利用外显子组测序筛选一个ARCA家系的致病基因

发布时间：2021-11-17 21:27

　　背景：常染色体隐性遗传小脑性共济失调（Autosomal recessive cerebellar ataxia,ARCA）是一组比较罕见的单基因遗传性疾病,以小脑性共济失调为主要临床表现,具有显著的临床及遗传异质性,迄今为止,已发现有20余种亚型。全基因外显子组测序是最近兴起的寻找疾病致病基因的一种高效、经济的研究方法,对常见和罕见变异具有高度敏感性。目的：本研究对一例常染色体隐性遗传性小脑性共济失调家系进行外显子组测序分析结合纯合子定位来筛选该疾病的候选致病基因。方法和结果：我们对家系内两名患者进行了外显子组测序,在2个样本中检测到单核苷酸变异位点的数目分别为10917个和10354个,其中有722个单核苷酸变异位点为两样本所共有,插入缺失（Insertion-deletion,Indel）的数目分别为575个和560个,72个为两样本共有。经过已知公共数据库的过滤以及纯合区域的定位,最后筛选出8个新发的纯合单核苷酸变异位点：SSRP1基因（Intron8,IVS8-10c>t）、TTYH2基因c.710g>a（p.R237H）.TNKS1BP1基因c.4015g>... 

【文章来源】：中南大学湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 材料与方法
    2.1 研究对象
    2.2 主要仪器与试剂
    2.3 研究方法
第三章 结果
    3.1 家系临床资料
    3.2 全基因外显子组测序结果
    3.3 结果过滤及纯合子定位
    3.4 候选基因功能分析
    3.5 Sanger测序初步筛选候选基因
第四章 讨论
第五章 结论
参考文献
综述
    参考文献
附录
攻读学位期间主要的研究成果
致谢



本文编号：3501670