ceRNA网络与内耳毛细胞突触调节的相关性研究
发布时间：2022-02-17 17:45
研究背景感音神经性聋（Sensorineural hearing loss,SNHL）占耳聋很大部分,主要是因感觉毛细胞丢失或传入神经到听觉皮层传导通路受损引起的听力阈值的升高。内耳突触数量改变或功能障碍导致毛细胞与螺旋神经节细胞之间的信号传递异常,是引起感音神经性聋重要原因之一。基因突变和环境因素,都可造成毛细胞的不可逆损伤或导致内毛细胞突触的退化,导致听力丧失。“耳蜗突触病”（cochlear synaptopathy,CS）指毛细胞数量保持不变的情况下,内耳毛细胞与听神经纤维之间的传递递质的突触减少,可能是感音神性聋尤其是老年性聋重要的发病机制之一。课题组既往研究发现Dynamin1蛋白是维持突触囊泡内吞的关键蛋白,并受到miR-30b和miR-140的调控;同时Dynamin1及miR-30b和miR-140在不同年龄段内耳差异表达。即Dynamin1在老年鼠表达下降,miR-30b和miR-140在老年鼠表达上调。但Dynamin蛋白更深入的调控机制及其他参与突触调控的基因尚不清楚。竞争性内源RNA（competing endogenous RNA,ceRNA）指lncRNA...
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
样品测序质量评估2.3.3成年鼠与老年鼠差异表达分析
陆军军医大学硕士学位论文15计有335个节点分子，2595条ceRNA网络关系（图2）。其中红色节点代表上调，蓝色代表下调；红色线条代表正向关系，蓝色代表负向关系，灰色代表miRNA调控其它分子；圆点节点代表mRNA分子，圆点加外圈黄色代表lncRNA分子，三角形代表miRNA分子。图形整体结构：1号区域是mRNA，2号区域是lncRNA，1、2号区域总体受到miR-30b-3p的调控(都是miR-30b的靶向分子)；3号区域是mRNA，4号区域是lncRNA，3、4号区域总体受到miR-140-3p的调控(都是miR-140b的靶向分子)。图2Dnm1，miR-140、miR-30b与差异RNA共表达CeRNA网络图以Dnm1，miR-140、miR-30b为核心构建的ceRNA网络图：筛选阈值高于0.9且与Dnm1，miR-30b及miR-140有共表达关系的RNA分子为：Gm10684，2900079G21Rik，1700036A12Rik，B830012L14Rik，Gm11815，Gm19967。详细调控关系见图3。
陆军军医大学硕士学位论文16图3Dnm1、miR-30b及miR-140ceRNA网络图（阈值＞0.9）2.4讨论内吞作用(endocytosis)即胞吞，是通过包围细胞外物质形成内吞泡，随后脱离质膜进入细胞内的过程。突触将信号从感觉细胞或者神经元传递至其他神经元或者不同的靶细胞是通过释放神经递质实现的，而神经递质释放是在突触前膜活性域进行的，每个内毛细胞含有5-30个活性域，其数目因物种及部位不同有差异。内毛细胞是耳蜗内主要的听觉感受细胞，与外毛细胞分别受不同的螺旋神经元(spiralganglionNeuron，SGN)支配[23],每一个Ⅰ型螺旋神经元发出一条无髓鞘、无突起的神经突与单个内毛细胞形成突触连接，因在透射镜下呈带状排列，故称为带状突触（ribbonsynapse）[24]。CME是突触前膜主要的胞吞方式之一[25]。在这个过程中，Dynamin蛋白可使网格蛋白包被小窝与质膜分开[8]。为深入研究Dnm1在内耳的功能及其调控机制，我们采用转录组测序技术，寻找可能参与Dnm1，miR-30b，miR-140调控的lncRNA。转录组测序技术的迅速发展使得转录组学研究取得了空前的突破，用于发现和表征各种新的RNA分子，包括microRNAs，内源性siRNAs，circRNAs及lncRNA[8]。从结构上看，lncRNA与mRNA非常相似，具有剪接、聚腺苷酸化和帽状结构，但是它们不是编码RNA，不能翻译成蛋白质。越来越多的研究表明lncRNA与多种器官及疾病如心脏[27]和眼睛[28]，癌症[29]等有关，在细胞发育、分化、增殖、迁移、转移等多种生理过程中发挥重要作用[30]。lncRNA对神经系统的影响也得到了广泛的研究，lncRNA在发育阶段和成年的大脑中高表达，可影响神经系统发育过程，如神经发生、突触发生、细胞迁移、细胞类型分化、神经突生长、突触可塑性等[31]。在时空上，lncRNA在特定位点(
【参考文献】：
期刊论文
[1]老年性聋小鼠耳蜗带状突触损伤特点及机制研究[J]. 魏薇,杨丽辉,熊伟,柳柯,马秀岚,龚树生,杜政德. 中华耳科学杂志. 2019(02)
[2]耳蜗毛细胞miR-30b对Dynamin基因靶向调控的研究[J]. 李洋,唐小林,余菲,李华君,袁伟. 四川大学学报(医学版). 2018(03)
[3]miR-140在内耳毛细胞中的表达及其对突触蛋白Dynamin-1的调控作用[J]. 唐小林,李洋,余菲,贾立峰,李华君,袁伟. 第三军医大学学报. 2018(11)
[4]衔接蛋白AP-2在不同发育时期小鼠耳蜗毛细胞中的表达[J]. 顾翔,陈知己,蔡婷,宋锐,周小清,袁伟. 听力学及言语疾病杂志. 2015(06)
