颅咽管瘤差异LncRNA-mRNA表达谱初步筛查研究

发布时间：2021-11-10 06:54

　　目的:牙釉质型颅咽管瘤（Adamantinomatous craniopharyngiomas,ACPs）是鞍区常见的良性上皮肿瘤,但临床上具有较强的侵袭性。最新的研究表明CTNNB1基因的突变会引起Wnt/β-Catenin信号通路的过度激活,这种改变成为了ACPs发生的分子生物学基础。目前LncRNA在ACPs中的研究较少。因此,本研究旨在利用新一代测序技术检测牙釉质型颅咽管瘤中LncRNA-mRNA的表达谱,并进一步筛选及验证ACPs中显著性差异LncRNA,进而预测ACPs的靶基因,为后期揭示ACPs在发病、侵袭性生长的分子机制奠定基础,同时为ACPs的早期诊断、预后及治疗策略提供新的研究思路。方法:收集2018年2月至2019年1月时期在南昌大学第一附属医院神经外科进行手术、确诊为ACPs患者的样本（肿瘤核心实质性组织和肿瘤外周包膜组织）。随机选择3例患者的实质及包膜组织进行新一代测序检测LncRNA-mRNA的表达谱。通过生物信息学对差异LncRNAs和mRNA进行GO注释及KEGG富集分析。利用分析结果及文献研究报道,选定6个显著性差异的LncRNAs,运用实时荧光定量P... 

【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

LncRNA测序实验流程

15B．mRNA 差异基因火山图基因火山图 A.LncRNAB.mRNA 横坐标为芯片值标准化后某条转录本在周包膜区域组织均值间比值倍数的以 2 为底的对数，纵坐标为某条转录 t 检验 P 值的以 10 为底的负对数。红色点表示上调，蓝色点表示下调，示没有差异

差异基因聚类图A.LncRNAB.mRNA以log10（FPKM+1）值进行聚类，红色表示高


本文编号：3486791