肝豆状核变性的脂质代谢组学研究
发布时间:2021-11-13 18:56
研究背景:肝豆状核变性又称为威尔逊病(Wilson’s Disease,WD),是由于常染色体ATP7B基因突变造成铜代谢障碍致使铜沉积于身体多个脏器并引起损害。如未及时合理治疗,可进行性加重导致残疾甚至死亡。而目前的诊断依据尚有不足之处,铜蓝蛋白降低程度不同甚至可正常,在其他肝病也可降低;肝铜是有创性检查;ATP7B基因检测相对昂贵;因此在临床工作中需要更加灵敏特异的诊断标志物。WD患者肝脏病理改变与非酒精性脂肪肝表现相似,均为脂肪变性改变,但是WD患者血清甘油三酯水平偏低,与非酒精性脂肪肝患者表现完全相反。而对于WD的脂类改变机制尚未完全阐明,且多方意见不统一,因此有必要应用脂质代谢组学方法对其脂质改变做进一步的研究,以发掘有助于诊断的标志物并阐明其中机制。通过应用脂质代谢组学技术检测WD血清中脂质物质,探讨脂质物质的改变规律,从而解释血清指标与病理改变不一致的现象,并发掘可能对疾病诊断有价值的代谢标志物以及阐述其中的机制。目的:利用脂质代谢组学方法对WD患者、家属及健康对照血清样本进行脂质物质检测,从中寻找差异代谢物质,以期发现具有诊断价值的代谢标志物,并寻找受影响的代谢通路,探...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
铜离子在肝细胞内的代谢途径(GSH:glutathione;MT:metallothioneins;CP:ceruloplasmin;GPI:glycosylphosphatidylinositol)
第3章材料与方法15家属组排除标准:(1)合并乙型或丙型病毒性肝炎、药物性肝炎、酒精性肝并自身免疫性肝并重叠综合征、血色玻(2)原患或现患恶性肿瘤。(3)妊娠或哺乳期女性。对照组纳入标准:(1)检查及化验指标均在正常范围内。(2)知情并同意参加本研究,并签署知情同意书。对照组排除标准:(1)合并乙型或丙型病毒性肝炎、药物性肝炎、酒精性肝并自身免疫性肝并重叠综合征、血色玻(2)原患或现患恶性肿瘤。(3)妊娠或哺乳期女性。图3.1WD患者诊断流程图3.1.2实验仪器与试剂实验仪器
第4章结果234.2数据预处理本实验共检测512种脂质物质,对缺失值过滤,按照质量控制样本(qualitycontrol,QC)中缺失超过50%的去除、样本中缺失值超过80%的原则去除进行数据过滤,剩余503种物质。由于96孔板对样本数量的限制,将样本分装在两个96孔板检测,样本按照每10个插入一个QC样本进行检测,对得出的数据进行QC校正,利用QC样本数据对所有样本数据进行校正,消除系统误差,对数据进行归一化处理。4.3数据质控为了监测整个实验数据质量,本实验在130个血清样本中插入13个QC样本,以CV30%为过滤阈值,确保用于统计分析的脂质的质谱检测峰面积值满足这一严格条件。QC的变异系数(coefficientofvariance,CV)平均值是6%,98%脂质的CV<30%,显示整个实验过程中良好的定量准确性(图4.1A)。同时,我们将QC样本之间进行皮尔森相关性(Pearsoncorrelation)分析,得到相关性在0.99-1之间,说明整体实验的重现性非常好,图4.1B为QC1和QC9之间相关性分析,相关性为0.99。图4.1为监测实验数据质量,设置了QC样本,图(A)98%脂质的CV<30%,绝大部分<10%,说明实验具有良好的定量准确性;图(B)挑选相关性最小的两组,QC1和QC9,相关系数为0.99,说明整体实验的重现性非常好。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Epidemiology and natural history of Wilson’s disease in the Chinese: A territory-based study in Hong Kong between 2000 and 2016[J]. Ka-Shing Cheung,Wai-Kay Seto,James Fung,Lung-Yi Mak,Ching-Lung Lai,Man-Fung Yuen. World Journal of Gastroenterology. 2017(43)
[2]代谢组学研究进展[J]. 马丽华,杨宏静,徐晓艳,石中全. 现代医药卫生. 2017(17)
[3]肝豆状核变性的精神症状[J]. 陈晨,张清,王晓平. 中国综合临床. 2015 (06)
[4]溶血磷脂酰胆碱在肝脏疾病中的研究进展[J]. 宋丹军,潘家琪,李鹏旭,褚赞波,冯达,刘爱明,杨菊林. 中国药理学通报. 2014(12)
[5]脂质代谢组学的研究进展[J]. 蔡教英,欧阳克蕙,上官新晨,徐明生,刘姚,王文君,瞿明仁. 动物营养学报. 2011(11)
