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MMP-9单核苷酸基因多态性与原发性闭角型青光眼的关联研究

发布时间:2017-09-25 23:14

  本文关键词:MMP-9单核苷酸基因多态性与原发性闭角型青光眼的关联研究


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【摘要】:目的:基质金属蛋白酶-9(MMP-9)基因多态性与原发性闭角型青光眼(primary angle closure glaucoma,PACG)的关系在国内外研究中结论各异,本研究通过meta分析及川南地区汉族人群PACG的病例对照研究,探讨MMP-9 SNP位点rs 17576、rs17577与PACG的关系。方法:一、从中国生物医学文献数据库、中国期刊全文数据库、维普中文科技期刊全文数据库、万方科技期刊全文数据库及Pubmed、Ebsco、Ovid、Elsevier Science Direct、Cochrane Library数据库对国内外相关MMP-9基因多态性与PACG关系对文献进行检索,检索截止日期至2016年1月,纳入符合标准病例对照研究的文献进行Meta分析,运用R软件采用五种基因模型计算汇总合并优势比(odds ratio,OR)和95%可信区间(confidence interval,CI),探讨MMP-9 rs17576、rs17577与PACG的关系。二、选取在四川西南地区长期居住的无血缘关系的个体,均为汉族人,90例(男性23人,女性67人)确诊为PACG患者作为病例组,同期于我院体检中心检查的健康人及住院部的单纯年龄相关性白内障患者90例(男性42人,女性48人)作为正常对照组。抽取观察对象肘静脉血3ml,提取全血DNA,应用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)联合Taqman探针法对病例组、对照组对象的MMP-9 SNP位点rs 17576、rs17577进行基因分型,各位点基因型频率进行哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)检验,基因频率差异通过SPSS 22.0软件进行单因素卡方检验,计算判断组间差异,P0.05认为差异有统计学意义;基因型、等位基因与PACG的关联强度用OR值及其95%CI评价,均在五种不同遗传模型下计算,通过比较,探讨其与川南地区汉族人群PACG发病的关联性。结果:一、最终有7个独立研究纳入Meta分析,MMP-9 rs17576多态性在五种不同遗传模型下与PACG均未发现明显关联(G vs.A:OR=1.04,95%CI=0.61-1.78;GG+GA vs.AA:OR=0.76,95%CI=0.33-1.74;GG vs.GA+AA:OR=0.93,95%CI=0.59-1.48;GG vs.AA:OR=1.07,95%CI=0.67-1.70;GA vs.AA:OR=0.94,95%CI=0.77-1.14);MMP-9 rs17577多态性在五种遗传模型下与PACG也未提示明显关联(G vs.A:OR=0.77,95%CI=0.58-1.02;GG+GA vs.AA:OR=0.59,95%CI=0.24-1.47;GG vs.GA+AA:OR=1.30,95%CI=0.95-1.78;GG vs.AA:OR=0.77,95%CI=0.56-1.05;GA vs.AA:OR=1.24,95%CI=0.90-1.71)。二、最终实际检测病例组89例、对照组90例对象rs17576、rs17577的基因分型。rs17576病例组的GG、GA、AA三种基因型人数分别是53(59.6%)人、27(30.3%)人和9(10.1%)人,对应的正常对照组三种基因型人数分别是50(6.2%)人、32(36.0%)人和7(7.9%)人;rs17577病例组的GG、GA、AA三种基因型人数分别是65(73.0%)人、21(23.6%)人和3(3.4%)人,对应的正常对照组三种基因型人数分别是74(82.2%)人、13(14.4%)人和3(3.3%)人。病例组、对照组基因频率经检验均符合HWE(P0.05)。经检验分别在等位基因遗传模型、显性遗传模型、隐性遗传模型、纯合子遗传模型和杂合子遗传模型下均没有发现与本次纳入的川南汉族人PACG发病有明显关联性(P0.05)。结论:一、Meta分析结果提示MMP-9 rs17576、rs17577位点单核苷酸基因多态性与PACG发病没有明显相关性,需要进行更大的样本量、更多的临床研究,进一步全面阐释两者关系。二、川南地区汉族人群中女性原发性闭角型青光眼的发病率较男性高。三、MMP-9 rs17576和rs17577的多态性在川南地区汉族人群中原发性闭角型青光眼患者与健康对照者之间没有明显差异,但由于样本量偏小,这两个位点是不是PACG的易感基因位点有待进一步研究。
【关键词】:基质金属蛋白酶-9 原发性闭角型青光眼 单核苷酸基因多态性 meta分析
【学位授予单位】:西南医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R775.2
【目录】:
  • 中文摘要4-7
  • 英文摘要7-10
  • 前言10-12
  • 第一部分 MMP-9 rs17576、rs17577与PACG相关性的Meta分析12-25
  • 材料与方法12-16
  • 结果16-25
  • 第二部分 川南汉族人PACG与MMP-9单核苷酸多态性的关联研究25-40
  • 材料与方法25-35
  • 结果35-40
  • 讨论40-46
  • 结论46-47
  • 参考文献47-53
  • 英汉缩略词对照表53-54
  • 致谢54-55
  • 综述 转化生长因子-β在青光眼性视神经损伤中的研究进展55-68
  • 参考文献62-68

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本文编号:920127

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