梅尼埃病患者外周单核细胞的基因表达谱分析及药物发现

发布时间：2021-06-26 09:33

　　目的应用公开数据库寻找可能与梅尼埃病（Meniere’s disease, MD）发病机制相关的基因和分子途径,以及筛选MD潜在治疗药物。方法通过Gene Expression Omnibus（GEO）数据库获取GSE109558数据集,筛选MD与正常样本间外周单核细胞的差异表达基因,并进行功能注释、通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用PPI（Proteinprotein interaction, PPI）网络构建。最后应用Connectivity map（cMAP）数据库筛选潜在治疗MD的小分子药物。结果差异表达基因显著富集在对病毒的反应、防御反应、趋化、MHC II类蛋白结合等生物过程,以及Influenza A和Herpes simplex infection信号通路。网络分析发现一些核心基因,如CXCL10、IFI44L。筛选出33个治疗MD的候选小分子药物,如赖诺普利、柚皮素等。结论 MD可能具有自身炎症性内耳疾病,外周单核细胞中CXCL10、IFI44L、IFI44、XAF1、OAS2、HERC5、EIF2AK2表达水平的升高和POTEE表达水平的降低可能与MD发病机制有关。筛... 

【文章来源】：中华耳科学杂志. 2020,18(04)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

Influenza A信号传导通路示意图（标注五星的位置为本研究中蛋白）

Herpes simplex infection信号传导通路示意图（标注五星的位置为本研究中蛋白）

从STRING数据库获取得分≥0.4的PPI数据，利用Cytoscape3.7可视化分析显示，该网络由21个节点和35个边缘组成（如图3）。用插件CentiScaPe计算节点度，根据节点度≥5获得8个关键基因，分别为CXCL10(CXC趋化因子配体10）、IFI44L、POTEE(POTE锚蛋白结构域家族成员E）、IFI44（干扰素诱导蛋白44）、XAF1(X染色体连锁凋亡抑制蛋白相关因子1）、OAS2(2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶）、HERC5(HECT类E3连接酶5）、EIF2AK2（蛋白激酶PKR）（如表2）。2.4 药物筛选

【参考文献】：
期刊论文
[1]柚皮素:新一代免疫调节剂[J]. 曾文峰,张发云,杜刚军,金凌涛,秦蕾,董文娟,张超,王洛洋,尹晓哲,张春玲,梁伟.  生物化学与生物物理进展. 2018(09)
[2]活血通络清脑方联合阿司匹林治疗短暂性脑缺血发作性眩晕效果分析[J]. 李恒,欧阳福,李湘海,师国军.  山东医药. 2018(02)
[3]梅尼埃病的基因学研究新进展[J]. 徐舒舒,袁进,赵洪春,王延飞.  中华耳科学杂志. 2017(05)
[4]反复发作性眩晕豚鼠前庭内侧核毒蕈碱受体M2、M3表达的研究[J]. 饶秀丽,尹时华,侯涛,朱子昂,龙吉.  中华耳科学杂志. 2016(05)
[5]梅尼埃病的基因研究进展[J]. 王家莉,王武庆.  中华耳科学杂志. 2016(04)
[6]类风湿关节炎患者血清C-X-C配体10与疾病的相关性[J]. 教婷,张宁.  中国医科大学学报. 2015(11)
[7]系统性红斑狼疮患者血清中趋化因子CXCL9,CXCL10及CXCL11的检测[J]. 王倩,刘伟,卢葳,胡静,张丽霞,段西凌.  中国皮肤性病学杂志. 2015(02)

硕士论文
[1]基于RNA-seq技术的散发性梅尼埃病患者外周血单核细胞转录组学研究[D]. 孙莹.山东大学 2018



本文编号：3251094