下咽癌中差异表达的蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选

发布时间：2017-10-16 23:03

  本文关键词：下咽癌中差异表达的蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选

  更多相关文章： 下咽癌 蛋白激酶 激酶抑制剂 生物信息学

【摘要】：目的筛选下咽癌中差异表达的激酶基因及其选择性抑制剂,为下咽癌的分子靶向治疗提供新的参考。方法利用GEO数据库和SAM软件筛选下咽癌中差异表达的激酶基因,体外培养人下咽癌Fa Du细胞系。为验证GEO数据库中芯片结果的准确性,利用实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测差异表达激酶在Fa Du细胞中的表达量,通过KEGG数据库获得激酶调控的通路,利用激酶抑制剂数据库和文献挖掘筛选获得在下咽癌Fa Du细胞系中差异表达激酶的选择性抑制剂。结果 1在GEO数据库的下咽癌基因组表达谱中,共筛选出3个高表达的激酶基因,分别为PKC-β、CDK6和CDC42(差异倍数≥2.0且P0.05);2Real-time PCR结果显示在人下咽癌Fa Du细胞中这3个上调激酶基因也出现高表达(P0.05),证明全基因组的结果准确;3KEGG通路分析的结果显示3个高表达激酶调控复杂的通路网络;4激酶抑制剂的筛选结果显示共有5个激酶抑制剂调控PKC-β,4个激酶抑制剂调控CDK6,3个激酶抑制剂调控CDC42。文献挖掘的结果显示在这12个激酶抑制剂中,有4个在癌症方面的研究较少,文献10篇。结论下咽癌中共有3个激酶PKC-β、CDK6和CDC42发生高表达,并发挥促癌作用。它们的激酶抑制剂可能有潜在的抗癌作用,为下咽癌的分子治疗提供新的切入点。
【作者单位】： 内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科;
【关键词】： 下咽癌 蛋白激酶 激酶抑制剂 生物信息学
【基金】：内蒙古自治区自然科学基金(2014MS0856) 内蒙古医科大学科技百万工程项目(KJbw2013014)
【分类号】：R739.63
【正文快照】： 网络出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/37.1437.R.20160331.0923.008.html下咽癌占下咽原发恶性肿瘤的95%,其主要治疗手段为手术和放疗,但因其发生部位隐蔽,恶性程度高,约50%的患者在确诊时已存在淋巴结转移,预后较差[1-3]。手术治疗也很大程度会影响患者发声功能给

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 王俊阁;李晓明;路秀英;皮丽宏;;Stat3信号传导通路对喉癌细胞G_1～S期的调控[J];临床耳鼻咽喉头颈外科杂志;2008年15期

2 潘新良;雷大鹏;许风雷;张立强;栾信庸;;下咽癌的外科治疗[J];山东大学耳鼻喉眼学报;2007年01期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 周梁;;喉癌、下咽癌功能保全性治疗进展[J];中国癌症杂志;2013年12期

2 唐正中;陶振超;吴爱东;钱立庭;;下咽癌患者生存率的影响因素分析[J];安徽医科大学学报;2013年07期

3 于爱民;关兵;罗兰;;喉咽后壁肌黏膜瓣在梨状窝癌切除修复中的应用[J];临床耳鼻咽喉头颈外科杂志;2013年03期

4 王文华;何晓松;;EGCG抗肿瘤作用与STAT3信号通路的研究进展[J];现代医药卫生;2013年02期

5 易礼俊;徐亮;夏冬;;Fascin和P27在结直肠癌的研究进展[J];西南军医;2012年05期

6 陈万军;汪冰;韩秀丽;;中药清瘤亮喉方辅助治疗喉咽癌的临床观察[J];中国中西医结合杂志;2012年07期

7 刘军;周意;万静;刘忠;;下咽癌手术结合放射治疗综合治疗与单纯放射治疗疗效比较[J];临床耳鼻咽喉头颈外科杂志;2012年14期

8 端木玉明;王亚丽;刘霞;;精细化器械管理在发音重建术中的应用[J];护理实践与研究;2012年10期

9 黄天桥;梁大鹏;张金慧;李薇;王培嵩;;加压氧对人喉咽癌裸鼠皮下移植瘤的作用[J];齐鲁医学杂志;2012年02期

10 曾志梅;梁永辉;杨嶷芳;窦晓清;罗碧强;张丽卫;陈贤明;;巨噬细胞移动抑制因子在下咽癌中的表达[J];山东大学耳鼻喉眼学报;2011年01期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前8条

