基于单细胞转录组测序技术分析缺血性脑卒中脑细胞转录组表达差异

发布时间：2022-07-12 17:47

　　目的缺血性脑卒中（ischemic stroke,IS）发病率高、死亡率高。本实验利用单细胞转录组测序技术探索IS脑细胞的基因表达差异情况,尝试为IS的治疗提供一个新的思路。方法分别选取去骨瓣减压术切除大面积脑梗死患者和颅脑创伤患者的脑组织各2g作为实验组和对照组,进行单细胞转录组测序,对测序结果进行差异表达基因的GO注释和KEGG通路分析。结果 （1）本实验共检测出有效细胞实验组1635个,对照组627个,上述细胞依据表达情况可以分出7个细胞群;（2）在两组之间鉴定到30个具有表达差异的转录本。实验组与对照组比较,表达上调的差异转录本有13个,表达下调的差异转录本有17个;（3）共有23个基因注释到GO系统的84个功能类别（P <0.05）,注释到细胞组成的基因有15个;注释到生物过程的基因有10个;注释到分子功能大类的基因有8个。KEGG通路分析结果显示这些差异表达基因中有4个富集到核糖体的形成通路。结论 （1）用单细胞转录组测序技术对IS脑细胞进行基因表达分析是可行的;（2） IS患者的脑细胞基因表达对比颅脑创伤患者存在差异。 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
材料与方法
    1. 病例选择
    2. 单细胞转录组测序
    3. 单细胞悬液密度&活力检测、单细胞分离、裂解及RNA的捕获（图A)
    4.c DNA文库建立（图B)
    5.生物信息学分析
结果
    1.单细胞转录组测序结果（图C、D)
    2.差异表达基因分析
    3. top10特征表达基因在CI组和Normal组的差异表达和分布情况（图E)
    4. 差异表达基因聚类热图（图F)
    5. 差异表达基因的GO注释和KEGG分析（图G、H)
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]早产儿脑白质损伤大鼠模型海马组织差异多肽谱分析[J]. 凤尔翠,蒋犁.  中国当代儿科杂志. 2019(11)
[2]簇集蛋白在急性脑梗死中的表达及其临床意义[J]. 徐艳,李辉华.  重庆医学. 2016(21)
[3]清热化瘀Ⅱ号方对脑缺血预处理大鼠MAP1B表达的影响[J]. 王琳,祝美珍,肖艳芬,杨仕权,吴志敏,刘向阳.  中西医结合心脑血管病杂志. 2013(02)



本文编号：3659573