缺血性脑卒中患者急性期与恢复期全血转录组测序对比分析

发布时间：2022-12-09 04:41

　　【目的】通过对比分析缺血性脑卒中患者的急性期与恢复期全血转录组测序结果的差异性,探索缺血性脑卒中神经功能缺损改善的可能机制。【方法】采用纵向研究方法,纳入6名符合纳排标准的缺血性脑卒中患者,收集患者急性期与恢复期的全血并提取总RNA,对同一患者进行急性期与恢复期转录组测序,前后比较得到差异表达基因并进行GO分析和KEGG代谢通路分析。【结果】1.神经功能缺损改善患者恢复期与急性期全血转录组测序结果对比发现差异表达基因共290条,其中上调的有177条,下调的有113条。2.通过GO分析,发现差异表达基因的功能主要富集在细胞内外结构组成、线粒体呼吸链复合体、组蛋白去乙酰化的调节、核转录mRNA分解代谢过程、T细胞分化调节、先天免疫激活信号转导等方面。3.通过KEGG代谢通路分析,上调基因富集在Toll样受体信号转导途径、IL-17信号传导途径、NOD信号传导通路、NF-Kappa信号通路、MAPK信号通路、EB病毒感染、神经营养素传导途径、血管内皮生长因子信号传导途径等途径、溶酶体、鞘脂信号通路等方面;下调基因富集在核糖体、系统性红斑狼疮、酒精中毒、病毒致癌、DNA复制、蛋白质输出、亨廷顿... 

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【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
主要英文缩略语索
第1章 绪论
第2章 材料与方法
    2.1 主要仪器与试剂
    2.2 研究对象
    2.3 实验方法
第3章 结果
    3.1 病例信息
    3.2 样本质控结果
    3.3 测序数据对比
    3.4 表达定量分析
    3.5 基因/转录本差异表达分析
    3.6 mRNA功能富集分析
第4章 讨论
第5章 结论
参考文献
综述
    参考文献
致谢



本文编号：3714844