1 张庆泉;张天振;宋西成;张华;;下咽后壁癌的手术治疗[J];中华耳鼻咽喉头颈外科杂志;2005年12期

2 李学忠,张立强,潘新良,解光,雷大鹏,栾信庸,王天铎;环后癌的手术治疗[J];中华耳鼻咽喉头颈外科杂志;2005年06期

3 吕正华,栾信庸,潘新良,解光,许风雷,刘大昱,雷大鹏;喉咽后壁区癌手术治疗[J];中国耳鼻咽喉头颈外科;2005年04期

4 李学忠,张立强,潘新良,解光,栾信庸,王天铎;保留喉功能的梨状窝癌的手术治疗[J];中华耳鼻咽喉头颈外科杂志;2005年03期

5 张立强,栾信庸,潘新良,解光,许风雷,刘大昱,雷大鹏,杨秋安;保留喉功能的梨状窝内侧壁癌的手术治疗[J];中华肿瘤杂志;2002年03期

6 潘新良,许风雷,张立强,刘大昱,雷大鹏,栾信庸;裂层皮片和胸大肌肌皮瓣在保留喉功能的喉咽癌手术中的应用[J];临床耳鼻咽喉科杂志;2001年12期

7 黄建民,栾信庸,潘新良,许风雷,解光,陈瑛,王天铎;梨状窝内侧壁癌切除与喉功能保留[J];中华耳鼻咽喉科杂志;2001年04期

8 房居高,魏秀春,蔡淑平,孙兰萍,李思忠,王超,陶阳,周正波,梁恩虎,栾信庸;梨状窝癌局部扩展的病理学研究[J];中华耳鼻咽喉科杂志;2000年05期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 方芳，刘景生;蛋白激酶抑制剂[J];基础医学与临床;1996年02期

2 刘廷林;谢焕章;魏于全;杨胜勇;;探索应用反向对接技术研究蛋白激酶抑制剂选择性的可行性[J];药学学报;2009年07期

3 黄卫;曾富华;胡晓敏;;蛋白激酶抑制剂在抗肿瘤药物中的应用[J];生命的化学;2007年02期

4 欧武陵;胡胜;于丁;;癌症治疗的小分子激酶抑制剂的药物敏感性[J];中国肿瘤;2010年10期

5 史宁;韦林毅;吴久鸿;;小分子抗肿瘤蛋白激酶抑制剂的研究进展[J];中国药学杂志;2011年23期

6 徐岩;王广树;孙薇;杨晓虹;徐利保;;小分子IGF-1R抑制剂的研究进展[J];药学学报;2008年10期

7 陈建超;孙悦;周志旭;孙铁民;;应用于心血管疾病的大鼠肉瘤蛋白同源蛋白激酶抑制剂的研究进展[J];中国药物化学杂志;2014年02期

8 王伊文;刘艳芹;谢进;张英鸽;;影响癌症对小分子激酶抑制剂敏感性的因素[J];国际药学研究杂志;2010年02期

9 刘兴赋;傅晓钟;杨坤;;抗肿瘤吡咯三嗪类激酶抑制剂的合成[J];贵阳医学院学报;2014年01期

10 ;基因治疗可逆转心功能有不全倾向活体家兔心室递送编码β肾上腺素能受体激酶抑制剂的基因[J];口岸卫生控制;2001年04期

中国重要会议论文全文数据库 前6条

1 王鹏;杨加宾;孙春龙;李鲁申;胡兵;张蕊;吉民;;小分子ALK激酶抑制剂的研究进展[A];2012年中国药学大会暨第十二届中国药师周论文集[C];2012年

2 丁素菊;刘康;毕晓莹;;Rho激酶介导的缺血再灌注微血管损伤的机制初探及Rho激酶抑制剂的保护作用[A];中华医学会第十三次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2010年

