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COX-2基因rs20417、rs689466位点多态性与帕金森病发病相关性分析

发布时间:2021-11-08 09:19
  目的:本研究旨在探讨环氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,COX-2)基因的rs20417、rs689466位点多态性与帕金森病(Parkinson’s disease,PD)的相关性。方法:使用病例对照的研究方法,收集225例PD患者及231例年龄、性别相匹配的健康对照组的外周血并提取DNA,利用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)、琼脂糖凝胶电泳、直接测序法测定COX-2基因rs20417、rs689466位点序列,从而进行多态性分析。结果:PD组COX-2基因rs20417位点测序后发现GG型196例、CG型29例,未发现CC型,G等位基因频率为93.6%,C等位基因频率为6.4%,对照组COX-2基因rs20417位点测序后发现GG型207例、CG型24例,未发现CC型,G等位基因频率为94.8%,C等位基因频率为5.2%,PD组及对照组基因型分布及等位基因频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。进一步分层分析,PD组与对照组在年龄、性别、病情严重程度亚组间rs20417位点基因型分布以及等位基因频率比较,差异均无统计学... 

【文章来源】:新疆医科大学新疆维吾尔自治区

【文章页数】:47 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

COX-2基因rs20417、rs689466位点多态性与帕金森病发病相关性分析


PCR产A:rs20417(604bp)位点A

位点,测序,基因型,等位基因频率


新疆医科大学硕士学位论文15图2rs20417位点测序图A:rs20417CG型B:rs20417GG型Fig.2Sequencediagramofrs20417siteA:CGtypeofrs20417B:GGtypeofrs204174PD组和对照组COX-2基因rs20417位点基因型分布和等位基因频率4.1PD组与对照组rs20417位点基因型分布与等位基因频率比较PD组和对照组rs20417位点中基因型GG与CC的频率分别为87.1%、12.9%和89.6%、10.4%,等位基因G、C的频率分别为93.6%、6.4%和94.8%、5.2%,基因型分布差异无统计学意义(2=0.693,P=0.405),等位基因频率比较,差异无统计学意义(2=0.650,P=0.420),见表4。表4PD组与对照组rs20417位点基因型分布与等位基因频率比较Table4Comparisonofrs20417genotypeandalleledistributionbetweenPDandcontrolgroup组别基因型(%)P等位基因(%)PGGCGGCPD组196(87.1)29(12.9)0.405421(93.6)29(6.4)0.420对照组207(89.6)24(10.4)438(94.8)24(5.2)4.2不同年龄分层(≤50岁/>50岁)PD组和对照组rs20417位点基因型分布及等位基因频率比较PD组和对照组rs20417位点EOPD组与≤50岁对照组基因型分布比较,差异无统计学意义(2=0.835,P=0.361),等位基因频率比较,差异无统计学意义(2=0.756,P=0.385);LOPD组与>50岁对照组基因型分布比较,差异无统计学意义(2=0.451,P=0.502),等位基因频率比较,差异无统计学意义(2=0.425,P=0.514);EOPD组与LOPD组基因型分布比较,差异无统计学意义(2=2.355,

位点,测序,基因型,等位基因频率


新疆医科大学硕士学位论文17表7不同病情严重程度rs20417位点基因型分布和等位基因频率分布的比较Table7Thecomparisonofrs20417genotypeandallelefrequenciesindifferentseverityofdisease组别基因型(%)P等位基因(%)PGGCGGCH-Y<3126(85.1)22(14.9)0.349266(92.6)22(7.4)0.347H-Y≥369(89.5)8(10.5)144(94.7)8(5.3)5COX-2基因rs689466位点测序结果病例组共送检225例,rs689466位点TT型107例,CT型87例,CC型31例。对照组共送检231例,rs689466位点TT型84例,CT型102例,CC型45例,直接测序结果见图3,可见图中纯合为单峰图,杂合则为双峰图。图3rs689466位点测序图A:rs689466CC型B:rs689466CT型C:rs689466TT型Fig.3Sequencediagramofrs689466siteA:CCtypeofrs689466B:CTtypeofrs689466C:TTtypeofrs6894666PD组和对照组COX-2基因rs689466位点基因型分布和等位基因频率6.1PD组与对照组rs689466位点基因型分布与等位基因频率比较PD组和对照组rs689466位点中基因型TT、TC、TT的频率分别为47.6%、38.7%、

【参考文献】:
期刊论文
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[10]COX-2对帕金森病小鼠黑质内多巴胺能神经元的毒性作用[J]. 师亮,张宇新,张作凤,陈浩.  第四军医大学学报. 2006(18)



本文编号:3483450

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