[5]microRNAs and ceRNAs: RNA networks in pathogenesis of cancer[J]. Xiangqian Su,Jiadi Xing,Zaozao Wang,Lei Chen,Ming Cui,Beihai Jiang. Chinese Journal of Cancer Research. 2013(02)
[6]KCNQ2/3钾通道电流特征及M1受体的调节作用[J]. 贾庆忠,贾占峰,张英俊,刘伯一,张海林. 中国药理学通报. 2005(10)
本文编号：3629844
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
样品测序质量评估2.3.3成年鼠与老年鼠差异表达分析
陆军军医大学硕士学位论文15计有335个节点分子，2595条ceRNA网络关系（图2）。其中红色节点代表上调，蓝色代表下调；红色线条代表正向关系，蓝色代表负向关系，灰色代表miRNA调控其它分子；圆点节点代表mRNA分子，圆点加外圈黄色代表lncRNA分子，三角形代表miRNA分子。图形整体结构：1号区域是mRNA，2号区域是lncRNA，1、2号区域总体受到miR-30b-3p的调控(都是miR-30b的靶向分子)；3号区域是mRNA，4号区域是lncRNA，3、4号区域总体受到miR-140-3p的调控(都是miR-140b的靶向分子)。图2Dnm1，miR-140、miR-30b与差异RNA共表达CeRNA网络图以Dnm1，miR-140、miR-30b为核心构建的ceRNA网络图：筛选阈值高于0.9且与Dnm1，miR-30b及miR-140有共表达关系的RNA分子为：Gm10684，2900079G21Rik，1700036A12Rik，B830012L14Rik，Gm11815，Gm19967。详细调控关系见图3。
陆军军医大学硕士学位论文16图3Dnm1、miR-30b及miR-140ceRNA网络图（阈值＞0.9）2.4讨论内吞作用(endocytosis)即胞吞，是通过包围细胞外物质形成内吞泡，随后脱离质膜进入细胞内的过程。突触将信号从感觉细胞或者神经元传递至其他神经元或者不同的靶细胞是通过释放神经递质实现的，而神经递质释放是在突触前膜活性域进行的，每个内毛细胞含有5-30个活性域，其数目因物种及部位不同有差异。内毛细胞是耳蜗内主要的听觉感受细胞，与外毛细胞分别受不同的螺旋神经元(spiralganglionNeuron，SGN)支配[23],每一个Ⅰ型螺旋神经元发出一条无髓鞘、无突起的神经突与单个内毛细胞形成突触连接，因在透射镜下呈带状排列，故称为带状突触（ribbonsynapse）[24]。CME是突触前膜主要的胞吞方式之一[25]。在这个过程中，Dynamin蛋白可使网格蛋白包被小窝与质膜分开[8]。为深入研究Dnm1在内耳的功能及其调控机制，我们采用转录组测序技术，寻找可能参与Dnm1，miR-30b，miR-140调控的lncRNA。转录组测序技术的迅速发展使得转录组学研究取得了空前的突破，用于发现和表征各种新的RNA分子，包括microRNAs，内源性siRNAs，circRNAs及lncRNA[8]。从结构上看，lncRNA与mRNA非常相似，具有剪接、聚腺苷酸化和帽状结构，但是它们不是编码RNA，不能翻译成蛋白质。越来越多的研究表明lncRNA与多种器官及疾病如心脏[27]和眼睛[28]，癌症[29]等有关，在细胞发育、分化、增殖、迁移、转移等多种生理过程中发挥重要作用[30]。lncRNA对神经系统的影响也得到了广泛的研究，lncRNA在发育阶段和成年的大脑中高表达，可影响神经系统发育过程，如神经发生、突触发生、细胞迁移、细胞类型分化、神经突生长、突触可塑性等[31]。在时空上，lncRNA在特定位点(
【参考文献】：
期刊论文
[1]老年性聋小鼠耳蜗带状突触损伤特点及机制研究[J]. 魏薇,杨丽辉,熊伟,柳柯,马秀岚,龚树生,杜政德. 中华耳科学杂志. 2019(02)
[2]耳蜗毛细胞miR-30b对Dynamin基因靶向调控的研究[J]. 李洋,唐小林,余菲,李华君,袁伟. 四川大学学报(医学版). 2018(03)
[3]miR-140在内耳毛细胞中的表达及其对突触蛋白Dynamin-1的调控作用[J]. 唐小林,李洋,余菲,贾立峰,李华君,袁伟. 第三军医大学学报. 2018(11)
[4]衔接蛋白AP-2在不同发育时期小鼠耳蜗毛细胞中的表达[J]. 顾翔,陈知己,蔡婷,宋锐,周小清,袁伟. 听力学及言语疾病杂志. 2015(06)
[5]microRNAs and ceRNAs: RNA networks in pathogenesis of cancer[J]. Xiangqian Su,Jiadi Xing,Zaozao Wang,Lei Chen,Ming Cui,Beihai Jiang. Chinese Journal of Cancer Research. 2013(02)
[6]KCNQ2/3钾通道电流特征及M1受体的调节作用[J]. 贾庆忠,贾占峰,张英俊,刘伯一,张海林. 中国药理学通报. 2005(10)
本文编号：3629844
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