缺血性脑卒中相关miRNA和靶基因miR-424的分析研究
发布时间:2023-11-11 15:13
第一部分缺血性脑卒中相关差异miRNA和靶基因的筛选目的:本研究通过生物信息学方法对已发表缺血性脑卒中相关的mRNA和miRNA高通量数据进行整合分析,运用多种工具、算法分析和预测靶向miRNA-mRNA关系,然后用Cytoscape软件构建由miRNAs和mRNAs组成的生物信息调控网络,预测miRNA参与调控缺血性脑卒中的关键分子通路。方法:首先从GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)检索并下载源自缺血性脑卒中患者、利用二代测序技术获得的mRNA和miRNA表达数据,利用R软件进行分析,将miRNA表达数据进行总体归一化处理,分析其中的差异表达miRNA,基因本体数据库(Gene ontology,GO)分析分子功能、生物学过程和细胞组通过KEGG数据库,分析基因组序列、功能以及通路信息。采用miRNA靶基因预测工具数据库筛选差异表达的miRNA的靶基因。结果:通过对纳入的卒中患者相关的miRNA和mRNA原始数据进行分析,筛选差异表达的miRNA及mRNA。共筛选获得15个差异表达miRNA,其中显著下调的有10个,显著上调的有5个。共...
【文章页数】:111 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
abstract
引言
第一部分 缺血性脑卒中相关差异miRNA和靶基因的筛选
前言
材料与方法
结果
讨论
小结
参考文献
第二部分 缺血性脑卒中候选miRNA的验证
前言
材料与方法
结果
讨论
小结
参考文献
第三部分 miR-424 参与缺血性脑卒中发展的分子机制研究
前言
材料与方法
结果
讨论
小结
参考文献
结论
综述一 脑卒中发病与预后相关的miRNA研究进展
参考文献
综述二 脑血管病临床研究进展
参考文献
致谢
个人简历
本文编号:3862793
【文章页数】:111 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
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引言
第一部分 缺血性脑卒中相关差异miRNA和靶基因的筛选
前言
材料与方法
结果
讨论
小结
参考文献
第二部分 缺血性脑卒中候选miRNA的验证
前言
材料与方法
结果
讨论
小结
参考文献
第三部分 miR-424 参与缺血性脑卒中发展的分子机制研究
前言
材料与方法
结果
讨论
小结
参考文献
结论
综述一 脑卒中发病与预后相关的miRNA研究进展
参考文献
综述二 脑血管病临床研究进展
参考文献
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