基于miRNA芯片的喉咽鳞状细胞癌对TPF方案诱导化疗敏感性相关miRNA的初步分析

发布时间：2018-04-22 18:10

  本文选题：肿瘤 + 鳞状细胞　； 参考：《中国耳鼻咽喉头颈外科》2016年04期

【摘要】：目的运用miRNA芯片筛选与喉咽鳞状细胞癌对TPF方案诱导化疗敏感性相关的差异miRNAs,生物信息学分析确定具有诊疗价值的目标miRNA并进行验证。方法利用Affymetrix GeneChipmiRNAArray4.0芯片对12例TPF方案诱导化疗敏感的原发喉咽鳞状细胞癌患者及9例不敏感的患者的肿瘤组织行差异miRNA的筛选。选择文献中已经报道的和肿瘤发生相关的miRNA作为目标miRNA,并采用RT-PCR在24例原发喉咽鳞癌肿瘤组织(14例敏感,10例不敏感)中验证目标miRNA。结果筛选出24个miRNA在敏感组与不敏感组间表达有显著差异,其中6个miRNA在对TPF方案诱导化疗敏感组中表达上调,18个miRNA表达下调。运用miRNA靶基因预测数据库mirfocus对筛选出的24个差异miRNA进行分析,确定在敏感组中低表达的hsa-miR-211-3p、hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p作为目标miRNA。采用RT-PCR对目标miRNA进行验证,hsa-miR-4253、hsamiR-4443、hsa-miR-193b-3p与芯片筛选结果一致。结论hsa-miR-4253、hsa-miR-4443、hsa-miR-193b-3p在诱导化疗敏感组与不敏感组间有显著性差异,可作为治疗方案的选择指标,并为进一步研究喉咽鳞状细胞癌对诱导化疗敏感性奠定分子生物学基础。
[Abstract]:Objective to screen the difference in sensitivity of larynx squamous cell carcinoma (LSCC) to TPF induced chemotherapy by using miRNA microarray, and to identify the target miRNA with diagnostic and therapeutic value by bioinformatics analysis and verify it. Methods Affymetrix GeneChipmiRNAArray4.0 microarray was used to screen the tumor tissues of 12 patients with primary larynx squamous cell carcinoma and 9 insensitive patients with TPF regimen induced chemotherapy-sensitive primary larynx squamous cell carcinoma (LSCC). The miRNA related to tumorigenesis in the literature was selected as the target miRNAs, and RT-PCR was used to validate the target miRNAs in 24 cases of primary larynx squamous cell carcinoma (LSCC) in 14 cases of sensitive tumor tissues and 10 cases of insensitivity). Results the expression of 24 miRNA was significantly different between sensitive group and insensitive group. 6 miRNA were up-regulated and 18 miRNA down-regulated in chemosensitive group induced by TPF regimen. MiRNA target gene prediction database (mirfocus) was used to analyze 24 differentially screened miRNA, and hsa-miR-211-3psa-miR-4253 hsa-miR-4443 hsa-miR-193b-3p was identified as the target of miRNAs. RT-PCR was used to verify the target miRNA. The results of hsa-miR-4253hsamiR-4443hsa-miR-193b-3p were consistent with those of the chip. Conclusion hsa-miR-4253hsa-miR-4443 hsa-miR-193b-3p has a significant difference between chemosensitive and insensitive groups, and can be used as a selective index for the treatment of laryngopharyngeal squamous cell carcinoma. It also provides a molecular biological basis for further study on the sensitivity of larynx squamous cell carcinoma to induced chemotherapy.
【作者单位】： 首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学);
【基金】：北京市医管局扬帆计划(XMLX201311) 北京市科委重点项目(Z141107002514003)联合资助
【分类号】：R739.6

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