[6]Diagnostic criteria for acute liver failure due to Wilson disease[J]. Christoph Eisenbach,Olivia Sieg,Wolfgang Stremmel,Jens Encke,Uta Merle. World Journal of Gastroenterology. 2007(11)
[7]肝豆状核变性的诊断与治疗指南[J]. 中华神经科杂志. 2008 (08)
本文编号:3493537
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
铜离子在肝细胞内的代谢途径(GSH:glutathione;MT:metallothioneins;CP:ceruloplasmin;GPI:glycosylphosphatidylinositol)
第3章材料与方法15家属组排除标准:(1)合并乙型或丙型病毒性肝炎、药物性肝炎、酒精性肝并自身免疫性肝并重叠综合征、血色玻(2)原患或现患恶性肿瘤。(3)妊娠或哺乳期女性。对照组纳入标准:(1)检查及化验指标均在正常范围内。(2)知情并同意参加本研究,并签署知情同意书。对照组排除标准:(1)合并乙型或丙型病毒性肝炎、药物性肝炎、酒精性肝并自身免疫性肝并重叠综合征、血色玻(2)原患或现患恶性肿瘤。(3)妊娠或哺乳期女性。图3.1WD患者诊断流程图3.1.2实验仪器与试剂实验仪器
第4章结果234.2数据预处理本实验共检测512种脂质物质,对缺失值过滤,按照质量控制样本(qualitycontrol,QC)中缺失超过50%的去除、样本中缺失值超过80%的原则去除进行数据过滤,剩余503种物质。由于96孔板对样本数量的限制,将样本分装在两个96孔板检测,样本按照每10个插入一个QC样本进行检测,对得出的数据进行QC校正,利用QC样本数据对所有样本数据进行校正,消除系统误差,对数据进行归一化处理。4.3数据质控为了监测整个实验数据质量,本实验在130个血清样本中插入13个QC样本,以CV30%为过滤阈值,确保用于统计分析的脂质的质谱检测峰面积值满足这一严格条件。QC的变异系数(coefficientofvariance,CV)平均值是6%,98%脂质的CV<30%,显示整个实验过程中良好的定量准确性(图4.1A)。同时,我们将QC样本之间进行皮尔森相关性(Pearsoncorrelation)分析,得到相关性在0.99-1之间,说明整体实验的重现性非常好,图4.1B为QC1和QC9之间相关性分析,相关性为0.99。图4.1为监测实验数据质量,设置了QC样本,图(A)98%脂质的CV<30%,绝大部分<10%,说明实验具有良好的定量准确性;图(B)挑选相关性最小的两组,QC1和QC9,相关系数为0.99,说明整体实验的重现性非常好。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Epidemiology and natural history of Wilson’s disease in the Chinese: A territory-based study in Hong Kong between 2000 and 2016[J]. Ka-Shing Cheung,Wai-Kay Seto,James Fung,Lung-Yi Mak,Ching-Lung Lai,Man-Fung Yuen. World Journal of Gastroenterology. 2017(43)
[2]代谢组学研究进展[J]. 马丽华,杨宏静,徐晓艳,石中全. 现代医药卫生. 2017(17)
[3]肝豆状核变性的精神症状[J]. 陈晨,张清,王晓平. 中国综合临床. 2015 (06)
[4]溶血磷脂酰胆碱在肝脏疾病中的研究进展[J]. 宋丹军,潘家琪,李鹏旭,褚赞波,冯达,刘爱明,杨菊林. 中国药理学通报. 2014(12)
[5]脂质代谢组学的研究进展[J]. 蔡教英,欧阳克蕙,上官新晨,徐明生,刘姚,王文君,瞿明仁. 动物营养学报. 2011(11)
[6]Diagnostic criteria for acute liver failure due to Wilson disease[J]. Christoph Eisenbach,Olivia Sieg,Wolfgang Stremmel,Jens Encke,Uta Merle. World Journal of Gastroenterology. 2007(11)
[7]肝豆状核变性的诊断与治疗指南[J]. 中华神经科杂志. 2008 (08)
本文编号:3493537
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/shenjingyixue/3493537.html
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