寡核苷酸芯片探针设计软件研究进展

发布时间：2018-07-14 20:39

【摘要】：基因芯片以其高通量、微型化和自动化等优点成为医学基因诊断的重要工具,芯片探针的设计和筛选是制备高质量基因芯片关键步骤之一。目前,已有不少探针设计软件被开发出来,它们针对不同的设计对象,显示出各自的优势和局限性。本文聚焦寡核苷酸探针筛选设计的三个基本标准,即特异性、敏感性和熔点(Tm),介绍了探针设计软件研究发展状况。结合文献报道,对软件的用途进行分类说明。本综述将有助于用户快速选择合适的软件用于探针设计,对降低芯片制备成本、提高芯片应用研究效率、促进高性能的探针设计软件研究及商品化具有重要的意义。
[Abstract]:Because of its high throughput, miniaturization and automation, gene microarray has become an important tool for medical gene diagnosis. The design and screening of microarray probes is one of the key steps in the preparation of high quality gene chips. At present, many probe design software have been developed, which show their respective advantages and limitations for different design objects. In this paper, we focus on three basic criteria for the screening and design of oligonucleotide probes, namely specificity, sensitivity and melting point (TM), and introduce the development of probe design software. Combined with the literature report, the use of the software is classified and explained. This review will help users to quickly select suitable software for probe design. It is of great significance to reduce the cost of chip preparation, improve the efficiency of chip application research and promote the research and commercialization of high performance probe design software.
【作者单位】： 中南大学地球科学与信息物理学院生物医学工程系;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(60801019,61371042) 中南大学中央高校基本科研业务费专项资金资助(2013zzts252)
【分类号】：R318.6

【共引文献】

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本文编号：2122880