基于转录组测序筛选HIE差异表达基因及其作用机制研究
发布时间：2021-11-10 17:43
新生儿缺氧缺血性脑病（Hypoxic-ischemic encephalopathy,HIE）是指围产期窒息所引起的脑损伤,是导致新生儿中枢神经系统功能障碍的最常见的疾病之一。缺氧缺血性脑损伤的病理生理改变包括脑细胞能量代谢衰竭、脑血管自主调节障碍、兴奋性氨基酸神经毒性、氧自由基生成增多、炎性细胞因子释放增加及凋亡基因激活等。这些环节紧密联系,互为因果,彼此重叠,形成恶性循环,最终导致神经细胞死亡。目前治疗以支持疗法、控制惊厥和治疗脑水肿为主,无特效药物治疗。故亟待深入研究HIE发病的分子机制,发现新的治疗靶点与策略。实验目的:本研究为明确新生大鼠HIE发生时转录组的差异表达,构建差异基因表达谱。基于生物信息学方法筛选HIE调控靶点,采用分子生物学方法验证相关靶点表达,并探讨基于Nrf2调控对脑保护的作用机制。实验方法:本研究以7日龄新生大鼠为研究对象。采用经典造模方法,将7日龄新生大鼠麻醉后结扎左侧颈总动脉,术后恢复2小时后置于8%氧浓度的缺氧箱中,缺氧2小时。采用预防给药方式,于造模前3天给药。术后24小时取大脑组织样本。采用转录组测序构建差异基因表达谱,基于聚类分析、GO及KEG...
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：122 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
生物信息分析流程图
、高丰度表达基因。由 FPKM 值的箱线图，区域分组（Con 组）和模型组（HIE 组）基因表达的丰度及范围内包含的基因数量。由图 1.2 可知，基因表达丰 1.3 所示，各组 FPKM>10 的基因均超过 5000 个。
图 1.3 所示，各组 FPKM>10 的基因均超过 5000 个。图 1.2 FPKM 值的箱线图Fig.1.2 Boxplot for FKPM Values
【参考文献】：
期刊论文
[1]Nrf2基因敲除对小鼠蛛网膜下腔出血后小胶质细胞/巨噬细胞活化的影响[J]. 李桃,王汉东,丁宇,何进,丁可,陆新宇,徐建国,韦武亭. 医学研究生学报. 2015(01)
[2]Molecular mechanism and functional consequences of lansoprazole-mediated heme oxygenase-1 induction[J]. Stephanie Schulz-Geske,Kati Erdmann,Ronald J Wong,David K Stevenson,Henning Schrder,Nina Grosser. World Journal of Gastroenterology. 2009(35)
本文编号：3487665
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：122 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
生物信息分析流程图
、高丰度表达基因。由 FPKM 值的箱线图，区域分组（Con 组）和模型组（HIE 组）基因表达的丰度及范围内包含的基因数量。由图 1.2 可知，基因表达丰 1.3 所示，各组 FPKM>10 的基因均超过 5000 个。
图 1.3 所示，各组 FPKM>10 的基因均超过 5000 个。图 1.2 FPKM 值的箱线图Fig.1.2 Boxplot for FKPM Values
【参考文献】：
期刊论文
[1]Nrf2基因敲除对小鼠蛛网膜下腔出血后小胶质细胞/巨噬细胞活化的影响[J]. 李桃,王汉东,丁宇,何进,丁可,陆新宇,徐建国,韦武亭. 医学研究生学报. 2015(01)
[2]Molecular mechanism and functional consequences of lansoprazole-mediated heme oxygenase-1 induction[J]. Stephanie Schulz-Geske,Kati Erdmann,Ronald J Wong,David K Stevenson,Henning Schrder,Nina Grosser. World Journal of Gastroenterology. 2009(35)
本文编号：3487665
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/shenjingyixue/3487665.html
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