CFI基因单核苷酸多态性与老年黄斑变性关联分析
本文关键词:CFI基因单核苷酸多态性与老年黄斑变性关联分析
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【摘要】:目的:补体系统Ⅰ(CFI)基因在欧洲,美国及日本人群已被证实与老年黄斑变性相关。本研究选用已经证实在不同人群及种族间与老年黄斑变性相关的SNP位点,验证其在中国汉族人群中与老年黄斑变性的相关性。方法:本研究搜集已明确诊断的四川地区384例汉族老年黄斑变性患者样本384例及384例相匹配的正常对照样本,采集外周静脉血提取基因组DNA,,通过SnaPshot单碱基末端延伸方法,检测所选取的CFI基因上rs13117504, rs10033900, rs6822976, rs7438961, rs7671905这5个SNP位点,采用病例对照研究方法对基因型检测数据在SPSS 19.0上进行统计学分析,并采用Haploview4.2进行各基因单核苷酸多态性连锁不平衡和单倍体分型分析,判断该基因相关SNPs与中国汉族人群老年黄斑变性关联性。结果:所选补体系统Ⅰ基因5个SNPs位点均符通过哈迪温伯格平衡(HWE:Hardy Weinberg Equilibrium)检验(P0.05)。rs13117504 G等位基因频率(P=0.037,OR=1.24, 95%CI:1.01-1.53), rs10033900 C等位基因频率(P=0.023,OR=1.27,95%CI: 1.03-1.57), rs10033900显性遗传模型AMD与对照组间分布频率差异具有统计学意义(P=0.039,OR=0.74,95%CI:0.55-0.99); rs6822976等位基因A分布频率病例组与对照组间(P=0.158),rs7438961等位基因G分布频率病例组与对照组间(P=0.798),rs7671905等位基因T分布频率病例组与对照组间(P=0.909)无统计学意义(P0.05);rs10033900隐性遗传模型AMD与对照组间分布频率差异无统计学意义(P=0.107),rs13117504, rs6822976, rs7438961, rs7671905显性及隐性遗传模型AMD与对照组间分布频率差异均无统计学意义(P0.05)。结论:本研究结果支持补体系统Ⅰ基因上游rs13117504与rs10033900SNP位点与中国汉族人群AMD发病相关联,而rs6822976, rs7438961, rs7671905位点与中国汉族人群老年黄斑变性无明显相关性。
【关键词】:老年黄斑变性(AMD) 补体因子I(CFI) 单核甘酸多态性(SNP)
【学位授予单位】:西南交通大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R774.5
【目录】:
- 摘要6-7
- Abstract7-8
- 英文缩写词表8-11
- 第一章 绪论11-21
- 1.1 老年黄斑变性相关易感基因研究综述11-19
- 1.1.1 老年黄斑变性现状11-12
- 1.1.2 老年黄斑变性分型12-13
- 1.1.3 老年黄斑变性影响因素13-14
- 1.1.4 老年黄斑变性相关易感基因14-17
- 1.1.5 研究技术介绍17-19
- 1.2 研究意义19
- 1.3 研究内容19-20
- 1.4 技术路线20
- 1.5 本研究关键问题20-21
- 第二章 CFI基因单核苷酸多态性与中国汉族人群老年黄斑变性相关性分析21-38
- 2.1 实验材料21-24
- 2.1.1 研究对象21
- 2.1.2 老年黄斑变性临床表现21
- 2.1.3 老年黄斑变性临床诊断标准21-22
- 2.1.4 研究对象纳入标准22
- 2.1.5 实验仪器22
- 2.1.6 实验试剂22-24
- 2.2 实验方法24-32
- 2.2.1 全血DNA提取24-25
- 2.2.2 基因组DNA含量和质量的测定25
- 2.2.3 检测数据统计学分析25
- 2.2.4 筛选SNPs位点25-27
- 2.2.5 候选位点引物设计及合成27-28
- 2.2.6 基因分型28-32
- 2.3 实验结果分析32-35
- 2.3.1 研究对象基本资料分析32-33
- 2.3.2 SNPs基因型及等位基因频率与老年黄斑变性相关性分析33-34
- 2.3.4 连锁不平衡和单倍体型相关性分析34-35
- 2.4 讨论35-36
- 2.5 结论36-38
- 第三章 论文总结38-40
- 致谢40-41
- 参考文献41-48
- 攻读硕士学位期间发表的学术论文48
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,本文编号:790775
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