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Annexin A1相互作用蛋白的筛

发布时间:2017-05-11 19:00

  本文关键词:Annexin A1相互作用蛋白的筛选、鉴定及蛋白分子网络图谱的绘制,,由笔耕文化传播整理发布。


【摘要】:[目的]筛选与鉴定鼻咽癌细胞中Annexin A1的相互作用蛋白,绘制其在鼻咽癌侵袭转移中的调控蛋白质分子网络图谱,初步了解Annexin A1在鼻咽癌侵袭转移中的作用与机制。[方法]收集Annexin A1高表达的低转移鼻咽癌6-10B细胞总蛋白,采用免疫共沉淀结合凝胶电泳分离Annexin A1相互作用蛋白,二维液相色谱串联质谱鉴定相互作用蛋白,并进行基因本体论、功能聚类、信号通路、蛋白-蛋白相互作用等生物信息学分析,绘制Annexin A1在鼻咽癌侵袭转移中的调控蛋白质分子网络图谱。运用免疫共沉淀结合蛋白质印迹法对Annexin A1关键相互作用组蛋白S100A9、Vimentin进行验证。[结果]1、采用免疫共沉淀结合质谱分析,在鼻咽癌6-10B细胞中共鉴定了436个Annexin A1相互作用蛋白。2、通过GOTERM_BP分析显示:Annexin A1相互作用蛋白的生物学过程主要涉及到刺激反应、蛋白定位、细胞代谢过程等;GOTERM_MF分析显示:Annexin A1相互作用蛋白的分子功能主要涉及到催化作用、阳离子结合功能、蛋白结合功能、核苷酸结合、细胞骨架及ATP结合功能等;GOTERM_CC分析显示:Annexin A1相互作用蛋白的定位涉及到细胞质、细胞器、细胞膜及细胞骨架等多个部位。3、通过功能聚类分析显示:Annexin A1相互作用蛋白可聚类成21个功能相关簇,其功能主要涉及到钙依赖性磷脂结合、信号肽、膜的组分、跨膜转运、蛋白激酶活性、胞质囊泡的组分、细胞骨架组织。4、通过KEGG和Biocarta信号通路分析显示:Annexin A1相互作用蛋白涉及35条KEGG信号通路和7条Biocarta信号通路,其中有4个蛋白涉及到细胞骨架信号通路,9个蛋白涉及到粘附连接信号通路,12个蛋白涉及到跨膜转运信号通路。5、通过蛋白-蛋白相互作用网络分析显示:S100A9、Vimentin蛋白与Annexin A1形成相互作用组。6、应用免疫共沉淀结合蛋白质印迹法证实S100A9、Vimentin与Annexin A1三者能形成复合物,与质谱结果一致。[结论]Annexin A1与S100A9和Vimentin存在相互作用,并且可能通过Annexin A1/S100A9/Vimentin相关信号通路影响鼻咽癌的侵袭和转移。
【关键词】:Annexin A1 鼻咽癌 蛋白-蛋白相互作用
【学位授予单位】:南华大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R739.63
【目录】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-9
  • 缩略语表9-10
  • 第1章 绪论10-12
  • 第2章 实验材料与实验方法12-28
  • 2.1 实验材料12-17
  • 2.2 实验方法17-28
  • 第3章 实验结果28-100
  • 3.1 Annexin A1 相互作用蛋白的分离28-29
  • 3.2 二维液相色谱串联质谱结合ProteinPilot~(TM)4.5软件进行29-50
  • 3.3 Annexin A1相互作用蛋白的生物信息学分析50-97
  • 3.4 免疫共沉淀结合免疫印迹验证 Annexin A1 相互作用蛋白97-100
  • 第4章 讨论100-104
  • 第5章 结论104-106
  • 参考文献106-112
  • 文献综述112-120
  • 参考文献117-120
  • 攻读硕士学位期间科研成果120-122
  • 资助科研的基金项目122-124
  • 致谢124-125

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 梁博伟;赵劲民;殷国前;胡峰;;膜联蛋白A1生理功能的研究进展[J];蛇志;2012年02期


  本文关键词:Annexin A1相互作用蛋白的筛选、鉴定及蛋白分子网络图谱的绘制,由笔耕文化传播整理发布。



本文编号:357834

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