利用外显子组测序对一个隐性遗传的PME家系进行诊断

发布时间：2023-06-01 19:24

　　背景：进行性肌阵挛癫痫(Progressive myoclonic epilepsies, PME)是一种较为少见的癫痫综合征,临床上以频繁的肌阵挛发作为最主要表现,常伴有全面性强直-阵挛发作等其它形式的痫性发作。PME具有高度的临床及遗传异质性,主要包括翁隆病(Unverricht-Lundborg disease)、Lafora病(Lafora disease)、神经元蜡样脂褐质沉积症(Neuronal ceroid lipofuscinoses, NCL)、肌阵挛癫痫及破碎红纤维综合征(Myoclonus epilepsy with ragged red fibers,MERRF)、齿状核红核苍白球路易体萎缩(tentatorubralpallidoluysian atrophy, DRPLA)等癫痫疾病,对早期及不典型PME患者做出具体的癫痫疾病诊断较为困难。 目的：寻找该隐性遗传的PME家系中的致病突变,从分子遗传学水平对该家系做出精确的癫痫疾病诊断。 方法：选择一个来自江苏的近亲结婚的隐性遗传的PME家系,在前期工作中该家系中两名患者已完善了头部磁共振、视频脑电图、肌电图等...

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摘要
Abstract
目录
第一章 前言
第二章 研究对象、材料与方法
    2.1 研究对象
    2.2 主要实验仪器、试剂、软件、网站
        2.2.1 主要实验仪器
        2.2.2 主要使用实验试剂、耗材
        2.2.3 非变性胶电泳及染色主要溶液配制
        2.2.4 主要生物医学软件
        2.2.5 主要生物信息学数据库
    2.3 研究方法
        2.3.1 外周血基因组DNA的抽提
        2.3.2 外周血基因组RNA的抽提
        2.3.3 目标区域(靶向基因或外显子组)测序
第三章 结果
    3.1 家系临床资料分析
        3.1.1 先证者临床资料
        3.1.2 先证者胞妹临床资料
    3.2 全基因外显子组测序结果分析及验证
        3.2.1 全基因外显子组测序结果数据产出统计
        3.2.2 测序数据SNP和Indel的检测和注释
        3.2.3 经过数据库过滤后可导致氨基酸改变的变异数据分析
        3.2.4 利用全基因外显子组测序数据对家系进行纯合子定位
        3.2.5 利用纯合子定位区间对全基因外显子组测序结果进行筛选
        3.2.6 候选致病基因突变在家系中的共分离验证
        3.2.7 候选致病基因突变在正常人中多态的排除及对SCARB2基因cDNA区的突变筛查
        3.2.8 患者的诊断
A的蛋白功能改变初步分析">        3.2.9 SCARB2基因c.1270 G>A的蛋白功能改变初步分析
第四章 讨论
第五章 结论
参考文献
综述
    参考文献
致谢



本文编号：3826897