MicroRNA-134调控突触重塑在癫痫发生发展中的作用机制研究
发布时间:2021-11-03 05:29
癫痫作为神经内科常见疾病,发病机制尚不清楚,目前观点认为除遗传、环境外,突触重塑、离子通道异常、神经元细胞凋亡以及外伤、炎症等都可能是癫痫的病因。其中,以苔藓纤维出芽为基本病理改变的突触可塑性则是癫痫诸多病理生理过程共同的基础。癫痫的反复发作导致突触重塑,形成异常网络结构,这种异常的网络结构又会促使癫痫反复发作,并最终发展为难治性癫痫。miRNAs能够在转录后水平调控癫痫发生发展的多个环节,且在癫痫中也存在多种miRNAs的表达异常。本研究通过高通量测序技术对癫痫患者海马组织中miRNAs表达谱变化进行研究,筛选差异表达的miRNAs,利用生物信息学技术对这些差异表达的miRNAs进行靶基因预测,并通过双荧光素酶报告基因验证靶标关系,最后在构建的体内外模型中研究miRNA-134影响癫痫发生发展的具体作用机制,为癫痫的病因学研究和抗癫痫药物开发提供理论基础。目的:1.研究癫痫患者海马组织中miRNAs表达谱的变化,筛选在癫痫中差异表达的miRNAs并进行靶基因预测;2.体外培养大鼠原代海马神经元并神经元鉴定;构建miR-134过表达载体和CREB、SYT11、MAPT双荧光素酶报告基因...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:119 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
Cleantag碱基质量分布图
基在 reads 中的位置,Y 轴则代表碱基的质量值,图中每点表示达到此质量的碱基数量,数量越多颜色越深。本次高通量测序所得碱基质量绝大部分分布在 2以上,说明测序质量较好。在小 RNA 长度分布图中,X 轴为小 RNA 长度,轴为小 RNA 所占比例,直接反映测序数据中小 RNA 的种类,由图可见,miRN>piRNA>siRNA。表 1.2 各样品测序数据量统计S a mple n ame S e quence t ype R a w t ag c ount C l ean t ag c ount P e rcentage(%)T1 SE50 11,977,688 11,035,541 92.13T2 SE50 11,699,993 10,731,760 91.57T3 SE50 12,253,944 11,143,668 90.94C SE50 12,415,591 11,462,527 92.32
吉林大学博士学位论文1.2.2 基因组比对将数据过滤后得到的 clean tag 与包括 miRBase[33]、Rfam[34]、siRNA、piRNA、snoRNA 等在内的已知数据库进行比对,表 1.3 为比对统计,图 1.3 显示比对情况。表 1.3 基因组比对统计S a mple n ame T o tal t ag M a pped t ag P e rcentage(%)T1 1 1 ,035,541 1 0 ,915,609 9 8 .91T2 1 0 ,713,760 1 0 ,532,355 9 8 .31T3 1 1 ,143,668 1 0 ,988,303 9 8 .61C 1 1 ,462,527 1 1 ,277,721 9 8 .39
本文编号:3473144
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:119 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
Cleantag碱基质量分布图
基在 reads 中的位置,Y 轴则代表碱基的质量值,图中每点表示达到此质量的碱基数量,数量越多颜色越深。本次高通量测序所得碱基质量绝大部分分布在 2以上,说明测序质量较好。在小 RNA 长度分布图中,X 轴为小 RNA 长度,轴为小 RNA 所占比例,直接反映测序数据中小 RNA 的种类,由图可见,miRN>piRNA>siRNA。表 1.2 各样品测序数据量统计S a mple n ame S e quence t ype R a w t ag c ount C l ean t ag c ount P e rcentage(%)T1 SE50 11,977,688 11,035,541 92.13T2 SE50 11,699,993 10,731,760 91.57T3 SE50 12,253,944 11,143,668 90.94C SE50 12,415,591 11,462,527 92.32
吉林大学博士学位论文1.2.2 基因组比对将数据过滤后得到的 clean tag 与包括 miRBase[33]、Rfam[34]、siRNA、piRNA、snoRNA 等在内的已知数据库进行比对,表 1.3 为比对统计,图 1.3 显示比对情况。表 1.3 基因组比对统计S a mple n ame T o tal t ag M a pped t ag P e rcentage(%)T1 1 1 ,035,541 1 0 ,915,609 9 8 .91T2 1 0 ,713,760 1 0 ,532,355 9 8 .31T3 1 1 ,143,668 1 0 ,988,303 9 8 .61C 1 1 ,462,527 1 1 ,277,721 9 8 .39
本文编号:3473144
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