2R在线筛选共有差异表达基因（DEGs）,DAVID数据库进行GO功能模块和KEGG通路富集分析,STRING数据库和Cytoscape软件构建DEGs蛋白质互作网络,多算法筛选Hub基因,最后利用GEPIA数据库在易发癫痫的低级别胶质瘤患者中验证。结果两芯片交集共获得72个DEGs,主要富集在调控免疫反应、细胞因子活力等过程,病毒感染类似信号、Toll样受体信号等通路;59个基因可构成大的蛋白互作网络,其中24个基因组成核心模块,多算法筛选结合GEIPA数据库发现Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1是Hub基因。结论癫痫脑内星形胶质细胞异常炎性激活与Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1等基因关系密切,其可能是调控癫痫脑内神经免疫促痫过程的新靶点。 

【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(23)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

共有DEGs筛选

GO和KEGG富集分析

PPI network分析

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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本文编号：3353929