3 崔国惠;李新刚;陈燕;吴青;;TSA抑制NB4细胞去乙酰化酶活性并促进细胞周期素激酶抑制剂表达[A];中华医学会第八次全国血液学学术会议论文汇编[C];2004年

4 徐利保;杨晓虹;孙薇;周小平;徐岩;;Rho激酶抑制剂的研究进展[A];东北三省生物化学与分子生物学学会2008年学术交流会论文摘要[C];2008年

5 张宁;李刚;肖波;刘运海;蔡艳;孙新刚;梁静慧;;Rho激酶抑制剂对EAN发病的影响[A];第十一届全国神经病学学术会议论文汇编[C];2008年

6 马金贵;黄河;蒙凌华;柳红;丁健;;新型Src激酶抑制剂PH006的抗肿瘤作用研究[A];2009医学前沿论坛暨第十一届全国肿瘤药理与化疗学术会议论文集[C];2009年

中国重要报纸全文数据库 前6条

1 本报特约撰稿 徐铮奎;国内替尼类开发思进取[N];医药经济报;2014年

2 本报特约撰稿人 陆志城;抗艾药物研发目光投向宿主蛋白抑制剂[N];医药经济报;2005年

3 翻译 李勇;激酶抑制剂时代[N];医药经济报;2014年

4 伊遥　编译;蛋白激酶抑制剂：揭开CNS药物开发新篇章[N];医药经济报;2012年

5 编译 李勇;CLL新药研发进入激酶抑制剂时代[N];中国医药报;2014年

6 晓艳;眼皮底下的抗癌新药[N];医药经济报;2002年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 段衍超;Wee1激酶抑制剂MK-1775抗急性淋巴细胞白血病的效应及机制研究[D];山东大学;2015年

2 张辛;两种小分子化合物抗癌作用的发现与机制研究[D];上海交通大学;2014年

3 杜娟;计算机辅助激酶抑制剂的分子设计和模拟[D];兰州大学;2011年

4 张蕾磊;应用质谱技术筛选激酶抑制剂[D];中国协和医科大学;2008年

5 夏冬辉;原癌蛋白PIM-1激酶抑制剂的分子模拟研究[D];西北大学;2012年

6 秦晋;几类激酶抑制剂的分子模拟研究[D];兰州大学;2010年

7 王增军;附睾蛋白激酶抑制剂Eppin和精囊蛋白Semenogelin 1相互关系研究[D];南京医科大学;2006年

8 宋云;Rho激酶抑制剂法舒地尔对Aβ诱导痴呆大鼠模型的保护作用及其机制研究[D];山东大学;2011年

9 李冬冬;喹唑啉类化合物的设计、合成及生物活性评价[D];南京大学;2014年

10 张晶;蛋白激酶抑制剂的筛选与活性化合物的分子药理学研究[D];中国协和医科大学;2009年

中国硕士学位论文全文数据库 前9条

1 肖元春;吲哚类Rho激酶抑制剂的计算机研究[D];大连理工大学;2015年

2 韩春晓;基于化学信息学的B-Raf激酶抑制剂计算研究[D];大连理工大学;2015年

3 王欣然;异喹啉类和4-氨基吡啶类Rho激酶抑制剂的研究[D];天津大学;2014年

4 吴文;新型大环结构的激酶抑制剂的设计、合成及其生物活性研究[D];中南大学;2011年

5 范永剑;1，3，4-VA二唑类KDR激酶抑制剂的设计、合成与活性研究[D];浙江大学;2007年

6 徐利保;小分子c-Fms激酶抑制剂的设计、合成与筛选[D];吉林大学;2009年

7 赖康英;Jak3激酶抑制剂CP690550及其衍生物的设计、合成与筛选[D];沈阳药科大学;2008年

8 段志刚;磺酰胺基取代的嘧啶联苯类杂环衍生物作为潜在的变构激酶抑制剂的设计与合成[D];吉林大学;2014年

9 谢云丰;新型B-Raf~(V600E)激酶抑制剂的设计、合成及生物活性[D];中南大学;2013年

，

本文编号：1045381