人和猪神经脱细胞基质蛋白质组学差异

发布时间：2021-05-22 02:50

　　目的:分析猪与人外周神经在脱细胞后的蛋白质组学差异,为猪神经脱细胞材料运用于外周神经损伤（PNI）的修复提供一定的数据支撑。方法:通过研磨和酶解方式提取猪神经脱细胞基质（pDNM）和人神经脱细胞基质（hDNM）内的所有蛋白,采用以串联质量标签（TMT）为标记的液相色谱质谱联用（TMTHPLC-MS/MS）技术定量并对2组差异蛋白进行GO富集化和KEGG通路分析。结果:共鉴定1 448种蛋白,组间蛋白都能明显区分,组内蛋白相关性良好。其中,p DNM上调蛋白数456个,下调蛋白数170个,且pDNM富含更多的细胞外基质（ECM）相关蛋白。GO分析显示,上调表达蛋白所处的细胞位置集中在生长锥、轴突、神经元胞体。上调表达蛋白参与的生物学过程为细胞迁移、细胞骨架组织、轴突发育。上调蛋白的主要分子功能与生物功能调节、细胞骨架的结构组成、肌动活性有关。KEGG通路分析显示,差异蛋白可参与肌动蛋白细胞骨架的调节、轴突的引导等信号通路的激活。结论:pDNM内含丰富的结构和功能相关蛋白,有望成为修复PNI的备选产品。 

【文章来源】：温州医科大学学报. 2020,50(11)

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 蛋白质提取：
        1.2.2 蛋白质酶解：
        1.2.3 TMT标记肽段混合物：
        1.2.4高p H反相分离肽段：
        1.2.5 nano-HPLC-MS/MS分析：
        1.2.6 数据处理：
2 结果与分析
    2.1 数据质控
    2.2 差异表达蛋白鉴定结果
    2.3 差异蛋白生物信息功能分析
    2.4 ECM相关蛋白含量组间差异
3 讨论



本文编号：3200837